Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   		2  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

gtaattcaaattcttcctcctgtaatctgatctgcattgccaagtgccaacaatgccggaaatggtaaattgtctgtgaaccatgttgtagGTAATCCACGGGCGGTGGGCTATGCTGGGAGCCTTTGGCTGCATCACCCCAGAAGTTCTTGAGAAGTGGGTGAAGGTGGACTTCAAGGAACCAGTTTGGT

Basic information

species Vitis vinifera
transcript Vv00s0181g00200.t01
intron # 2
splice site 3'
intron type U2

Orthologous splice sites


 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence


upper sequence: Vv00s0181g00200.t01 (Vitis vinifera), 3'ss of exon 2
lower sequence: GLYMA12G34770.1 (Glycine max), 3'ss of exon 2
--------gtaattcaaattcttcc---tcctgtaatctgatctgcattgccaagtgccaacaatgccggaaatggtaaattgtctgtgaaccatgttgtagGTAATCCACGGGCGGTGGGCTATGCTGGGAGCCTTTGGCTGCATCACCCCAGAAGTTCTTGAGAAGTGGGTGAAGGTGGACTTCAAGGAACCAGTTTGGT
          ||       || | |   ||  ||    | || |  ||      |      |  |   |  ||   ||||||||   |      |     |||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||  | || |||||||||||||| || || ||||||||| |||  |||||||||||||| ||||| ||||
tatgttagacaaggggggatcatacatgtcaagtgtcataattttaatgaaagtgatttttccctaatgataacactaaattgttattatgtggtaca--agGTGATCCATGGGCGATGGGCCATGCTTGGAGCACTAGGATGCATCACCCCAGAGGTGCTAGAGAAGTGGTTGAGAGTGGACTTCAAGGAGCCAGTGTGGT

upper sequence: Vv00s0181g00200.t01 (Vitis vinifera), 3'ss of exon 2
lower sequence: GLYMA13G35800.1 (Glycine max), 3'ss of exon 2
------------------gtaattcaaattcttcctcctgtaatctgatctgcattgccaagtgccaacaatgccggaaatggtaaattgtc-tgtgaaccatgttgtagGTAATCCACGGGCGGTGGGCTATGCTGGGAGCCTTTGGCTGCATCACCCCAGAAGTTCTTGAGAAGTGGGTGAAGGTGGACTTCAAGGAACCAGTTTGGT
                  | |    | ||      |    |||| | |||    |       |  |  |||||    |||   |||||| |  |||| |  |      |||| ||||| ||| | ||||| ||||| |||||  | || |||||||||||||| || || ||||||||| |||  |||||||||||||| ||||| ||||
taaatttgttcaacaaggggatcatacatatcaagtgtcataatttaatcgaagtgattttttttc--caatgat--aaacactaaattattatgtggaata------agGTTATCCATGGGAGATGGGCCATGCTTGGAGCACTAGGATGCATCACCCCAGAGGTGCTAGAGAAGTGGTTGAGAGTGGACTTCAAGGAGCCAGTGTGGT

upper sequence: Vv00s0181g00200.t01 (Vitis vinifera), 3'ss of exon 2
lower sequence: AT5G54270.1 (Arabidopsis thaliana), 3'ss of exon 2
gtaattcaaattcttcctcctgtaatctgatctgcattgccaagtgccaacaatgccggaaatggtaaattgtctgtgaaccatgttgtagGTAATCCACGGGCGGTGGGCTATGCTGGGAGCCTTTGGCTGCATCACCCCAGAAGTTCTTGAGAAGTGGGTGAAGGTGGACTTCAAGGAACCAGTTTGGT
                           |  |||  |   |  | |  |  |||||    ||  |   || |  ||    | ||| ||| |||| ||||| ||| | ||||| ||| ||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||| | ||||||||    ||||||||||| |||||||| ||||
-------------------------gttagtctctaaatctcactcact-caatgtaaaaacagagtaaataactaatcatcat-ttgcagGTGATCCATGGGAGATGGGCAATGTTGGGAGCTTTTGGTTGCATAACCCCTGAAGTTCTTCAAAAGTGGGTCCGTGTGGACTTCAAAGAACCAGTCTGGT

upper sequence: Vv00s0181g00200.t01 (Vitis vinifera), 3'ss of exon 2
lower sequence: PP1S254_3V6.1 (Physcomitrella patens), 3'ss of exon 2
-------------------------------------gtaattcaaattcttcctcctgtaatctgatctgcattgccaagtgccaacaat----gccggaaatggtaaattgtctgt-gaaccatgt-tgtagGTAATCCACGGGCGGTGGGCTATGCTGGGAGCCTTTGGCTGCATCACCCCAGAAGTTCTTGAGAAGTGGGTGAAGGTGGACTTCAAGGAACCAGTTTGGT
                                      |   |  |   | | |  |||   |  |  |||     |||     || ||||    || ||   | |  | |    |||  ||   | |  | || | || || ||  | ||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||  ||||  ||||||        |||    ||||||| ||||| ||||
gtaccacttttcctgacattgattgaactactcaccattctcttgataacctaccactgggttaagggctgtgcccccacaattcaccaatatgcgctgggtgtagggattgagttgttaaattgtatgcgcagTTGATTCATGGAAGATGGGCTATGCTCGGAGCCCTTGGCTGCATCACCCCCGAGCTTCTCCAGAAGTACTCCCGTGTGACTCTCAAGGAGCCAGTATGGT

