1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' | 8 5' 3' | 9 5' 3' | 10 5' 3' | 11 5' 3' |
gtgaacaatttgcacagcaattttcagttttgcactttctgccaatatctggaaatgtgttttagttctgtgataaaactttgttcatttgacttattttcggttacagCCATTGTTTCCTGGAGAGAATGCAGTGGACCAGCTTGTTGAGATTATCAAG
species | Vitis vinifera |
transcript | Vv10s0003g01480.t01 |
intron # | 7 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: TTGATATATGGTCAGCTGGTTGTGTCCTAGCTGAGCTTCTTCTAGGCCAG CCATTGTTTCCTGGAGAGAATGCAGTGGACCAGCTTGTTGAGATTATCAAGEST: gi|349821008|gb|FQ404261.1|FQ404261
genomic: TTGATATATGGTCAGCTGGTTGTGTCCTAGCTGAGCTTCTTCTAGGCCAGgtgaacaatt ... tcggttacagCCATTGTTTCCTGGAGAGAATGCAGTGGACCAGCTTGTTGAGATTATCAAG
EST: TTGATATATGGTCAGCTGGTTGTGTCCTAGCTGAGCTTCTTCTAGGCCAG CCATTGTTTCCTGGAGAGAATGCAGTGGACCAGCTTGTTGAGATTATCAAGEST: gi|110370230|gb|EC929161.1|EC929161
genomic: TTGATATATGGTCAGCTGGTTGTGTCCTAGCTGAGCTTCTTCTAGGCCAGgtgaacaatt ... tcggttacagCCATTGTTTCCTGGAGAGAATGCAGTGGACCAGCTTGTTGAGATTATCAAG
EST: TTGATATATGGTCAGCTGGTTGTGTCCTAGCTGAGCTTTTTCTAGGCCAG CCATTGTTTCCTGGAGAGAATGCAGTGGACCAGCTTGTTGAGATTATCAAGEST: gi|349822004|gb|FQ408333.1|FQ408333
genomic: TTGATATATGGTCAGCTGGTTGTGTCCTAGCTGAGCTTCTTCTAGGCCAGgtgaacaatt ... tcggttacagCCATTGTTTCCTGGAGAGAATGCAGTGGACCAGCTTGTTGAGATTATCAAG
EST: TTGATATATGGTCAGCTGGTTGTGTCCTAGCTGAGCTTCTTCTAGGCCAG CCATTGTTTCCTGGAGAGAATGCAGTGGACCAGCTTGTTGAGATTATCAAGEST: gi|110716958|gb|EE092396.1|EE092396
genomic: TTGATATATGGTCAGCTGGTTGTGTCCTAGCTGAGCTTCTTCTAGGCCAGgtgaacaatt ... tcggttacagCCATTGTTTCCTGGAGAGAATGCAGTGGACCAGCTTGTTGAGATTATCAAG
EST: TTGATATATGGTCAGCTGGTTGTGTCCTAGCTGAGCTTCTTCTAGGCCAG CCATTGTTTCCTGGAGAGAATGCAGTGGACCAGCTTGTTGAGATTATCAAGEST: gi|30255733|gb|CB971865.1|CB971865
genomic: TTGATATATGGTCAGCTGGTTGTGTCCTAGCTGAGCTTCTTCTAGGCCAGgtgaacaatt ... tcggttacagCCATTGTTTCCTGGAGAGAATGCAGTGGACCAGCTTGTTGAGATTATCAAG
EST: TTGATATATGGTCAGCTGGTTGTGTCCTAGCTGAGCTTCTTCTAGGCCAG CCATTGTTTCCTGGAGAGAATGCAGTGGACCAGCTTGTTGAGATTATCAAGEST: gi|349814529|gb|FQ399169.1|FQ399169
genomic: TTGATATATGGTCAGCTGGTTGTGTCCTAGCTGAGCTTCTTCTAGGCCAGgtgaacaatt ... tcggttacagCCATTGTTTCCTGGAGAGAATGCAGTGGACCAGCTTGTTGAGATTATCAAG
