1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' |
...tcatttaaaccacttactatgctctacccctgagattgcatattattgctgcagtgtatattattatatgttcaacacaaactttgtggtttgtttgcagCCTGTGCTGACTGTTATGTACTTGGTGCAATACATGCCAACAATTGGTTATTGGCTAATGGACAAG
species | Zea mays |
transcript | GRMZM2G003692_T03 |
intron # | 6 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: CCATTGTTGCTGCTACTCATGGACTGAAAGAAGCATGGATATCATATCAG CCTGTGCTGACTGTTATGTACTTGGTGCAATACATGCCAACAATTGGTTATEST: gi|32919173|gb|CF023985.1|CF023985
genomic: CAATTGTTGCTGCTACTCATGGACTGAAAGAAGCATGGATATCATATCAGgtatatttca ... ttgtttgcagCCTGTGCTGACTGTTATGTACTTGGTGCAATACATGCCAACAATTGGTTAT
EST: CAATTGTTGCTGCTACTCATGGACTGAAAGAAGCATGGATATCATATCAG CCTGTGCTGACTGTTATGTACTTGGTGCAATACATGCCAACAATTGGTTATEST: gi|91875090|gb|EB405047.1|EB405047
genomic: CAATTGTTGCTGCTACTCATGGACTGAAAGAAGCATGGATATCATATCAGgtatatttca ... ttgtttgcagCCTGTGCTGACTGTTATGTACTTGGTGCAATACATGCCAACAATTGGTTAT
EST: CAATTGTTGCTGCTACTCATGGACTGAAAGAAGCATGGATATCATATCAG CCTGTGCTGACTGTTATGTACTTGGTGCAATACATGCCAACAATTGGTTATEST: gi|32919094|gb|CF023906.1|CF023906
genomic: CAATTGTTGCTGCTACTCATGGACTGAAAGAAGCATGGATATCATATCAGgtatatttca ... ttgtttgcagCCTGTGCTGACTGTTATGTACTTGGTGCAATACATGCCAACAATTGGTTAT
EST: CAATTGTTGCTGCTACTCATGGACTGAAAGAAGCATGGATATCATATCAG CCTGTGCTGACTGTTATGTACTTGGTGCAATACATGCCAACAATTGGTTATEST: gi|113703640|gb|EE681144.1|EE681144
genomic: CAATTGTTGCTGCTACTCATGGACTGAAAGAAGCATGGATATCATATCAGgtatatttca ... ttgtttgcagCCTGTGCTGACTGTTATGTACTTGGTGCAATACATGCCAACAATTGGTTAT
EST: CAATTGTTGCTGCTACTCATGGACTGAAAGAAGCATGGATATCATATCAG CCTGTGCTGACTGTTATGTACTTGGTGCAATACATGCCAACAATTGGTTATEST: gi|32940746|gb|CF045565.1|CF045565
genomic: CAATTGTTGCTGCTACTCATGGACTGAAAGAAGCATGGATATCATATCAGgtatatttca ... ttgtttgcagCCTGTGCTGACTGTTATGTACTTGGTGCAATACATGCCAACAATTGGTTAT
EST: CAATTGTTGTTGCTACTCATGGACTGAAAGAAGCATGGATATCATATCAG CCTGTGCTGACTGTTATGTEST: gi|88757473|gb|DY541614.1|DY541614
genomic: CAATTGTTGCTGCTACTCATGGACTGAAAGAAGCATGGATATCATATCAGgtatatttca ... ttgtttgcagCCTGTGCTGACTGTTATGT
EST: CAATTGTTGCTGCTACTCATGGACTGAAAGAAGCATGGATATCATATCAG CCTGTGCTGACTGTTATGTACTTGGTGCAATACATGCCAACAATTGGTTATEST: gi|32909212|gb|CF014024.1|CF014024
genomic: CAATTGTTGCTGCTACTCATGGACTGAAAGAAGCATGGATATCATATCAGgtatatttca ... ttgtttgcagCCTGTGCTGACTGTTATGTACTTGGTGCAATACATGCCAACAATTGGTTAT
EST: CAATTGTTGCTGCTACTCATGGACTGAAAGAAGCATGGATATCATATCAG CCTGTGCTGACTGTTATGTACTTGGTGCAATACATGCCAACAATTGGTTATEST: gi|88757474|gb|DY541615.1|DY541615
genomic: CAATTGTTGCTGCTACTCATGGACTGAAAGAAGCATGGATATCATATCAGgtatatttca ... ttgtttgcagCCTGTGCTGACTGTTATGTACTTGGTGCAATACATGCCAACAATTGGTTAT