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|351056372|gb|FQ454233.1|FQ454233
EST:     CAGGATTATCAGCTGACCCAGAAGCCTTTGCCAGGAACAGGGCCCTTGAG                         GTAATCCACGGGCGGTGGGCTATGCTGGGAGCCTTTGGCTGCATCACCCCA
genomic: CAGGATTATCAGCTGACCCAGAAGCCTTTGCCAGGAACAGGGCCCTTGAGgtaattcaaa ... catgttgtagGTAATCCACGGGCGGTGGGCTATGCTGGGAGCCTTTGGCTGCATCACCCCA
EST: gi|349818740|gb|FQ409274.1|FQ409274
EST:     CTGGATTATCAGCTGACCCAGAAGCCTTTGCCAGGAACAGGGCCCTTGAG                         GTAATCCACGGGCGGTGGGCTATGCTGGGAGCCTTTGGCTGCATCACCCCA
genomic: CAGGATTATCAGCTGACCCAGAAGCCTTTGCCAGGAACAGGGCCCTTGAGgtaattcaaa ... catgttgtagGTAATCCACGGGCGGTGGGCTATGCTGGGAGCCTTTGGCTGCATCACCCCA
EST: gi|77587051|gb|DV222661.1|DV222661
EST:     CAGGATTATCAGCTGACCCAGAAGCCTTTGCCAGGAACAGGGCCCTTGAG                         GTAATCCACGGGCGGTGGGCTATGCTGGGAGCCTTTGGCTGCATCACCCCA
genomic: CAGGATTATCAGCTGACCCAGAAGCCTTTGCCAGGAACAGGGCCCTTGAGgtaattcaaa ... catgttgtagGTAATCCACGGGCGGTGGGCTATGCTGGGAGCCTTTGGCTGCATCACCCCA
EST: gi|349816312|gb|FQ399422.1|FQ399422
EST:     CAGGATTATCAGCTGACCCAGAAGCCTTTGCCAGGAACAGGGCCCTTGAG                         GTAATCCACGGGCGGTGGGCTATGCTGGGAGCCTTTGGCTGCATCACCCCA
genomic: CAGGATTATCAGCTGACCCAGAAGCCTTTGCCAGGAACAGGGCCCTTGAGgtaattcaaa ... catgttgtagGTAATCCACGGGCGGTGGGCTATGCTGGGAGCCTTTGGCTGCATCACCCCA
EST: gi|349826763|gb|FQ418854.1|FQ418854
EST:     CAGGATTATCAGCTGACCCAGAAGCCTTTGCCAGGAACAGGGCCCTTGAG                         GTAATCCACGGGCGGTGGGCTATGCTGGGAGCCTTTGGCTGCATCACCCCA
genomic: CAGGATTATCAGCTGACCCAGAAGCCTTTGCCAGGAACAGGGCCCTTGAGgtaattcaaa ... catgttgtagGTAATCCACGGGCGGTGGGCTATGCTGGGAGCCTTTGGCTGCATCACCCCA
EST: gi|351023558|gb|FQ432941.1|FQ432941
EST:     CAGGATTATCAGCTGACCCAGAAGCCTTTGCCAGGAACAGGGCCCTTGAG                         GTAATCCACGGGCGGTGGGCTATGCTGGGAGCCTTTGGCTGCATCACCCCA
genomic: CAGGATTATCAGCTGACCCAGAAGCCTTTGCCAGGAACAGGGCCCTTGAGgtaattcaaa ... catgttgtagGTAATCCACGGGCGGTGGGCTATGCTGGGAGCCTTTGGCTGCATCACCCCA
EST: gi|349828042|gb|FQ415370.1|FQ415370
EST:     CAGGATTATCAGCTGACCCAGAAGCCTTTGCCAGGAACAGGGCCCTTGAG                         GTAATCCACGGGCGGTGGGCTATGCTGGGAGCCTTTGGCTGCATCACCCCA
genomic: CAGGATTATCAGCTGACCCAGAAGCCTTTGCCAGGAACAGGGCCCTTGAGgtaattcaaa ... catgttgtagGTAATCCACGGGCGGTGGGCTATGCTGGGAGCCTTTGGCTGCATCACCCCA
EST: gi|77582611|gb|DV220293.1|DV220293
EST:     CAGGATTATCAGCTGACCCAGAAGCCTTTGCCAGGAACAGGGCCCTTGAG                         GTAATCCACGGGCGGTGGGCTATGCTGGGAGCCTTTGGCTGCATCACCCCA
genomic: CAGGATTATCAGCTGACCCAGAAGCCTTTGCCAGGAACAGGGCCCTTGAGgtaattcaaa ... catgttgtagGTAATCCACGGGCGGTGGGCTATGCTGGGAGCCTTTGGCTGCATCACCCCA
EST: gi|349832679|gb|FQ422037.1|FQ422037
EST:     CAGGATTATCAGCTGACCCAGAAGCCTTTGCCAGGAACAGGGCCCTTGAG                         GTAATCCACGGGCGGTGGGCTATGCTGGGAGCCTTTGGCTGCATCACCCCA
genomic: CAGGATTATCAGCTGACCCAGAAGCCTTTGCCAGGAACAGGGCCCTTGAGgtaattcaaa ... catgttgtagGTAATCCACGGGCGGTGGGCTATGCTGGGAGCCTTTGGCTGCATCACCCCA
EST: gi|349824646|gb|FQ413313.1|FQ413313
EST:     CAGGATTATCAGCTGACCCAGAAGCCTTTGCCAGGAACAGGGCCCTTGAG                         GTAATCCACGGGCGGTGGGCTATGCTGGGAGCCTTTGGCTGCATCACCCCA
genomic: CAGGATTATCAGCTGACCCAGAAGCCTTTGCCAGGAACAGGGCCCTTGAGgtaattcaaa ... catgttgtagGTAATCCACGGGCGGTGGGCTATGCTGGGAGCCTTTGGCTGCATCACCCCA
EST: gi|351044479|gb|FQ443010.1|FQ443010
EST:     CAGGATTATCAGCTGACCCAGAAGCCTTTGCCAGGAACAGGGCCCTTGAG                         GTAATCCACGGGCGGTGGGCTATGCTGGGAGCCTTTGACTGCATCACCCCA
genomic: CAGGATTATCAGCTGACCCAGAAGCCTTTGCCAGGAACAGGGCCCTTGAGgtaattcaaa ... catgttgtagGTAATCCACGGGCGGTGGGCTATGCTGGGAGCCTTTGGCTGCATCACCCCA
EST: gi|349825231|gb|FQ417952.1|FQ417952
EST:     CAGGATTATCAGCTGACCCAGAAGCCTTTGCCAGGAACAGGGCCCTTGAG                         GTAATCCACAGGCGGTGGGCTATGCTGGGAGCCTTTGGCTGCATCACCCCA
genomic: CAGGATTATCAGCTGACCCAGAAGCCTTTGCCAGGAACAGGGCCCTTGAGgtaattcaaa ... catgttgtagGTAATCCACGGGCGGTGGGCTATGCTGGGAGCCTTTGGCTGCATCACCCCA
EST: gi|351046506|gb|FQ453122.1|FQ453122