EST: TTGATATATGGTCAGCTGGTTGTGTCCTAGCTGAGCTTCTTCTAGGCCAG CCATTGTTTCCTGGAGAGAATGCAGTGGACCAGCTTGTTGAGATTATCAAGEST: gi|349813455|gb|FQ413689.1|FQ413689
genomic: TTGATATATGGTCAGCTGGTTGTGTCCTAGCTGAGCTTCTTCTAGGCCAGgtgaacaatt ... tcggttacagCCATTGTTTCCTGGAGAGAATGCAGTGGACCAGCTTGTTGAGATTATCAAG
EST: TTGATATATGGTCAGCTGGTTGTGTCCTAGCTGAGCTTCTTCTAGGCCAG CCATTGTTTCCTGGAGAGAATGCAGTGGACCAGCTTGTTGAGATTATCAAGEST: gi|352786166|gb|FQ478777.1|FQ478777
genomic: TTGATATATGGTCAGCTGGTTGTGTCCTAGCTGAGCTTCTTCTAGGCCAGgtgaacaatt ... tcggttacagCCATTGTTTCCTGGAGAGAATGCAGTGGACCAGCTTGTTGAGATTATCAAG
EST: TTGATATATGGTCAGCTGGTTGTGTCCTAGCTGAGCTTCTTCTAGGCCAG CCATTGTTTCCTGGAGAGAATGCAGTGGACCAGCTTGTTGAGATTATCAAGEST: gi|349820741|gb|FQ408570.1|FQ408570
genomic: TTGATATATGGTCAGCTGGTTGTGTCCTAGCTGAGCTTCTTCTAGGCCAGgtgaacaatt ... tcggttacagCCATTGTTTCCTGGAGAGAATGCAGTGGACCAGCTTGTTGAGATTATCAAG
EST: TTGATATATGGTCAGCTGGTTGTGTCCTAGCTGGGCTTCTTCTAGGCCAG CCATTGTTTCCTGGAGAGAATGCAGTGGACCAGCTTGTTGAGATTATCAAGEST: gi|349819490|gb|FQ413374.1|FQ413374
genomic: TTGATATATGGTCAGCTGGTTGTGTCCTAGCTGAGCTTCTTCTAGGCCAGgtgaacaatt ... tcggttacagCCATTGTTTCCTGGAGAGAATGCAGTGGACCAGCTTGTTGAGATTATCAAG
EST: TTGATATATGGTCAGCTGGTTGTGTCCTAGCTGAGCTTCTTCTAGGCCAG CCATTGTTTCCTGGAGAGAATGCAGTGGACCAGCTTGTTGAGATTATCAAGEST: gi|351041679|gb|FQ455889.1|FQ455889
genomic: TTGATATATGGTCAGCTGGTTGTGTCCTAGCTGAGCTTCTTCTAGGCCAGgtgaacaatt ... tcggttacagCCATTGTTTCCTGGAGAGAATGCAGTGGACCAGCTTGTTGAGATTATCAAG
EST: TTGATATATGGTCAGCTGGTTGTGTCCTAGCTGAGCTTCTTCTAGGCCAG CCATTGTTTCCTGGAGAGAATGCAGTGGACCAGCTTGTTGAGATTATCAAGEST: gi|349812888|gb|FQ410530.1|FQ410530
genomic: TTGATATATGGTCAGCTGGTTGTGTCCTAGCTGAGCTTCTTCTAGGCCAGgtgaacaatt ... tcggttacagCCATTGTTTCCTGGAGAGAATGCAGTGGACCAGCTTGTTGAGATTATCAAG
EST: TTGATATATGGTCAGCTGGTTGTGTCCTAGCTGAGCTTCTTCTAGGCCAG CCATTGTTTCCTGGAGAGAATGCAGTGGACCAGCTTGTTGAGATTATCAAGEST: gi|349818025|gb|FQ408014.1|FQ408014
genomic: TTGATATATGGTCAGCTGGTTGTGTCCTAGCTGAGCTTCTTCTAGGCCAGgtgaacaatt ... tcggttacagCCATTGTTTCCTGGAGAGAATGCAGTGGACCAGCTTGTTGAGATTATCAAG
EST: TTGATATATGGTCAGCTGGTTGTGTCCTACCTGAGCTTCTTCTAGGCCAG CCATTGTTTCCTGGAGAGAATGCAGTGGACCAGCTTGTTGAGATTATCAAGEST: gi|351045211|gb|FQ451659.1|FQ451659
