1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' |
gtaatattggttatccctgtactcctttatctgtgtcctatactatttgaaccaggttttgattaaagactaaacattcaagctgtcgttgaacagTATATTGACTGGATGGGGCAAACACAGCAAAGTGGTTGGGGATGGCGCATTAAGGCGAGCTATTGAGGCACTACTGACTGGCATGGGTGCACCCTTTCGG
species | Vitis vinifera |
transcript | Vv07s0005g01660.t01 |
intron # | 3 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: AATATTCGGTCTATTGTTTTTGAGGGTCATGAGCTGCCACAGCTCTTAAG TATATTGACTGGATGGGGCAAACACAGCAAAGTGGTTGGGGATGGCGCATTEST: gi|18458176|gb|BM436454.1|BM436454
genomic: AATATTCGGTCTATTGTTTTTGAGGGTCATGAGCTGCCACAGCTCTTAAGgtaatattgg ... cgttgaacagTATATTGACTGGATGGGGCAAACACAGCAAAGTGGTTGGGGATGGCGCATT
EST: AATATTCGGTCTATTGTTTTTGAGGGTCATGAGCTGCCACAGCTCTTAAG TATATTGACTGGATGGGGCAEST: gi|30320321|gb|CD003583.1|CD003583
genomic: AATATTCGGTCTATTGTTTTTGAGGGTCATGAGCTGCCACAGCTCTTAAGgtaatattgg ... cgttgaacagTATATTGACTGGATGGGGCA
EST: AATATTCGGTCTATTGTTTTTGAGGGTCATGAGCTGCCACAGCTCTTAAG TATATTGACTGGATGGGGCAAACACAGCAAAGTGGTTGGGGATGGCGCATTEST: gi|110686743|gb|EE064727.1|EE064727
genomic: AATATTCGGTCTATTGTTTTTGAGGGTCATGAGCTGCCACAGCTCTTAAGgtaatattgg ... cgttgaacagTATATTGACTGGATGGGGCAAACACAGCAAAGTGGTTGGGGATGGCGCATT
EST: AATATTCGGTCTATTGTTTTTGAGGGTCATGAGCTGCCACAGCTCTTAAG TATATTGACTGGATGGGGCAAACACAGCAAAGTGGTTGGGGATGGCGCATTEST: gi|110703518|gb|EE080432.1|EE080432
genomic: AATATTCGGTCTATTGTTTTTGAGGGTCATGAGCTGCCACAGCTCTTAAGgtaatattgg ... cgttgaacagTATATTGACTGGATGGGGCAAACACAGCAAAGTGGTTGGGGATGGCGCATT
EST: AATATTCGGTCTATTGTTTTTGAGGGTCATGAGCTGCCACAGCTCTTAAG TATATTGACTGGATGGGGCAAACACAGCAAAGTGGTTGGGGATGGCGCATTEST: gi|110700546|gb|EE078710.1|EE078710
genomic: AATATTCGGTCTATTGTTTTTGAGGGTCATGAGCTGCCACAGCTCTTAAGgtaatattgg ... cgttgaacagTATATTGACTGGATGGGGCAAACACAGCAAAGTGGTTGGGGATGGCGCATT
EST: AATATTCGGTCTATTGTTTTTGAGGGTCATGAGCTGCCACAGCTCTTAAG TATATTGACTGGATGGGGCAAACACAGCAAAGTGGTTGGGGATGGCGCATTEST: gi|34416633|gb|CF415387.1|CF415387
genomic: AATATTCGGTCTATTGTTTTTGAGGGTCATGAGCTGCCACAGCTCTTAAGgtaatattgg ... cgttgaacagTATATTGACTGGATGGGGCAAACACAGCAAAGTGGTTGGGGATGGCGCATT
EST: AATATTCGGTCTATTGTTTTTGAGGGTCATGAGCTGCCACAGCTCTTAAG TATATTGACTGGATGGGGCAAACACAGCAAAGTGGTTGGGGATGGCGCATTEST: gi|110727577|gb|EE104496.1|EE104496
genomic: AATATTCGGTCTATTGTTTTTGAGGGTCATGAGCTGCCACAGCTCTTAAGgtaatattgg ... cgttgaacagTATATTGACTGGATGGGGCAAACACAGCAAAGTGGTTGGGGATGGCGCATT
EST: AATATTCGGTCTATTGTTTTTGAGGGTCATGAGCTGCCACAGCTCTTAAG TATATTGACTGGATGGGGCAAACACAGCAAAGTGGTTGGGGATGGCGCATTEST: gi|110386922|gb|EC951557.1|EC951557
genomic: AATATTCGGTCTATTGTTTTTGAGGGTCATGAGCTGCCACAGCTCTTAAGgtaatattgg ... cgttgaacagTATATTGACTGGATGGGGCAAACACAGCAAAGTGGTTGGGGATGGCGCATT
EST: AATATTCGGTCTATTGTTTTTGAGGGTCATGAGCTGCCACAGCTCTTAAG TATATTGACTGGATGGGGCAAACACAGCAAAGTGGTTGGGGATGGCGCATTEST: gi|30125956|gb|CB911295.1|CB911295
genomic: AATATTCGGTCTATTGTTTTTGAGGGTCATGAGCTGCCACAGCTCTTAAGgtaatattgg ... cgttgaacagTATATTGACTGGATGGGGCAAACACAGCAAAGTGGTTGGGGATGGCGCATT
EST: AATATTCGGTCTATTGTTTTTGAGGGTCATGAGCTGCCACAGCTCTTAAG TATATTGACTGGATGGGGCAAACACAGCAAAGTGGTTGGGGATGGCGCATTEST: gi|77585024|gb|DV221596.1|DV221596
genomic: AATATTCGGTCTATTGTTTTTGAGGGTCATGAGCTGCCACAGCTCTTAAGgtaatattgg ... cgttgaacagTATATTGACTGGATGGGGCAAACACAGCAAAGTGGTTGGGGATGGCGCATT
EST: AATATTCGGTCTATTGTTTTTGAGGGTCATGAGCTGCCACAGCTCTTAAG TATATTGACTGGATGGGGCAAACACAGCAAAGTGGTTGGGGATGGCGCATT
genomic: AATATTCGGTCTATTGTTTTTGAGGGTCATGAGCTGCCACAGCTCTTAAGgtaatattgg ... cgttgaacagTATATTGACTGGATGGGGCAAACACAGCAAAGTGGTTGGGGATGGCGCATT
actatttgaaccaggttttgattaaagactaaacattcaagctgtcgttgaacagTATATTGACTGGATGGGGCAAACACAGCAAAGTGGTTGGGGATGGCGCATTAAGGCGAGCTATTGAGGCACTACTGACTGGCATGGGTGCACCCTTTCGG
gactaaa putative branch site (score: 2)
ttttgattaaa TA-rich tract