EST:     CAGGATTATCAGCTGACCCAGAAGCCTTTGCCAGGAACAGGGCCCTTGAG                         GTAATCCACGGGCGGTGGGCTATGCTGGGAGCCTTTGACTGCATCACCCCA
genomic: CAGGATTATCAGCTGACCCAGAAGCCTTTGCCAGGAACAGGGCCCTTGAGgtaattcaaa ... catgttgtagGTAATCCACGGGCGGTGGGCTATGCTGGGAGCCTTTGGCTGCATCACCCCA
EST: gi|351024128|gb|FQ423551.1|FQ423551
EST:     CAGGATTATCAGCTGACCCAGAAGCCTTTGCCAGGAACAGGGCCCTTGAG                         GTAATCCACGGGCGGTGGGCTATGCTGGGAGCCTTTGGCTGCATCACCCCA
genomic: CAGGATTATCAGCTGACCCAGAAGCCTTTGCCAGGAACAGGGCCCTTGAGgtaattcaaa ... catgttgtagGTAATCCACGGGCGGTGGGCTATGCTGGGAGCCTTTGGCTGCATCACCCCA
EST: gi|110375427|gb|EC940415.1|EC940415
EST:     CAGGATTATCAGCTGACCCAGAAGCCTTTGCCAGGAACAGGGCCCTTGAG                         GTAATCCACGGGCGGTGGGCTATGCTGGGAGCCTTTGGCTGCATCACCCCA
genomic: CAGGATTATCAGCTGACCCAGAAGCCTTTGCCAGGAACAGGGCCCTTGAGgtaattcaaa ... catgttgtagGTAATCCACGGGCGGTGGGCTATGCTGGGAGCCTTTGGCTGCATCACCCCA
EST: gi|349817096|gb|FQ399843.1|FQ399843
EST:     CAGGATTATCAGCTGACCCAGAAGCCTTTGCCAGGAACAGGGCCCTTGAG                         GTAATCCACGGGCGGTGGGCTATGCTGGGAGCCTTTGGCTGCATCACCCCA
genomic: CAGGATTATCAGCTGACCCAGAAGCCTTTGCCAGGAACAGGGCCCTTGAGgtaattcaaa ... catgttgtagGTAATCCACGGGCGGTGGGCTATGCTGGGAGCCTTTGGCTGCATCACCCCA
EST: gi|349807677|gb|FQ402068.1|FQ402068
EST:     CAGGATTATCAGCTGACCCAGAAGCCTTTGCCAGGAACAGGGCCCTTGAG                         GTAATCCACGGGCGGTGGGCTATGCTGGGAGCCTTTGGCTGCATCACCCCA
genomic: CAGGATTATCAGCTGACCCAGAAGCCTTTGCCAGGAACAGGGCCCTTGAGgtaattcaaa ... catgttgtagGTAATCCACGGGCGGTGGGCTATGCTGGGAGCCTTTGGCTGCATCACCCCA
EST: gi|351022541|gb|FQ447063.1|FQ447063
EST:     CAGGATTATCAGCTGACCCAGAAGCCTTTGCCAGGAACAGGGCCCTTGAG                         GTAATCCACGGGCGGTGGGCTATGCTGGGAGCCTTTGGCTGCATCACCCCA
genomic: CAGGATTATCAGCTGACCCAGAAGCCTTTGCCAGGAACAGGGCCCTTGAGgtaattcaaa ... catgttgtagGTAATCCACGGGCGGTGGGCTATGCTGGGAGCCTTTGGCTGCATCACCCCA
EST: gi|351056515|gb|FQ455167.1|FQ455167
EST:     CAGGATTATCAGCTGACCCAGAAGCCTTTGCCAGGAACGGGGCCCTTGAG                         GTAATCCACGGGCGGTGGGCTATGCTGGGAGCCTTTGGCTGCATCACCCCA
genomic: CAGGATTATCAGCTGACCCAGAAGCCTTTGCCAGGAACAGGGCCCTTGAGgtaattcaaa ... catgttgtagGTAATCCACGGGCGGTGGGCTATGCTGGGAGCCTTTGGCTGCATCACCCCA
EST: gi|349812686|gb|FQ409845.1|FQ409845
EST:     CAGGATTATCAGCTGACCCAGAAGCCTTTGCCAGGAACAGGGCCCTTGAG                         GTAATCCACGGGCGGTGGGCTATGCTGGGAGCCTTTGGCTGCATCACCCCA
genomic: CAGGATTATCAGCTGACCCAGAAGCCTTTGCCAGGAACAGGGCCCTTGAGgtaattcaaa ... catgttgtagGTAATCCACGGGCGGTGGGCTATGCTGGGAGCCTTTGGCTGCATCACCCCA
EST: gi|351056110|gb|FQ453572.1|FQ453572
EST:     CAGGATTATCAGCTGACCCAGAAGCCTTTGCCAGGAACAGGGCCCTTGAG                         GTAATCCACGGGCGGTGGGCTATGCTGGGAGCCTTTGGCTGGATCACCCCA
genomic: CAGGATTATCAGCTGACCCAGAAGCCTTTGCCAGGAACAGGGCCCTTGAGgtaattcaaa ... catgttgtagGTAATCCACGGGCGGTGGGCTATGCTGGGAGCCTTTGGCTGCATCACCCCA
EST: gi|351047413|gb|FQ451925.1|FQ451925
EST:     CAGGATTATCAGCTGACCCAGAAGCCTTTGCCAGGAACAGGGCCCTTGAG                         GTAATCCACGGGCGGTGGGCTATGCTGGGAGCCTTTGGCTGCATCACCCCA
genomic: CAGGATTATCAGCTGACCCAGAAGCCTTTGCCAGGAACAGGGCCCTTGAGgtaattcaaa ... catgttgtagGTAATCCACGGGCGGTGGGCTATGCTGGGAGCCTTTGGCTGCATCACCCCA
EST: gi|351029262|gb|FQ436656.1|FQ436656
EST:     CAGGATTATCAGCTGACCCAGAAGCCTTTGCCAGGAACAGGGCCCTTGAG                         GTAATCCACGGGCGGTGGGCTATGCTGGGAGCCTTTGACTGCATCACCCCA
genomic: CAGGATTATCAGCTGACCCAGAAGCCTTTGCCAGGAACAGGGCCCTTGAGgtaattcaaa ... catgttgtagGTAATCCACGGGCGGTGGGCTATGCTGGGAGCCTTTGGCTGCATCACCCCA
EST: gi|349821594|gb|FQ411094.1|FQ411094
EST:     CAGGATTATCAGCTGACCCAGAAGCCTTTGCCAGGAACAGGGCCCTTGAG                         GTAATCCACGGGCGGTGGGCTATGCTGGGAGCCTTTGGCTGCATCACCCCA
genomic: CAGGATTATCAGCTGACCCAGAAGCCTTTGCCAGGAACAGGGCCCTTGAGgtaattcaaa ... catgttgtagGTAATCCACGGGCGGTGGGCTATGCTGGGAGCCTTTGGCTGCATCACCCCA
EST: gi|351022859|gb|FQ428768.1|FQ428768
EST:     CAGGATTATCAGCTGACCCAGAAGCCTTTGCCAGGAACAGGGCCCTTGAG                         GTAATCCACGGGCGGTGGGCTATGCTGGGAGCCTTTGGCTGCATCACCCCA