EST: CAATTGTTGCTGCTACTCATGGACTGAAAGAAGCATGGATATCATATCAG CCTGTGCTGACTGTTATGTACTTGGTGCAATACATGCCAACAATTGGTTATEST: gi|6101980|gb|AW126450.1|AW126450
genomic: CAATTGTTGCTGCTACTCATGGACTGAAAGAAGCATGGATATCATATCAGgtatatttca ... ttgtttgcagCCTGTGCTGACTGTTATGTACTTGGTGCAATACATGCCAACAATTGGTTAT
EST: CAATTGTTGCTGCTACTCATGGACTGAAAGAAGCATGGATATCATATCAG CCTGTGCTGACTGTTATGTACTTGGTGCAATACATGCCAACAATTGGTTATEST: gi|37390564|gb|CF632514.1|CF632514
genomic: CAATTGTTGCTGCTACTCATGGACTGAAAGAAGCATGGATATCATATCAGgtatatttca ... ttgtttgcagCCTGTGCTGACTGTTATGTACTTGGTGCAATACATGCCAACAATTGGTTAT
EST: CAATTGTTGCTGCTACTCATGGACTGAAAGAAGCATGGATATCATATCAG CCTGTGCTGACTGTTATGTACTTGGTGCAATACATGCCAACAATTGGTTATEST: gi|31362808|gb|CD447165.1|CD447165
genomic: CAATTGTTGCTGCTACTCATGGACTGAAAGAAGCATGGATATCATATCAGgtatatttca ... ttgtttgcagCCTGTGCTGACTGTTATGTACTTGGTGCAATACATGCCAACAATTGGTTAT
EST: CAATTGTTGCTGCTACTCATGGACTGAAAGAAGCATGGATATCATATCAG CCTGTGCTGACTGTTATGTACTTGGTGCAATACATGCCAACAATTGGTTATEST: gi|32864068|gb|CF003750.1|CF003750
genomic: CAATTGTTGCTGCTACTCATGGACTGAAAGAAGCATGGATATCATATCAGgtatatttca ... ttgtttgcagCCTGTGCTGACTGTTATGTACTTGGTGCAATACATGCCAACAATTGGTTAT
EST: CAATTGTTGCTGCTACTCATGGACTGAAAGAAGCATGGATATCATATCAG CCTGTGCTGACTGTTATGTACTTGGTGCAATACATGCCAACAATTGGTTATEST: gi|31363218|gb|CD447575.1|CD447575
genomic: CAATTGTTGCTGCTACTCATGGACTGAAAGAAGCATGGATATCATATCAGgtatatttca ... ttgtttgcagCCTGTGCTGACTGTTATGTACTTGGTGCAATACATGCCAACAATTGGTTAT
EST: CAATTGTTGCTGCTACTCATGGACTGAAAGAAGCATGGATATCATATCAG CCTGTGCTGACTGTTATGTACTTGGTGCAATACATGCCAACAATTGGTTATEST: gi|32847718|gb|CD987399.1|CD987399
genomic: CAATTGTTGCTGCTACTCATGGACTGAAAGAAGCATGGATATCATATCAGgtatatttca ... ttgtttgcagCCTGTGCTGACTGTTATGTACTTGGTGCAATACATGCCAACAATTGGTTAT
EST: CAATTGTTGCTGCTACTCATGGACTGAAAGAAGCATGGATATCATATCAG CCTGTGCTGACTGTTATGTEST: gi|7227555|gb|AW566196.1|AW566196
genomic: CAATTGTTGCTGCTACTCATGGACTGAAAGAAGCATGGATATCATATCAGgtatatttca ... ttgtttgcagCCTGTGCTGACTGTTATGT
EST: GAAAGAAGCATGGATATCATATCAG CCTGTGCTGACTGTTATGTACTTGGTGCAATACATGCCAACAATTGGTTATEST: gi|6022668|gb|AW067596.1|AW067596
genomic: GAAAGAAGCATGGATATCATATCAGgtatatttca ... ttgtttgcagCCTGTGCTGACTGTTATGTACTTGGTGCAATACATGCCAACAATTGGTTAT
EST: CAATTGTTGCTGCTACTCATGGACTGAAAGAAGCATGGATATCATATCAG CCTGTGCTGACTGTTATGTACTTGGTGCAATACATGCCAACAATTGGTTATEST: gi|211078663|gb|FL128724.1|FL128724
genomic: CAATTGTTGCTGCTACTCATGGACTGAAAGAAGCATGGATATCATATCAGgtatatttca ... ttgtttgcagCCTGTGCTGACTGTTATGTACTTGGTGCAATACATGCCAACAATTGGTTAT