genomic: TTGATATATGGTCAGCTGGTTGTGTCCTAGCTGAGCTTCTTCTAGGCCAGgtgaacaatt ... tcggttacagCCATTGTTTCCTGGAGAGAATGCAGTGGACCAGCTTGTTGAGATTATCAAG
EST: TTGATATGTGGTCAGCTGGTTGTGTCCTAGCTGAGCTTCTTCTAGGCCAG CCATTGTTTCCTGGAGAGAATGCAGTGGACCAGCTTGTTGAGATTATCAAGEST: gi|349808118|gb|FQ403305.1|FQ403305
genomic: TTGATATATGGTCAGCTGGTTGTGTCCTAGCTGAGCTTCTTCTAGGCCAGgtgaacaatt ... tcggttacagCCATTGTTTCCTGGAGAGAATGCAGTGGACCAGCTTGTTGAGATTATCAAG
EST: TTGATATATGGTCAGCTGGTTGTGTCCTAGCTGAGCTTCTTCTAGGCCAG CCATTGTTTCCTGGAGAGAATGCAGTGGACCAGCTTGTTGAGATTATCAAGEST: gi|30136670|gb|CB922008.1|CB922008
genomic: TTGATATATGGTCAGCTGGTTGTGTCCTAGCTGAGCTTCTTCTAGGCCAGgtgaacaatt ... tcggttacagCCATTGTTTCCTGGAGAGAATGCAGTGGACCAGCTTGTTGAGATTATCAAG
EST: TTGATATATGGTCAGCTGGTTGTGTCCTAGCTGAGCTTCTTCTAGGCCAG CCATTGTTTCCTGGAGAGAATGCAGTGGACCAGCTTGTTGAGATTATCAAGEST: gi|349818252|gb|FQ409027.1|FQ409027
genomic: TTGATATATGGTCAGCTGGTTGTGTCCTAGCTGAGCTTCTTCTAGGCCAGgtgaacaatt ... tcggttacagCCATTGTTTCCTGGAGAGAATGCAGTGGACCAGCTTGTTGAGATTATCAAG
EST: TTGATATATGGTCAGCTGGTTGTGTCCTAGCTGAGCTTCTTCTAGGCCAG CCATTGTTTCCTGGAGAGAATGCAGTGGACCAGCTTGTTGAGATTATCAAGEST: gi|349819219|gb|FQ412113.1|FQ412113
genomic: TTGATATATGGTCAGCTGGTTGTGTCCTAGCTGAGCTTCTTCTAGGCCAGgtgaacaatt ... tcggttacagCCATTGTTTCCTGGAGAGAATGCAGTGGACCAGCTTGTTGAGATTATCAAG
EST: TTGATATATGGTCAGCTGGTTGTGTCCTAGCTGAGCTTCTTCTAGGCCAG CCATTGTTTCCTGGAGAGAATGCAGTGGACCAGCTTGTTGAGATTATCAAGEST: gi|349809698|gb|FQ398305.1|FQ398305
genomic: TTGATATATGGTCAGCTGGTTGTGTCCTAGCTGAGCTTCTTCTAGGCCAGgtgaacaatt ... tcggttacagCCATTGTTTCCTGGAGAGAATGCAGTGGACCAGCTTGTTGAGATTATCAAG
EST: TTGATATATGGTCAGCTGGTTGTGTCCTAGCTGAGCTTCTTCTAGGCCAG CCATTGTTTCCTGGAGAGAATGCAGTGGACCAGCTTGTTGAGATTATCAAGEST: gi|349820687|gb|FQ408516.1|FQ408516
genomic: TTGATATATGGTCAGCTGGTTGTGTCCTAGCTGAGCTTCTTCTAGGCCAGgtgaacaatt ... tcggttacagCCATTGTTTCCTGGAGAGAATGCAGTGGACCAGCTTGTTGAGATTATCAAG
EST: TTGATATATGGTCAGCTGGTTGTGTCCTAGCTGAGCTTCTTCTAGGCCAG CCATTGTTTCCTGGAGAGAATGCAGTGGACCAGCTTGTTGAGATTATCAAGEST: gi|349823319|gb|FQ402518.1|FQ402518
genomic: TTGATATATGGTCAGCTGGTTGTGTCCTAGCTGAGCTTCTTCTAGGCCAGgtgaacaatt ... tcggttacagCCATTGTTTCCTGGAGAGAATGCAGTGGACCAGCTTGTTGAGATTATCAAG