genomic: CAGGATTATCAGCTGACCCAGAAGCCTTTGCCAGGAACAGGGCCCTTGAGgtaattcaaa ... catgttgtagGTAATCCACGGGCGGTGGGCTATGCTGGGAGCCTTTGGCTGCATCACCCCA
EST: gi|351047064|gb|FQ454674.1|FQ454674
EST:     CAGGATTATCAGCTGACCCAGAAGCCTTTGCCAGGAACAGGGCCCTTGAG                         GTAATCCACGGGCGGTGGGCTATGCTGGGAGCCTTTGGCTGCATCACCCCA
genomic: CAGGATTATCAGCTGACCCAGAAGCCTTTGCCAGGAACAGGGCCCTTGAGgtaattcaaa ... catgttgtagGTAATCCACGGGCGGTGGGCTATGCTGGGAGCCTTTGGCTGCATCACCCCA
EST: gi|349828043|gb|FQ415371.1|FQ415371
EST:     CAGGATTATCAGCTGACCCAGAAGCCTTTGCCAGGAACAGGGCCCTTGAG                         GTAATCCACGGGCGGTGGGCTATGCTGGGAGCCTTTGGCTGCATCACCCCA
genomic: CAGGATTATCAGCTGACCCAGAAGCCTTTGCCAGGAACAGGGCCCTTGAGgtaattcaaa ... catgttgtagGTAATCCACGGGCGGTGGGCTATGCTGGGAGCCTTTGGCTGCATCACCCCA
EST: gi|349823653|gb|FQ415063.1|FQ415063
EST:     CAGGATTATCAGCTGACCCAGAAGCCTTTGCCAGGAACAGGGCCCTTGAG                         GTAATCCACGGGCGGTGGGCTATGCTGGGAGCCTTTGGCTGCATCACCCCA
genomic: CAGGATTATCAGCTGACCCAGAAGCCTTTGCCAGGAACAGGGCCCTTGAGgtaattcaaa ... catgttgtagGTAATCCACGGGCGGTGGGCTATGCTGGGAGCCTTTGGCTGCATCACCCCA
EST: gi|349817801|gb|FQ407790.1|FQ407790
EST:     CAGGATTATCAGCTGACCCAGAAGCCTTTGCCAGGAACAGGGCCCTTGAG                         GTAATCCACGGGCGGTGGGCTATGCTGGGAGCCTTTGGCTGCATCACCCCA
genomic: CAGGATTATCAGCTGACCCAGAAGCCTTTGCCAGGAACAGGGCCCTTGAGgtaattcaaa ... catgttgtagGTAATCCACGGGCGGTGGGCTATGCTGGGAGCCTTTGGCTGCATCACCCCA
EST: gi|110378547|gb|EC943684.1|EC943684
EST:     CAGGATTATCAGCTGACCCAGAAGCCTTTGCCAGGAACAGGGCCCTTGAG                         GTAATCCACGGGCGGTGGGCTATGCTGGGAGCCTTTGGCTGCATCACCCCA
genomic: CAGGATTATCAGCTGACCCAGAAGCCTTTGCCAGGAACAGGGCCCTTGAGgtaattcaaa ... catgttgtagGTAATCCACGGGCGGTGGGCTATGCTGGGAGCCTTTGGCTGCATCACCCCA
EST: gi|349821882|gb|FQ413053.1|FQ413053
EST:     CAGGATTATCAGCTGACCCAGAAGCCTTTGCCAGGAACAGGGCCCTTGAG                         GTAATCCACGGGCGGTGGGCTATGCTGGGAGCCTTTGGCTGCATCACCCCA
genomic: CAGGATTATCAGCTGACCCAGAAGCCTTTGCCAGGAACAGGGCCCTTGAGgtaattcaaa ... catgttgtagGTAATCCACGGGCGGTGGGCTATGCTGGGAGCCTTTGGCTGCATCACCCCA
EST: gi|351013144|gb|FQ424849.1|FQ424849
EST:     CAGGATTATCAGCTGACCCAGAAGCCTTTGCCAGGAACAGGGCCCTTGAG                         GTAATCCACGGGCGGTGGGCTATGCTGGGAGCCTTTGGCTGCATCACCCCA
genomic: CAGGATTATCAGCTGACCCAGAAGCCTTTGCCAGGAACAGGGCCCTTGAGgtaattcaaa ... catgttgtagGTAATCCACGGGCGGTGGGCTATGCTGGGAGCCTTTGGCTGCATCACCCCA
EST: gi|351030972|gb|FQ439008.1|FQ439008
EST:     CAGGATTATCAGCTGACCCAGAAGCCTTTGCCAGGAACAGGGCCCTTGAG                         GTAATCCACGGGCGGTGGGCTATGCTGGGAGCCTTTGGCTGCATCACCCCA
genomic: CAGGATTATCAGCTGACCCAGAAGCCTTTGCCAGGAACAGGGCCCTTGAGgtaattcaaa ... catgttgtagGTAATCCACGGGCGGTGGGCTATGCTGGGAGCCTTTGGCTGCATCACCCCA
EST: gi|110698731|gb|EE076565.1|EE076565
EST:     CAGGATTATCAGCTGACCCAGAAGCCTTTGCCAGGAACAGGGCCCTTGAG                         GTAATCCACGGGCGGTGGGCTATGCTGGGAGCCTTTGGCTGCATCACCCCA
genomic: CAGGATTATCAGCTGACCCAGAAGCCTTTGCCAGGAACAGGGCCCTTGAGgtaattcaaa ... catgttgtagGTAATCCACGGGCGGTGGGCTATGCTGGGAGCCTTTGGCTGCATCACCCCA
EST: gi|351022826|gb|FQ428735.1|FQ428735
EST:     CAGGATTATCAGCTGACCCAGAAGCCTTTGCCAGGAACAGGGCCCTTGAG                         GTAATCCACGGGCGGTGGGCTATGCTGGGAGCCTTTGACTGCATCACCCCA
genomic: CAGGATTATCAGCTGACCCAGAAGCCTTTGCCAGGAACAGGGCCCTTGAGgtaattcaaa ... catgttgtagGTAATCCACGGGCGGTGGGCTATGCTGGGAGCCTTTGGCTGCATCACCCCA
EST: gi|351015123|gb|FQ444412.1|FQ444412
EST:     CAGGATTATCAGCTGACCCAGAAGCCTTTGCCAGGAACAGGGCCCTTGAG                         GTAATCCACGGGCGGTGGGCTATGCTGGGAGCCTTTGGCTGCATCACCCCA
genomic: CAGGATTATCAGCTGACCCAGAAGCCTTTGCCAGGAACAGGGCCCTTGAGgtaattcaaa ... catgttgtagGTAATCCACGGGCGGTGGGCTATGCTGGGAGCCTTTGGCTGCATCACCCCA
EST: gi|352791524|gb|FQ481103.1|FQ481103
EST:     CAGGATTATCAGCTGACCCAGAAGCCTTTGCCAGGAACAGGGCCCTTGAG                         GTAATCCACGGGCGGTGGGCTATGCTGGGAGCCTTTGGCTGCATCACCCCA
genomic: CAGGATTATCAGCTGACCCAGAAGCCTTTGCCAGGAACAGGGCCCTTGAGgtaattcaaa ... catgttgtagGTAATCCACGGGCGGTGGGCTATGCTGGGAGCCTTTGGCTGCATCACCCCA
EST: gi|351017036|gb|FQ424463.1|FQ424463
