1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' |
gtgagagtttaaatgctaagttgatgtaatttattatgttgggttgttcattgcattcatatacttaatgtgggattttggaaatctgaccatgacggcatgtgttaaatttcagGTCCGGATCAGTGTGTTTAGATGTTATCAACCAAACCTGGAGCCCTATGTTCG
species | Vitis vinifera |
transcript | Vv15s0046g02280.t01 |
intron # | 3 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: CCCTCAATTGGCTTTGTTAATAAGATCTACCACCCAAATGTTGATGAAAT GTCCGGATCAGTGTGTTTAGATGTTATCAACCAAACCTGGAGCCCTATGTTEST: gi|351029514|gb|FQ436908.1|FQ436908
genomic: CCCTCAATTGGCTTTGTTAATAAGATCTACCACCCAAATGTTGATGAAATgtgagagttt ... taaatttcagGTCCGGATCAGTGTGTTTAGATGTTATCAACCAAACCTGGAGCCCTATGTT
EST: CCCTCAATTGGCTTTGTTAATAAGATCTACCACCCAAATGTTGATGAAAT GTCCGGATCAGTGTGTTTAGATGTTATCAACCAAACCTGGAGCCCTATGTTEST: gi|46918632|gb|CN547961.1|CN547961
genomic: CCCTCAATTGGCTTTGTTAATAAGATCTACCACCCAAATGTTGATGAAATgtgagagttt ... taaatttcagGTCCGGATCAGTGTGTTTAGATGTTATCAACCAAACCTGGAGCCCTATGTT
EST: CCCTCAATTGGCTTTGTTAATAAGATCTACCACCCAAATGTTGATGAAAT GTCCGGATCAGTGTGTTTAGATGTTATCAACCAAACCTGGAGCCCTATGTTEST: gi|110420607|gb|EC986882.1|EC986882
genomic: CCCTCAATTGGCTTTGTTAATAAGATCTACCACCCAAATGTTGATGAAATgtgagagttt ... taaatttcagGTCCGGATCAGTGTGTTTAGATGTTATCAACCAAACCTGGAGCCCTATGTT
EST: CCCTCAATTGGCTTTGTTAATAAGATCTACCACCCAAATGTTGATGAAAT GTCCGGATCAGTGTGTTTAGATGTTATCAACCAAACCTGGAGCCCTATGTTEST: gi|34550367|gb|CF518585.1|CF518585
genomic: CCCTCAATTGGCTTTGTTAATAAGATCTACCACCCAAATGTTGATGAAATgtgagagttt ... taaatttcagGTCCGGATCAGTGTGTTTAGATGTTATCAACCAAACCTGGAGCCCTATGTT
EST: CCCTCAATTGGCTTTGTTAATAAGATCTACCACCCAAATGTTGATGAAAT GTCCGGATCAGTGTGTTTAGATGTTATCAACCAAACCTGGAGCCCTATGTTEST: gi|83274683|gb|DV938779.1|DV938779
genomic: CCCTCAATTGGCTTTGTTAATAAGATCTACCACCCAAATGTTGATGAAATgtgagagttt ... taaatttcagGTCCGGATCAGTGTGTTTAGATGTTATCAACCAAACCTGGAGCCCTATGTT
EST: CCCTCAATTGGCTTTGTTAATAAGATCTACCACCCAAATGTTGATGAAAT GTCCGGATCAGTGTGTTTAGATGTTATCAACCAAACCTGGAGCCCTATGTTEST: gi|351037950|gb|FQ465188.1|FQ465188
genomic: CCCTCAATTGGCTTTGTTAATAAGATCTACCACCCAAATGTTGATGAAATgtgagagttt ... taaatttcagGTCCGGATCAGTGTGTTTAGATGTTATCAACCAAACCTGGAGCCCTATGTT
EST: CCCTCAATTGGCTTTGTTAATAAGATCTACCACCCAAATGTTGATGAAAT GTCCGGATCAGTGTGTTTAGATGTTATCAACCAAACCTGGAGCCCTATGTT
genomic: CCCTCAATTGGCTTTGTTAATAAGATCTACCACCCAAATGTTGATGAAATgtgagagttt ... taaatttcagGTCCGGATCAGTGTGTTTAGATGTTATCAACCAAACCTGGAGCCCTATGTT
atacttaatgtgggattttggaaatctgaccatgacggcatgtgttaaatttcagGTCCGGATCAGTGTGTTTAGATGTTATCAACCAAACCTGGAGCCCTATGTTCG
atctgac putative branch site (score: 3)
tgttaaattt TA-rich tract