EST: TTGATATATGGTCAGCTGGTTGTGTCCTAGCTGAGCTTCTTCTAGGCCAG CCATTGTTTCCTGGAGAGAATGCAGTGGACCAGCTTGTTGAGATTATCAAGEST: gi|349811905|gb|FQ410702.1|FQ410702
genomic: TTGATATATGGTCAGCTGGTTGTGTCCTAGCTGAGCTTCTTCTAGGCCAGgtgaacaatt ... tcggttacagCCATTGTTTCCTGGAGAGAATGCAGTGGACCAGCTTGTTGAGATTATCAAG
EST: TTGATATATGGTCAGCTGGTTGTGTCCTAGCTGAGCTTCTTCTAGGCCAG CCATTGTTTCCTGGAGAGAATGCAGTGGACCAGCTTGTTGAGATTATCAAGEST: gi|349815183|gb|FQ400338.1|FQ400338
genomic: TTGATATATGGTCAGCTGGTTGTGTCCTAGCTGAGCTTCTTCTAGGCCAGgtgaacaatt ... tcggttacagCCATTGTTTCCTGGAGAGAATGCAGTGGACCAGCTTGTTGAGATTATCAAG
EST: TTGATATATGGTCAGCTGGTTGTGTCCTAGCTGAGCTTCTTCTAGGCCAG CCATTGTTTCCCGGAGAGAATGCAGTGGACCAGCTTGTTGAGATTATCAAGEST: gi|349820958|gb|FQ408666.1|FQ408666
genomic: TTGATATATGGTCAGCTGGTTGTGTCCTAGCTGAGCTTCTTCTAGGCCAGgtgaacaatt ... tcggttacagCCATTGTTTCCTGGAGAGAATGCAGTGGACCAGCTTGTTGAGATTATCAAG
EST: TTGATATATGGTCAGCTGGTTGTGTCCTAGCTGAGCTTCTTCTAGGCCAG CCATTGTTTCCTGGAGAGAATGCAGTGGACCAGCTTGTTGAGATTATCAAGEST: gi|351015241|gb|FQ445525.1|FQ445525
genomic: TTGATATATGGTCAGCTGGTTGTGTCCTAGCTGAGCTTCTTCTAGGCCAGgtgaacaatt ... tcggttacagCCATTGTTTCCTGGAGAGAATGCAGTGGACCAGCTTGTTGAGATTATCAAG
EST: TTGATATATGGTCAGCTGGTTGTGTCCTAGCTGAGCTTCTTCTAGGCCAG CCATTGTTTCCTGGAGAGAATGCAGTGGACCAGCTTGTTGAGATTATCAAGEST: gi|349814811|gb|FQ410034.1|FQ410034
genomic: TTGATATATGGTCAGCTGGTTGTGTCCTAGCTGAGCTTCTTCTAGGCCAGgtgaacaatt ... tcggttacagCCATTGTTTCCTGGAGAGAATGCAGTGGACCAGCTTGTTGAGATTATCAAG
EST: TTGATATATGGTCAGCTGGTTGTGTCCTAGCTGAGCTTCTTCTAGGCCAG CCATTGTTTCCTGGAGAGAATGCAGTGGACCAGCTTGTTGAGATTATCAAGEST: gi|110727667|gb|EE104690.1|EE104690
genomic: TTGATATATGGTCAGCTGGTTGTGTCCTAGCTGAGCTTCTTCTAGGCCAGgtgaacaatt ... tcggttacagCCATTGTTTCCTGGAGAGAATGCAGTGGACCAGCTTGTTGAGATTATCAAG
EST: TTGATATATGGTCAGCTGGTTGTGTCCTAGCTGAGCTTCTTCTAGGCCAG CCATTGTTTCCTGGAGAGAATGCAGTGGACCAGCTTGTTGAGATTATCAAGEST: gi|349819618|gb|FQ413502.1|FQ413502
genomic: TTGATATATGGTCAGCTGGTTGTGTCCTAGCTGAGCTTCTTCTAGGCCAGgtgaacaatt ... tcggttacagCCATTGTTTCCTGGAGAGAATGCAGTGGACCAGCTTGTTGAGATTATCAAG
EST: TTGATATATGGTCAGCTGGTTGTGTCCTAGCTGAGCTTCTTCTAGGCCAG CCATTGTTTCCTGGAGAGAATGCAGTGGACCAGCTTGTTGAGATTATCAAGEST: gi|349820569|gb|FQ404064.1|FQ404064