EST:     CAGGATTATCAGCTGACCCAGAAGCCTTTGCCAGGAACAGGGCCCTTGAG                         GTAATCCACGGGCGGTGGGCTATGCTGGGAGCCTTTGGCTGCATCACCCCA
genomic: CAGGATTATCAGCTGACCCAGAAGCCTTTGCCAGGAACAGGGCCCTTGAGgtaattcaaa ... catgttgtagGTAATCCACGGGCGGTGGGCTATGCTGGGAGCCTTTGGCTGCATCACCCCA
EST: gi|77577352|gb|DV217388.1|DV217388
EST:     CAGGATTATCAGCTGACCCAGAAGCCTTTGCCAGGAACAGGGCCCTTGAG                         GTAATCCACGGGCGGTGGGCTATGCTGGGAGCCTTTGGCTGCATCACCCCA
genomic: CAGGATTATCAGCTGACCCAGAAGCCTTTGCCAGGAACAGGGCCCTTGAGgtaattcaaa ... catgttgtagGTAATCCACGGGCGGTGGGCTATGCTGGGAGCCTTTGGCTGCATCACCCCA
EST: gi|110731923|gb|EE106757.1|EE106757
EST:     CAGGATTATCAGCTGACCCAGAAGCCTTTGCCAGGAACAGGGCCCTTGAG                         GTAATCCACGGGCGGTGGGCTATGCTGGGAGCCTTTGGCTGCATCACCCCA
genomic: CAGGATTATCAGCTGACCCAGAAGCCTTTGCCAGGAACAGGGCCCTTGAGgtaattcaaa ... catgttgtagGTAATCCACGGGCGGTGGGCTATGCTGGGAGCCTTTGGCTGCATCACCCCA
EST: gi|349817494|gb|FQ407284.1|FQ407284
EST:     CAAGATTATCAGCTGACCCAGAAGCCTTTGCCAGGAACAGGGCCCTTGAG                         GTAATCCACGGGCGGTGGGCTATGCTGGGAGCCTTTGGCTGCATCACCCCA
genomic: CAGGATTATCAGCTGACCCAGAAGCCTTTGCCAGGAACAGGGCCCTTGAGgtaattcaaa ... catgttgtagGTAATCCACGGGCGGTGGGCTATGCTGGGAGCCTTTGGCTGCATCACCCCA
EST: gi|351052921|gb|FQ453908.1|FQ453908
EST:     CAGGATTATCAGCTGACCCAGAAGCCTTTGCCAGGAACAGGGCCCTTGAG                         GTAATCCACGGGCGGTGGGCTATGCTGGGAGCCTTTGGCTGCATCACCCCA
genomic: CAGGATTATCAGCTGACCCAGAAGCCTTTGCCAGGAACAGGGCCCTTGAGgtaattcaaa ... catgttgtagGTAATCCACGGGCGGTGGGCTATGCTGGGAGCCTTTGGCTGCATCACCCCA
EST: gi|110686442|gb|EE064082.1|EE064082
EST:     CAGGATTATCAGCTGACCCAGAAGCCTTTGCCAGGAACAGGGCCCTTGAG                         GTAATCCACGGGCGGTGGGCTATGCTGGGAGCCTTTGGCTGCATCACCCCA
genomic: CAGGATTATCAGCTGACCCAGAAGCCTTTGCCAGGAACAGGGCCCTTGAGgtaattcaaa ... catgttgtagGTAATCCACGGGCGGTGGGCTATGCTGGGAGCCTTTGGCTGCATCACCCCA
EST: gi|351030176|gb|FQ432114.1|FQ432114
EST:     CAGGATTATCAGCTGACCCAGAAGCCTTTGCCAGGAACAGGGCCCTTGAG                         GTAATCCACGGGCGGTGGGCTATGCTGGGAGCCTTTGGCTGCATCACCCCA
genomic: CAGGATTATCAGCTGACCCAGAAGCCTTTGCCAGGAACAGGGCCCTTGAGgtaattcaaa ... catgttgtagGTAATCCACGGGCGGTGGGCTATGCTGGGAGCCTTTGGCTGCATCACCCCA
EST: gi|349813439|gb|FQ413673.1|FQ413673
EST:     CAGGATTATCAGCTGACCCAGAAGCCTTTGCCAGGAACAGGGCCCTTGAG                         GTAATCCACGGGCGGTGGGCTATGCTGGGAGCCTTTGGCTGCATCACCCCA
genomic: CAGGATTATCAGCTGACCCAGAAGCCTTTGCCAGGAACAGGGCCCTTGAGgtaattcaaa ... catgttgtagGTAATCCACGGGCGGTGGGCTATGCTGGGAGCCTTTGGCTGCATCACCCCA
EST: gi|351056212|gb|FQ453674.1|FQ453674
EST:     CAGGATTATCAGCTGACCCAGAAGCCTTTGCCAGGAACAGGGCCCTTGAG                         GTAATCCACGGGCGGTGGGCTATGCTGGGAGCCTTTGACTGCATCACCCCA
genomic: CAGGATTATCAGCTGACCCAGAAGCCTTTGCCAGGAACAGGGCCCTTGAGgtaattcaaa ... catgttgtagGTAATCCACGGGCGGTGGGCTATGCTGGGAGCCTTTGGCTGCATCACCCCA
EST: gi|351042523|gb|FQ431121.1|FQ431121
EST:     CAGGATTATCAGCTGACCCAGAAGCCTTTGCCAGGAACAGGGCCCTTGAG                         GTAATCCACGGGCGGTGGGCTATGCTGGGAGCCTTTGGCTGCATCACCCCA
genomic: CAGGATTATCAGCTGACCCAGAAGCCTTTGCCAGGAACAGGGCCCTTGAGgtaattcaaa ... catgttgtagGTAATCCACGGGCGGTGGGCTATGCTGGGAGCCTTTGGCTGCATCACCCCA
EST: gi|351034019|gb|FQ447936.1|FQ447936
EST:     CAGGATTATCAGCTGACCCAGAAGCCTCTGCCAGGAACAGGGCCCTTGAG                         GTAATCCACGGGCGGTGGGCTATGCTGGGAGCCTTTGGCTGCATCACCCCA
genomic: CAGGATTATCAGCTGACCCAGAAGCCTTTGCCAGGAACAGGGCCCTTGAGgtaattcaaa ... catgttgtagGTAATCCACGGGCGGTGGGCTATGCTGGGAGCCTTTGGCTGCATCACCCCA
EST: gi|349807945|gb|FQ402336.1|FQ402336
EST:     CAGGATTATCAGCTGACCCAGAAGCCTTTGCCAGGAACAGGGCCCTTGAG                         GTAATCCACGGGCGGTGGGCTATGCTGGGAGCCTTTGGCTGCATCACCCCA
genomic: CAGGATTATCAGCTGACCCAGAAGCCTTTGCCAGGAACAGGGCCCTTGAGgtaattcaaa ... catgttgtagGTAATCCACGGGCGGTGGGCTATGCTGGGAGCCTTTGGCTGCATCACCCCA
EST: gi|351017793|gb|FQ436146.1|FQ436146
EST:     CAGGATTATCAGCTGACCCAGAAGCCTTTGCCAGGAACAGGGCCCTTGAG                         GTAATCCACGGGCGGTGGGCTATGCTGGGAGCCTTTGGCTGCATCACCCCA