EST: CAATTGTTGCTGCTACTCATGGACTGAAAGAAGCATGGATATCATATCAG CCTGTGCTGACTGTTATGTACTTGGTGCAATACATGCCAACAATTGGTTATEST: gi|78021266|gb|DV489653.1|DV489653
genomic: CAATTGTTGCTGCTACTCATGGACTGAAAGAAGCATGGATATCATATCAGgtatatttca ... ttgtttgcagCCTGTGCTGACTGTTATGTACTTGGTGCAATACATGCCAACAATTGGTTAT
EST: CAATTGTTGCTGCTACTCATGGACTGAAAGAAGCATGGATATCATATCAG CCTGTGCTGACTGTTATGTACTTGGTGCAATACATGCCAACAATTGGTTATEST: gi|211495955|gb|FL480154.1|FL480154
genomic: CAATTGTTGCTGCTACTCATGGACTGAAAGAAGCATGGATATCATATCAGgtatatttca ... ttgtttgcagCCTGTGCTGACTGTTATGTACTTGGTGCAATACATGCCAACAATTGGTTAT
EST: CAATTGTTGCTGCTACTCATGGATTGAAAGAAGCATGGATATCATATCAG CCTGTGCTGACTGTTATGTACTTGGTGCAATACATGCCAACAATTGGTTATEST: gi|22935891|gb|BU572166.1|BU572166
genomic: CAATTGTTGCTGCTACTCATGGACTGAAAGAAGCATGGATATCATATCAGgtatatttca ... ttgtttgcagCCTGTGCTGACTGTTATGTACTTGGTGCAATACATGCCAACAATTGGTTAT
EST: GGATATCATATCAG CCTGTGCTGACTGTTATGTACTTGGTGCAATACATGCCCACAATTGGTTATEST: gi|32856553|gb|CD996234.1|CD996234
genomic: GGATATCATATCAGgtatatttca ... ttgtttgcagCCTGTGCTGACTGTTATGTACTTGGTGCAATACATGCCAACAATTGGTTAT
EST: GACTGAAAGAAGCATGGATATCATATCAG CCTGTGCTGACTGTTATGTACTTGGTGCAATACATGCCAACAATTGGTTATEST: gi|5915523|gb|AW053164.1|AW053164
genomic: GACTGAAAGAAGCATGGATATCATATCAGgtatatttca ... ttgtttgcagCCTGTGCTGACTGTTATGTACTTGGTGCAATACATGCCAACAATTGGTTAT
EST: CAATTGTTGCTGCTACTCATGGACTGAAAGAAGCATGGATATCATATCAG CCTGTGCTGACTGTTATGTACTTGGTGCAATACATGCCAACAATTGGTTATEST: gi|211078661|gb|FL128722.1|FL128722
genomic: CAATTGTTGCTGCTACTCATGGACTGAAAGAAGCATGGATATCATATCAGgtatatttca ... ttgtttgcagCCTGTGCTGACTGTTATGTACTTGGTGCAATACATGCCAACAATTGGTTAT
EST: CAATTGTTGCTGCTACTCATGGATTGAAAGAAGCATGGATATCATATCAG CCTGTGCTGACTGTTATGTACTTGGTGCAATACATGCCAACAATTGGTTATEST: gi|71767908|gb|DR965845.1|DR965845
genomic: CAATTGTTGCTGCTACTCATGGACTGAAAGAAGCATGGATATCATATCAGgtatatttca ... ttgtttgcagCCTGTGCTGACTGTTATGTACTTGGTGCAATACATGCCAACAATTGGTTAT
EST: CAATTGTTGCTGCTACTCATGGACTGAAAGAAGCATGGATATCATATCAG CCTGTGCTGACTGTTATGTACTTGGTGCAATACATGCCAACAATTGGTTATEST: gi|60353742|gb|DN220715.1|DN220715
genomic: CAATTGTTGCTGCTACTCATGGACTGAAAGAAGCATGGATATCATATCAGgtatatttca ... ttgtttgcagCCTGTGCTGACTGTTATGTACTTGGTGCAATACATGCCAACAATTGGTTAT
EST: CAATTGTTGCTGCTACTCATGGACTGAAAGAAGCATGGATATCATATCAG CCTGTGCTGACTGTTATGTACTTGGTGCAATACATGCCAACAATTGGTTAT
genomic: CAATTGTTGCTGCTACTCATGGACTGAAAGAAGCATGGATATCATATCAGgtatatttca ... ttgtttgcagCCTGTGCTGACTGTTATGTACTTGGTGCAATACATGCCAACAATTGGTTAT
ttgctgcagtgtatattattatatgttcaacacaaactttgtggtttgtttgcagCCTGTGCTGACTGTTATGTACTTGGTGCAATACATGCCAACAATTGGTTATTGGCTAATGGACAAG
tttgttt CT-rich tract
tgtatattattatatg TA-rich tract