genomic: TTGATATATGGTCAGCTGGTTGTGTCCTAGCTGAGCTTCTTCTAGGCCAGgtgaacaatt ... tcggttacagCCATTGTTTCCTGGAGAGAATGCAGTGGACCAGCTTGTTGAGATTATCAAG
EST: TTGATATATGGTCAGCTGGTTGTGTCCTAGCTGAGCTTCTTCTAGGCCAG CCATTGTTTCCTGGAGAGAATGCAGTGGACCAGCTTGTTGAGATTATCAAGEST: gi|351045218|gb|FQ451666.1|FQ451666
genomic: TTGATATATGGTCAGCTGGTTGTGTCCTAGCTGAGCTTCTTCTAGGCCAGgtgaacaatt ... tcggttacagCCATTGTTTCCTGGAGAGAATGCAGTGGACCAGCTTGTTGAGATTATCAAG
EST: TTGATATGTGGTCAGCTGGTTGTGTCCTAGCTGAGCTTCTTCTAGGCCAG CCATTGTTTCCTGGAGAGAATGCAGTGGACCAGCTTGTTGAGATTATCAAGEST: gi|110726198|gb|EE101771.1|EE101771
genomic: TTGATATATGGTCAGCTGGTTGTGTCCTAGCTGAGCTTCTTCTAGGCCAGgtgaacaatt ... tcggttacagCCATTGTTTCCTGGAGAGAATGCAGTGGACCAGCTTGTTGAGATTATCAAG
EST: TTGATATATGGTCAGCTGGTTGTGTCCTAGCTGAACTTCTTCTAAGCCAG CCATTGTTTCCTGGAGAGAATGCAGTGGACCAGCTTGTTGAGATTATCAAGEST: gi|349812635|gb|FQ409794.1|FQ409794
genomic: TTGATATATGGTCAGCTGGTTGTGTCCTAGCTGAGCTTCTTCTAGGCCAGgtgaacaatt ... tcggttacagCCATTGTTTCCTGGAGAGAATGCAGTGGACCAGCTTGTTGAGATTATCAAG
EST: TTGATATATGGTCAGCTGGTTGTGTCCTAGCTGAGCTTCTTCTAGGCCAG CCATTGTTTCCTGGAGAGAATGCAGTGGACCAGCTTGTTGAGATTATCAAGEST: gi|351046670|gb|FQ453286.1|FQ453286
genomic: TTGATATATGGTCAGCTGGTTGTGTCCTAGCTGAGCTTCTTCTAGGCCAGgtgaacaatt ... tcggttacagCCATTGTTTCCTGGAGAGAATGCAGTGGACCAGCTTGTTGAGATTATCAAG
EST: TTGATATATGGTCAGCTGGTTGTGTCCTAGCTGAGCTTCTTCTAGGCCAG CCATTGTTTCCTGGAGAGAATGCAGTGGACCAGCTTGTTGAGATTATCAAGEST: gi|349820534|gb|FQ404029.1|FQ404029
genomic: TTGATATATGGTCAGCTGGTTGTGTCCTAGCTGAGCTTCTTCTAGGCCAGgtgaacaatt ... tcggttacagCCATTGTTTCCTGGAGAGAATGCAGTGGACCAGCTTGTTGAGATTATCAAG
EST: TTGATATATGGTCAGCTGGTTGTGTCCTAGCTGAGCTTCTTCTAGGCCAG CCATTGTTTCCTGGAGAGAATGCAGTGGACCAGCTTGTTGAGATTATCAAGEST: gi|349827560|gb|FQ422428.1|FQ422428
genomic: TTGATATATGGTCAGCTGGTTGTGTCCTAGCTGAGCTTCTTCTAGGCCAGgtgaacaatt ... tcggttacagCCATTGTTTCCTGGAGAGAATGCAGTGGACCAGCTTGTTGAGATTATCAAG
EST: TTGATATATGGTCAGCTGGTTGTGTCCTAGCTGAGCTTCTTCTAGGCCAG CCATTGTTTCCTGGAGAGAATGCAGTGGACCAGCTTGTTGAGATTATCAAGEST: gi|110699277|gb|EE076136.1|EE076136
genomic: TTGATATATGGTCAGCTGGTTGTGTCCTAGCTGAGCTTCTTCTAGGCCAGgtgaacaatt ... tcggttacagCCATTGTTTCCTGGAGAGAATGCAGTGGACCAGCTTGTTGAGATTATCAAG