genomic: CAGGATTATCAGCTGACCCAGAAGCCTTTGCCAGGAACAGGGCCCTTGAGgtaattcaaa ... catgttgtagGTAATCCACGGGCGGTGGGCTATGCTGGGAGCCTTTGGCTGCATCACCCCA
EST: gi|351029654|gb|FQ427494.1|FQ427494
EST:     CAGGATTATCAGCTGACCCAGAAGCCTTTGCCAGGAACAGGGCCCTTGAG                         GTAATCCACGGGCGGTGGGCTATGCTGGGAGCCTTTGGCTGCATCACCCCA
genomic: CAGGATTATCAGCTGACCCAGAAGCCTTTGCCAGGAACAGGGCCCTTGAGgtaattcaaa ... catgttgtagGTAATCCACGGGCGGTGGGCTATGCTGGGAGCCTTTGGCTGCATCACCCCA
EST: gi|71869778|gb|DT018833.1|DT018833
EST:     CAGGATTATCAGCTGACCCAGAAGCCTTTGCCAGGAACAGGGCCCTTGAG                         GTAATCCACGGGCGGTGGGCTATGCTGGGAGCCTTTGGCTGCATCACCCCA
genomic: CAGGATTATCAGCTGACCCAGAAGCCTTTGCCAGGAACAGGGCCCTTGAGgtaattcaaa ... catgttgtagGTAATCCACGGGCGGTGGGCTATGCTGGGAGCCTTTGGCTGCATCACCCCA
EST: gi|349812639|gb|FQ409798.1|FQ409798
EST:     CAGGATTATCAGCTGACCCAGAAGCCTTTGCCAGGAACAGGGCCCTTGAG                         GTAATCCACGGGCGGTGGGCTATGCTGGGAGCCTTTGGCTGCATCACCCCA
genomic: CAGGATTATCAGCTGACCCAGAAGCCTTTGCCAGGAACAGGGCCCTTGAGgtaattcaaa ... catgttgtagGTAATCCACGGGCGGTGGGCTATGCTGGGAGCCTTTGGCTGCATCACCCCA
EST: gi|351018380|gb|FQ439192.1|FQ439192
EST:     CAGGATTATCAGCTGACCCAGAAGCCTTTGCCAGGAACAGGGCCCTTGAG                         GTAATCCACGGGCGGTGGGCTATGCTGGGAGCCTTTGGCTGCATCACCCCA
genomic: CAGGATTATCAGCTGACCCAGAAGCCTTTGCCAGGAACAGGGCCCTTGAGgtaattcaaa ... catgttgtagGTAATCCACGGGCGGTGGGCTATGCTGGGAGCCTTTGGCTGCATCACCCCA
EST: gi|351048940|gb|FQ449783.1|FQ449783
EST:     CAGGATTATCAGCTGACCCAGAAGCCTTTGCCAGGAACAGGGCCCTTGAG                         GTAATCCACGGGCGGTGGGCTATGCTGGGAGCCTTTGGCTGCATCACCCCA
genomic: CAGGATTATCAGCTGACCCAGAAGCCTTTGCCAGGAACAGGGCCCTTGAGgtaattcaaa ... catgttgtagGTAATCCACGGGCGGTGGGCTATGCTGGGAGCCTTTGGCTGCATCACCCCA
EST: gi|349818577|gb|FQ403212.1|FQ403212
EST:     CAGGATTATCAGCTGACCCAGAAGCCTTTGCCAGGAACAGGGCCCTTGAG                         GTAATCCACGGGCGGTGGGCTATGCTGGGGGCCTTTGGCTGCATCACCCCA
genomic: CAGGATTATCAGCTGACCCAGAAGCCTTTGCCAGGAACAGGGCCCTTGAGgtaattcaaa ... catgttgtagGTAATCCACGGGCGGTGGGCTATGCTGGGAGCCTTTGGCTGCATCACCCCA
EST: gi|351030395|gb|FQ432333.1|FQ432333
EST:     CAGGATTATCAGCTGACCCAGAAGCCTTTGCCAGGAACAGGGCCCTTGAG                         GTAATCCACGGGCGGTGGGCTATGCTGGGAGCCTTTGGCTGCATCACCCCA
genomic: CAGGATTATCAGCTGACCCAGAAGCCTTTGCCAGGAACAGGGCCCTTGAGgtaattcaaa ... catgttgtagGTAATCCACGGGCGGTGGGCTATGCTGGGAGCCTTTGGCTGCATCACCCCA
EST: gi|351041068|gb|FQ443844.1|FQ443844
EST:     CAGGATTATCAGCTGACCCAGAAGCCTTTGCCAGGAACAGGGCCCTTGAG                         GTAATCCACGGGCGGTGGGCTATGCTGGGAGCCTTTGGCTGCATCACCCCA
genomic: CAGGATTATCAGCTGACCCAGAAGCCTTTGCCAGGAACAGGGCCCTTGAGgtaattcaaa ... catgttgtagGTAATCCACGGGCGGTGGGCTATGCTGGGAGCCTTTGGCTGCATCACCCCA
EST: gi|110687175|gb|EE064356.1|EE064356
EST:     CAGGATTATCAGCTGACCCAGAAGCCTTTGCCAGGAACAGGGCCCTTGAG                         GTAATCCACGGGCGGTGGGCTATGCTGGGAGCCTTTGGCTGCATCACCCCA
genomic: CAGGATTATCAGCTGACCCAGAAGCCTTTGCCAGGAACAGGGCCCTTGAGgtaattcaaa ... catgttgtagGTAATCCACGGGCGGTGGGCTATGCTGGGAGCCTTTGGCTGCATCACCCCA
EST: gi|351012952|gb|FQ433679.1|FQ433679
EST:     CAGGATTATCAGCTGACCCAGAAGCCTTTGCCAGGAACAGGGCCCTTGAG                         GTAATCCACGGGCGGTGGGCTATGCTGGGAGCCTTTGGCTGCATCACCCCA
genomic: CAGGATTATCAGCTGACCCAGAAGCCTTTGCCAGGAACAGGGCCCTTGAGgtaattcaaa ... catgttgtagGTAATCCACGGGCGGTGGGCTATGCTGGGAGCCTTTGGCTGCATCACCCCA
EST: gi|349825201|gb|FQ417922.1|FQ417922
EST:     CAGGATTATCAGCTGACCCAGAAGCCTTTGCCAGGAACAGGGCCCTTGAG                         GCAATCCACGGGCGGTGGGCTATGCTGGGAGCCTTTGGCTGCATCACCCCA
genomic: CAGGATTATCAGCTGACCCAGAAGCCTTTGCCAGGAACAGGGCCCTTGAGgtaattcaaa ... catgttgtagGTAATCCACGGGCGGTGGGCTATGCTGGGAGCCTTTGGCTGCATCACCCCA
EST: gi|110690172|gb|EE067040.1|EE067040
EST:     CAGGATTATCAGCTGACCCAGAAGCCTTTGCCAGGAACAGGGCCCTTGAG                         GTAATCCACGGGCGGTGGGCTATGCTGGGAGCCTTTGGCTGCATCACCCCA
genomic: CAGGATTATCAGCTGACCCAGAAGCCTTTGCCAGGAACAGGGCCCTTGAGgtaattcaaa ... catgttgtagGTAATCCACGGGCGGTGGGCTATGCTGGGAGCCTTTGGCTGCATCACCCCA
EST: gi|71890830|gb|DT039885.1|DT039885
