1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' | 8 5' 3' | 9 5' 3' | 10 5' 3' | 11 5' 3' | 12 5' 3' | 13 5' 3' |
gtaagtactgcttttttcacccatatgctagaccatggttattgtggttcaaataatgtgcagactttcaaatactaaaaagcattataaattggtcatgtttttatatagGTAGCTCGTGGTGATAGAAGTGGACAGGATGGTATTCCTATGCTACTGAAGATCCCCCGCATGTTTGATCCATGGGGTGGTTACAGTATCATTGGCTTTG
species | Vitis vinifera |
transcript | Vv02s0025g03400.t01 |
intron # | 10 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: TTTGGGTGTTCGTTTCTAAAAAGCTGTTCCATGAAAGTGTGATGATTGTG GTAGCTCGTGGTGATAGAAGTGGACAGGATGGTATTCCTATGCTACTGAAGEST: gi|30129909|gb|CB915248.1|CB915248
genomic: TTTGGGTGTTCGTTTCTAAAAAGCTGTTCCATGAAAGTGTGATGATTGTGgtaagtactg ... ttttatatagGTAGCTCGTGGTGATAGAAGTGGACAGGATGGTATTCCTATGCTACTGAAG
EST: TTTGGGTGTTCGTTTCTAAAAAGCTGTTCCATGAAAGTGTGATGATTGTG GTAGCTCGTGGTGATAGAAGTGGACAGGATGGTATTCCTATGCTACTGAAGEST: gi|32245741|gb|CD711560.1|CD711560
genomic: TTTGGGTGTTCGTTTCTAAAAAGCTGTTCCATGAAAGTGTGATGATTGTGgtaagtactg ... ttttatatagGTAGCTCGTGGTGATAGAAGTGGACAGGATGGTATTCCTATGCTACTGAAG
EST: TTTGGGTGTTCGTTTCTAAAAAGCTGTTCCATGAAAGTGTGATGATTGTG GTAGCTCGGGGTGATAGAAGTGGACAGGATGGTATTCCTATGCTACTGAAGEST: gi|110362845|gb|EC926402.1|EC926402
genomic: TTTGGGTGTTCGTTTCTAAAAAGCTGTTCCATGAAAGTGTGATGATTGTGgtaagtactg ... ttttatatagGTAGCTCGTGGTGATAGAAGTGGACAGGATGGTATTCCTATGCTACTGAAG
EST: TTTGGGTGTTCGTTTCTAAAAAGCTGTTCCATGAAAGTGTGATGATTGTG GTAGCTCGTGGTGATAGAAGTGGACAGGATGGTATTCCTATGCTACTGAAGEST: gi|110716312|gb|EE091183.1|EE091183
genomic: TTTGGGTGTTCGTTTCTAAAAAGCTGTTCCATGAAAGTGTGATGATTGTGgtaagtactg ... ttttatatagGTAGCTCGTGGTGATAGAAGTGGACAGGATGGTATTCCTATGCTACTGAAG
EST: TTTGGGTGTTCGTTTCTAAAAAGCTGTTCCATGAAAGTGTGATGATTGTG GTAGCTCGTGGTGATAGAAGTGGACAGGATGGTATTCCTATGCTACTGAAGEST: gi|32246367|gb|CD712186.1|CD712186
genomic: TTTGGGTGTTCGTTTCTAAAAAGCTGTTCCATGAAAGTGTGATGATTGTGgtaagtactg ... ttttatatagGTAGCTCGTGGTGATAGAAGTGGACAGGATGGTATTCCTATGCTACTGAAG
EST: TTTGGGTGTTCGTTTCTAAAAAGCTGTTCCATGAAAGTGTGATGATTGTG GTAGCTCGGGGTGATAGAAGTGGACAGGATGGTATTCCTATGCTACTGAAGEST: gi|110687575|gb|EE065143.1|EE065143
genomic: TTTGGGTGTTCGTTTCTAAAAAGCTGTTCCATGAAAGTGTGATGATTGTGgtaagtactg ... ttttatatagGTAGCTCGTGGTGATAGAAGTGGACAGGATGGTATTCCTATGCTACTGAAG
EST: TTTGGGTGTTCGTTTCTAAAAAGCTGTTCCATGAAAGTGTGATGATTGTG GTAGCTCGTGGTGATAGAAGTGGACAGGATGGTATTCCTATGCTACTGAAG
genomic: TTTGGGTGTTCGTTTCTAAAAAGCTGTTCCATGAAAGTGTGATGATTGTGgtaagtactg ... ttttatatagGTAGCTCGTGGTGATAGAAGTGGACAGGATGGTATTCCTATGCTACTGAAG
tgtgcagactttcaaatactaaaaagcattataaattggtcatgtttttatatagGTAGCTCGTGGTGATAGAAGTGGACAGGATGGTATTCCTATGCTACTGAAGATCCCCCGCATGTTTGATCCATGGGGTGGTTACAGTATCATTGGCTTTG
tactaaa putative branch site (score: 1)
tgttttt putative PPT
tttcaaatactaaaaa TA-rich tract