EST: TTGATATATGGTCAGCTGGTTGTGTCCTAGCTGAGCTTCTTCTAGGCCAG CCATTGTTTCCCTGGAGAGAATGCAGTGGACCAGCCTTGTTGAGATTATCAEST: gi|349820352|gb|FQ403968.1|FQ403968
genomic: TTGATATATGGTCAGCTGGTTGTGTCCTAGCTGAGCTTCTTCTAGGCCAGgtgaacaatt ... tcggttacagCCATTGTTTCC-TGGAGAGAATGCAGTGGACCAGC-TTGTTGAGATTATCA
EST: TTGATATATGGTCAGCTGGTTGTGTCCTAGCTGAGCTTCTTCTAGGCCAG CCATTGTTTCCTGGAGAGAATGCAGTGGACCAGCTTGTTGAGATTATCAAGEST: gi|352790221|gb|FQ481420.1|FQ481420
genomic: TTGATATATGGTCAGCTGGTTGTGTCCTAGCTGAGCTTCTTCTAGGCCAGgtgaacaatt ... tcggttacagCCATTGTTTCCTGGAGAGAATGCAGTGGACCAGCTTGTTGAGATTATCAAG
EST: TTGATATATGGTCAGCTGGTTGTGTCCTAGCTGAGCTTCTTCTAGGCCAG CCATTGTTTCCTGGAGAGAATGCAGTGGACCAGCTTGTTGAGATTATCAAGEST: gi|351023667|gb|FQ448218.1|FQ448218
genomic: TTGATATATGGTCAGCTGGTTGTGTCCTAGCTGAGCTTCTTCTAGGCCAGgtgaacaatt ... tcggttacagCCATTGTTTCCTGGAGAGAATGCAGTGGACCAGCTTGTTGAGATTATCAAG
EST: TTGATATATGGTCAGCTGGTTGTGTCCTAGCTGAGCTTCTTCTAGGCCAG CCATTGTTTCCTGGAGAGAATGCAGTGGACCAGCTTGTTGAGATTATCAAGEST: gi|110391404|gb|EC956378.1|EC956378
genomic: TTGATATATGGTCAGCTGGTTGTGTCCTAGCTGAGCTTCTTCTAGGCCAGgtgaacaatt ... tcggttacagCCATTGTTTCCTGGAGAGAATGCAGTGGACCAGCTTGTTGAGATTATCAAG
EST: TTGATATATGGTCAGCTGGTTGTGTCCTAGCTGAGCTTCTTCTAGGCCAG CCATTGTTTCCTGGAGAGAATGCAGTGGACCAGCTTGTTGAGATTATCAEST: gi|110699260|gb|EE076105.1|EE076105
genomic: TTGATATATGGTCAGCTGGTTGTGTCCTAGCTGAGCTTCTTCTAGGCCAGgtgaacaatt ... tcggttacagCCATTGTTTCCTGGAGAGAATGCAGTGGACCAGCTTGTTGAGATTATCA
EST: TTGATATATGGTCAGCTGGTTGTGTCCTAGCTGAGCTTCTTCTAGGCCAG CCATTGTTTCCTGGAGAGAATGCAGTGGACCAGCTTGTTGAGATTATCAAG
genomic: TTGATATATGGTCAGCTGGTTGTGTCCTAGCTGAGCTTCTTCTAGGCCAGgtgaacaatt ... tcggttacagCCATTGTTTCCTGGAGAGAATGCAGTGGACCAGCTTGTTGAGATTATCAAG
atgtgttttagttctgtgataaaactttgttcatttgacttattttcggttacagCCATTGTTTCCTGGAGAGAATGCAGTGGACCAGCTTGTTGAGATTATCAAG
atttgac putative branch site (score: 4)
cttattttc CT-rich tract
atttgacttatttt TA-rich tract
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| gtgaacaatttgcacagcaattttcagttttgcactttctgccaatatctggaaatgtgttttagttctgtgataaaactttgttcatttgacttattttcggttacagCCATTGTTTCCTGGAGAGAATGCAGTGGACCAGCTTGTTGAGATTATCAAG
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - TGGAGA
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - AGTGGA