1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' | 8 5' 3' | 9 5' 3' | 10 5' 3' | 11 5' 3' | 12 5' 3' | 13 5' 3' | 14 5' 3' | 15 5' 3' | 16 5' 3' | 17 5' 3' | 18 5' 3' | 19 5' 3' | 20 5' 3' |
21 5' 3' |
gtaattcagtctcttacgtttctcagtgccttacttaagttttgtctggaatgatatgcaagagtatttattgatacgcatcagttatccgtgtttagGCTGCACAAGGGCTAAGAGAGGGTGTGCAAAAGCTCAAAGTCTTGCATGGTTCCGGTATCACTGCTCTGGATGAATTAGCAGGTGAAATCGACATGAACT
species | Zea mays |
transcript | GRMZM2G024576_T01 |
intron # | 13 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: TTAATGAAATGGAACATGATATGCAATCCTTTGTTTCTTCAAAAGATGAG GCTGCACAAGGGCTAAGAGAGGGTGTGCAAAAGCTCAAAGTCTTGCATGGTEST: gi|101391269|gb|EB817569.1|EB817569
genomic: TTAATGAAATGGAACATGATATGCAATCCTTTGTTTCTTCAAAAGATGAGgtaattcagt ... ccgtgtttagGCTGCACAAGGGCTAAGAGAGGGTGTGCAAAAGCTCAAAGTCTTGCATGGT
EST: TTAATGAAATGGAACATGATATGCAATCCTTTGTTTCTTCAAAAGATGAG GCTGCACAAGGGCTAAGAGAGGGTGTGCAAAAGCTCAAAGTCTTGCATGGTEST: gi|211222610|gb|FK991618.1|FK991618
genomic: TTAATGAAATGGAACATGATATGCAATCCTTTGTTTCTTCAAAAGATGAGgtaattcagt ... ccgtgtttagGCTGCACAAGGGCTAAGAGAGGGTGTGCAAAAGCTCAAAGTCTTGCATGGT
EST: TTAATGAAATGGAACATGATATGCAATCCTTTGTTTCTTCAAAAGATGAG GCTGCACAAGGGCTAAGAGAGGGTGTGCAAAAGCTCAAAGTCTTGCATGGT
genomic: TTAATGAAATGGAACATGATATGCAATCCTTTGTTTCTTCAAAAGATGAGgtaattcagt ... ccgtgtttagGCTGCACAAGGGCTAAGAGAGGGTGTGCAAAAGCTCAAAGTCTTGCATGGT
gtctggaatgatatgcaagagtatttattgatacgcatcagttatccgtgtttagGCTGCACAAGGGCTAAGAGAGGGTGTGCAAAAGCTCAAAGTCTTGCATGGTTCCGGTATCACTGCTCTGGATGAATTAGCAGGTGAAATCGACATGAACT
tattgat putative branch site (score: 3)
agtatttattgata TA-rich tract