EST:     CAGGATTATCAGCTGACCCAGAAGCCTTTGCCAGGAACAGGGCCCTTGAG                         GTAATCCACGGGCGGTGGGCTATGCTGGGAGCCTTTGGCTGCATCACCCCA
genomic: CAGGATTATCAGCTGACCCAGAAGCCTTTGCCAGGAACAGGGCCCTTGAGgtaattcaaa ... catgttgtagGTAATCCACGGGCGGTGGGCTATGCTGGGAGCCTTTGGCTGCATCACCCCA
EST: gi|351041232|gb|FQ444209.1|FQ444209
EST:     CACGATTATCAGCTGACCCAGAAGCCTTTGCCAGGAACAGGGCCCTTGAG                         GTAATCCACGGGCGGTGGGCTATGCTGGGAGCCTTTGGCTGCATCACCCCA
genomic: CAGGATTATCAGCTGACCCAGAAGCCTTTGCCAGGAACAGGGCCCTTGAGgtaattcaaa ... catgttgtagGTAATCCACGGGCGGTGGGCTATGCTGGGAGCCTTTGGCTGCATCACCCCA
EST: gi|352786354|gb|FQ478963.1|FQ478963
EST:     CAGGATTATCAGCTGACCCAGAAGCCTTTGCCAGGAACAGGGCCCTTGAG                         GTAATCCACGGGCGGTGGGCTATGCTGGGAGCCTTTGACTGCATCACCCCA
genomic: CAGGATTATCAGCTGACCCAGAAGCCTTTGCCAGGAACAGGGCCCTTGAGgtaattcaaa ... catgttgtagGTAATCCACGGGCGGTGGGCTATGCTGGGAGCCTTTGGCTGCATCACCCCA
EST: gi|349810287|gb|FQ401733.1|FQ401733
EST:     CAGGATTATCAGCTGACCCAGAAGCCTTTGCCAGGAACAGGGCCCTTGAG                         GTAATCCACGGGCGGTGGGCTATGCTGGGAGCCTTTGGCTGCATCACCCCA
genomic: CAGGATTATCAGCTGACCCAGAAGCCTTTGCCAGGAACAGGGCCCTTGAGgtaattcaaa ... catgttgtagGTAATCCACGGGCGGTGGGCTATGCTGGGAGCCTTTGGCTGCATCACCCCA
EST: gi|351013078|gb|FQ433805.1|FQ433805
EST:     CAGGATTATCAGCTGACCCAGAAGCCTTTGCCAGGAACAGGGCCCTTGAG                         GTAATCCACGGGCGGTGGGCTATGCTGGGAGCCTTTGGCTGCATCACCCCA
genomic: CAGGATTATCAGCTGACCCAGAAGCCTTTGCCAGGAACAGGGCCCTTGAGgtaattcaaa ... catgttgtagGTAATCCACGGGCGGTGGGCTATGCTGGGAGCCTTTGGCTGCATCACCCCA
EST: gi|351041030|gb|FQ443806.1|FQ443806
EST:     CAGGATTATCAGCTGACCCAGAAGCCTTTGCCAGGAACAGGGCCCTTGAG                         GTAATCCACGGGCGGTGGGCTATGCTGGGAGCCTTTGGCTGCATCACCCCA
genomic: CAGGATTATCAGCTGACCCAGAAGCCTTTGCCAGGAACAGGGCCCTTGAGgtaattcaaa ... catgttgtagGTAATCCACGGGCGGTGGGCTATGCTGGGAGCCTTTGGCTGCATCACCCCA
EST: gi|351046156|gb|FQ442534.1|FQ442534
EST:     CAGGATTATCAGCTGACCCAGAAGCCTTTGCCAGGAACAGGGCCCTTGAG                         GTAATCCACGGGCGGTGGGCTATGCTGGGAGCCTTTGACTGCATCACCCCA
genomic: CAGGATTATCAGCTGACCCAGAAGCCTTTGCCAGGAACAGGGCCCTTGAGgtaattcaaa ... catgttgtagGTAATCCACGGGCGGTGGGCTATGCTGGGAGCCTTTGGCTGCATCACCCCA
EST: gi|110726144|gb|EE101668.1|EE101668
EST:     CAGGATTATCAGCTGACCCAGAAGCCTTTGCCAGGAACAGGGCCCTTGAG                         GTAATCCACGGGCGGTGGGCTATGCTGGGAGCCTTTGGCTGCATCACCCCA
genomic: CAGGATTATCAGCTGACCCAGAAGCCTTTGCCAGGAACAGGGCCCTTGAGgtaattcaaa ... catgttgtagGTAATCCACGGGCGGTGGGCTATGCTGGGAGCCTTTGGCTGCATCACCCCA
EST: gi|351015406|gb|FQ447235.1|FQ447235
EST:     CAGGATTATCAGCTGACCCAGAAGCCTTTGCCAGGAACAGGGCCCTTGAG                         GTAATCCACGGGCGGTGGGCTATGCTGGGAGCCTTTGGCTGCATCACCCCA
genomic: CAGGATTATCAGCTGACCCAGAAGCCTTTGCCAGGAACAGGGCCCTTGAGgtaattcaaa ... catgttgtagGTAATCCACGGGCGGTGGGCTATGCTGGGAGCCTTTGGCTGCATCACCCCA
EST: gi|110373339|gb|EC937565.1|EC937565
EST:     CAGGATTATCAGCTGACCCAGAAGCCTTTGCCAGGAACAGGGCCCTTGAG                         GTAATCCACGGGCGGTGGGCTATGCTGGGAGCCTTTGGCTGCATCACCCCA
genomic: CAGGATTATCAGCTGACCCAGAAGCCTTTGCCAGGAACAGGGCCCTTGAGgtaattcaaa ... catgttgtagGTAATCCACGGGCGGTGGGCTATGCTGGGAGCCTTTGGCTGCATCACCCCA
EST: gi|349818974|gb|FQ411669.1|FQ411669
EST:     CAGGATTATCAGCTGACCCAGAAGCCTTTGCCAGGAACAGGGCCCTTGAG                         GTAATCCACGGGCGGTGGGCTATGCTGGGAGCCTTTGGCTGCATCACCCCA
genomic: CAGGATTATCAGCTGACCCAGAAGCCTTTGCCAGGAACAGGGCCCTTGAGgtaattcaaa ... catgttgtagGTAATCCACGGGCGGTGGGCTATGCTGGGAGCCTTTGGCTGCATCACCCCA
EST: gi|351034800|gb|FQ458157.1|FQ458157
EST:     CAGGATTATCAGCTGACCCAGAAGCCTTTGCCAGGAACAGGGCCCTTGAG                         GTAATCCACGGGCGGTGGGCTATGTTGGGAGCCTTTGACTGCATCACCCCA
genomic: CAGGATTATCAGCTGACCCAGAAGCCTTTGCCAGGAACAGGGCCCTTGAGgtaattcaaa ... catgttgtagGTAATCCACGGGCGGTGGGCTATGCTGGGAGCCTTTGGCTGCATCACCCCA
EST: gi|349825524|gb|FQ419441.1|FQ419441
EST:     CAGGATTATCAGCTGACCCAGGAGCCTTTGCCAGGAACAGGGCCCTTGAG                         GTAATCCACGGGCGGTGGGCTATGCTGGGAGCCTTTGGCTGCATCACCCCA
