1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' | 8 5' 3' |
gtcagaatgctttctacatgatttcagtaacatcttataatggagttatatcactcactgcatcggtgcccatttgctagGTTGCTGATTTTGGTCTTGCAAGGTTAGCTATGGATGCTTGCACTCATGTAACCACACGAGTGATGGGAACTTTCGG
species | Zea mays |
transcript | GRMZM5G872442_T02 |
intron # | 5 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: GGGATATAAAGTCCTCCAATATCTTGCTGGATAATAACTTTGAAGCACTG GTTGCTGATTTTGGTCTTGCAAGGTTAGCTATGGATGCTTGCACTCATGTAEST: gi|22520879|gb|BU079690.1|BU079690
genomic: GGGATATAAAGTCCTCCAATATCTTGCTGGATAATAACTTTGAAGCACTGgtcagaatgc ... catttgctagGTTGCTGATTTTGGTCTTGCAAGGTTAGCTATGGATGCTTGCACTCATGTA
EST: GGGATATAAAGTCCTCCAATATCTTGCTGGATAATAACTTTGAAGCACTG GTTGCTGATTTTGGTCTTGCAAGGTTAGCTATGGATGCTTGCACTCATGTAEST: gi|71432382|gb|DR813432.1|DR813432
genomic: GGGATATAAAGTCCTCCAATATCTTGCTGGATAATAACTTTGAAGCACTGgtcagaatgc ... catttgctagGTTGCTGATTTTGGTCTTGCAAGGTTAGCTATGGATGCTTGCACTCATGTA
EST: GGGATATAAAGTCCTCCAATATCTTGCTGGATAATAACTTTGAAGCACTG GTTGCTGATTTTGGTCTTGCAAGGTTAGCTATGGATGCTTGCACTCATGTAEST: gi|87156672|gb|DY401461.1|DY401461
genomic: GGGATATAAAGTCCTCCAATATCTTGCTGGATAATAACTTTGAAGCACTGgtcagaatgc ... catttgctagGTTGCTGATTTTGGTCTTGCAAGGTTAGCTATGGATGCTTGCACTCATGTA
EST: GGGATATAAAGTCCTCCAATATCTTGCTGGATAATAACTTTGAAGCACTG GTTGCTGATTTTGGTCTTGCAAGGTTAGCTATGGATGCTTGCACTCATGTA
genomic: GGGATATAAAGTCCTCCAATATCTTGCTGGATAATAACTTTGAAGCACTGgtcagaatgc ... catttgctagGTTGCTGATTTTGGTCTTGCAAGGTTAGCTATGGATGCTTGCACTCATGTA
agtaacatcttataatggagttatatcactcactgcatcggtgcccatttgctagGTTGCTGATTTTGGTCTTGCAAGGTTAGCTATGGATGCTTGCACTCATGTAACCACACGAGTGATGGGAACTTTCGG
cactcac putative branch site (score: 2)
cccattt putative PPT
atcttataat TA-rich tract