Sequence
atgc intronic sequence ATGC exonic sequence...tgaagttcttacttggtttttgtcattattattttgtcctgatatctgctgccatttgagccctatgttatgtgtctgaagtgaatcttttccataacagGAAGAAAGGAGTAACAATGAAGAGATCAAAAAATGTCCGAAAGATAAAAGCAATAGCAAAAGCGGTATCTCAAAATGAGAAGTCAATGGAGAAATTTCGA
Basic information
atgc intronic sequence ATGC exonic sequenceIntronic sequence truncated to 55 bases.ctgctgccatttgagccctatgttatgtgtctgaagtgaatcttttccataacagGAAGAAAGGAGTAACAATGAAGAGATCAAAAAATGTCCGAAAGATAAAAGCAATAGCAAAAGCGGTATCTCAAAATGAGAAGTCAATGGAGAAATTTCGA
tcttttccat CT-rich tract
tatgttat TA-rich tract
Putative cis-regulatory sequences
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
| | ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220
---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|
tgaagttcttacttggtttttgtcattattattttgtcctgatatctgctgccatttgagccctatgttatgtgtctgaagtgaatcttttccataacagGAAGAAAGGAGTAACAATGAAGAGATCAAAAAATGTCCGAAAGATAAAAGCAATAGCAAAAGCGGTATCTCAAAATGAGAAGTCAATGGAGAAATTTCGA
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - AGAAGT
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - TGGAGA
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - GGAGAA
- - - - -tacttgg
- - - - - - - - - - - - - - - - - - -cctgata
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - tctgctg
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -ccatttg
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -cctatgt
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - tgtctga