genomic: CAGGATTATCAGCTGACCCAGAAGCCTTTGCCAGGAACAGGGCCCTTGAGgtaattcaaa ... catgttgtagGTAATCCACGGGCGGTGGGCTATGCTGGGAGCCTTTGGCTGCATCACCCCA
EST: gi|349818568|gb|FQ403203.1|FQ403203
EST:     CAGGATTATCAGCTGACCCAGAAGCCTTTGCCAGGAACAGGGCCCTTGAG                         GTAATCCACGGGCGGTGGGCTATGCTGGGAGCCTTTGGCTGCATCACCCCA
genomic: CAGGATTATCAGCTGACCCAGAAGCCTTTGCCAGGAACAGGGCCCTTGAGgtaattcaaa ... catgttgtagGTAATCCACGGGCGGTGGGCTATGCTGGGAGCCTTTGGCTGCATCACCCCA
EST: gi|351012707|gb|FQ430270.1|FQ430270
EST:     CAGGATTATCAGCTGACCCAGAAGCCTTTGCCAGGAACAGGGCCCTTGAG                         GTAATCCACGGGCGGTGGGCTATGCTGGGAGCCTTTGGCTGCATCACCCCA
genomic: CAGGATTATCAGCTGACCCAGAAGCCTTTGCCAGGAACAGGGCCCTTGAGgtaattcaaa ... catgttgtagGTAATCCACGGGCGGTGGGCTATGCTGGGAGCCTTTGGCTGCATCACCCCA
EST: gi|349815702|gb|FQ400858.1|FQ400858
EST:     CAGGATTATCAGCTGACCCAGAAGCCTTTGCCAGGAACAGGGCCCTTGAG                         GTAATCCACGGGCGGTGGGCTATGCTGGGAGCCTTTGGCTGCATCACCCCA
genomic: CAGGATTATCAGCTGACCCAGAAGCCTTTGCCAGGAACAGGGCCCTTGAGgtaattcaaa ... catgttgtagGTAATCCACGGGCGGTGGGCTATGCTGGGAGCCTTTGGCTGCATCACCCCA
EST: gi|110685721|gb|EE062690.1|EE062690
EST:     CAGGATTATCAGCTGACCCAGAAGCCTTTGCCAGGAACAGGGCCCTTGAG                         GTAATCCACGGGCGGTGGGCTATGCTGGGAGCCTTTGGCTGCATCACCCCA
genomic: CAGGATTATCAGCTGACCCAGAAGCCTTTGCCAGGAACAGGGCCCTTGAGgtaattcaaa ... catgttgtagGTAATCCACGGGCGGTGGGCTATGCTGGGAGCCTTTGGCTGCATCACCCCA
EST: gi|77585849|gb|DV222029.1|DV222029
EST:     CAGGATTATCAGCTGACCCAGAAGCCTTTGCCAGGAACAGGGCCCTTGAG                         GTAATCCACGGGCGGTGGGCTATGCTGGGAGCCTTTGGCTGCATCACCCCA
genomic: CAGGATTATCAGCTGACCCAGAAGCCTTTGCCAGGAACAGGGCCCTTGAGgtaattcaaa ... catgttgtagGTAATCCACGGGCGGTGGGCTATGCTGGGAGCCTTTGGCTGCATCACCCCA
EST: gi|351030773|gb|FQ438611.1|FQ438611
EST:     CAGGATTATCAGCTGACCCAGAAGCCTTTGCCAGGAACAGGGCCCTTGAG                         GTAATCCACGGGCGGTGGGCTATGCTGGGAGCCTTTGGCTGCATCACCCCA
genomic: CAGGATTATCAGCTGACCCAGAAGCCTTTGCCAGGAACAGGGCCCTTGAGgtaattcaaa ... catgttgtagGTAATCCACGGGCGGTGGGCTATGCTGGGAGCCTTTGGCTGCATCACCCCA
EST: gi|110727164|gb|EE103613.1|EE103613
EST:     CAGGATTATCAGCTGACCCAGAAGCCTTTGCCAGGAACAGGGCCCTTGAG                         GTAATCCACGGGCGGTGGGCTATGCTGGGAGCCTTTGGCTGCATCACCCCA
genomic: CAGGATTATCAGCTGACCCAGAAGCCTTTGCCAGGAACAGGGCCCTTGAGgtaattcaaa ... catgttgtagGTAATCCACGGGCGGTGGGCTATGCTGGGAGCCTTTGGCTGCATCACCCCA
EST: gi|351041933|gb|FQ456143.1|FQ456143
EST:     CAGGATTATCAGCTGACCCAGAAGCCTTTGCCAGGAACAGGGCCCTTGAG                         GTAATCCACGGGCGGTGGGCTATGCTGGGAGCCTTTGGCTGCATCACCCCA
genomic: CAGGATTATCAGCTGACCCAGAAGCCTTTGCCAGGAACAGGGCCCTTGAGgtaattcaaa ... catgttgtagGTAATCCACGGGCGGTGGGCTATGCTGGGAGCCTTTGGCTGCATCACCCCA


 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

Intronic sequence truncated to 55 bases.

ttgccaagtgccaacaatgccggaaatggtaaattgtctgtgaaccatgttgtagGTAATCCACGGGCGGTGGGCTATGCTGGGAGCCTTTGGCTGCATCACCCCAGAAGTTCTTGAGAAGTGGGTGAAGGTGGACTTCAAGGAACCAGTTTGGT
                             taaattgt  TA-rich tract
















Putative cis-regulatory sequences

 atgc intron ATGC exonic elements by Pertea et al.
 ATGC exon atgc putative intronic elements
 ATGC putative exonic elements identified for retained introns
        10        20        30        40        50        60        70        80        90        100       110       120       130       140       150       160       170       180       190       200       210       220 
---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| 
gtaattcaaattcttcctcctgtaatctgatctgcattgccaagtgccaacaatgccggaaatggtaaattgtctgtgaaccatgttgtagGTAATCCACGGGCGGTGGGCTATGCTGGGAGCCTTTGGCTGCATCACCCCAGAAGTTCTTGAGAAGTGGGTGAAGGTGGACTTCAAGGAACCAGTTTGGT

- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -  AGAAGT
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - AGAAGT
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -  GGTGGA
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -  AAGGAA