Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   
2  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

...gatgttctgtactataccttcaattcagaaatgagtttatgatgatacagggaaatttgcttcttaaaatgttaaattttttatttggttctgggtgcagACTGTTGTCCTCAAGGTTGGTATGTCATGCGAAGGCTGTGTTGGGGCCGTTAAGAGGGTTCTTGGCAAAATGGAAG

Basic information

species Vitis vinifera
transcript Vv13s0074g00770.t01
intron # 1
splice site 3'
intron type U2

Orthologous splice sites


 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence


upper sequence: Vv13s0074g00770.t01 (Vitis vinifera), 3'ss of exon 1
lower sequence: LOC_Os08g10480.1 (Oryza sativa), 3'ss of exon 1
gatgttctgtactataccttcaattcagaaatgagtttatgatgatacagggaaatttgcttcttaaaatgttaaattttt--tatttggttctgg-gtgcagACTGTTGTCCTCAAGGTTGGTATGTCATGCGAAGGCTGTGTTGGGGCCGTTAAGAGGGTTCTTGGCAAAATGGAAG
| | | | || | | | | || | || ||| | | | | | || || ||||| ||| |||||||||||||| |||| |||||| ||||| || ||||| |||||||| || |||||| |||| || || || ||| |||
---gaattatgatgtattccgagtaccatgtggcgtgtgcgaagatgtgattgaggacgaatgaggacttagctgatccttgctatttttgtctattgtgcagACTGTTGTGCTCAGGGTTGGGATGTCCTGTGAAGGTTGTGTTGGAGCTGTTAAGCGGGTACTGGGAAAGATGCAAG

upper sequence: Vv13s0074g00770.t01 (Vitis vinifera), 3'ss of exon 1
lower sequence: GLYMA02G19380.1 (Glycine max), 3'ss of exon 1
------gatgttctgtactataccttcaat-tcagaaatgagtttatgatgatacagggaaatttgcttcttaaaatgttaaattttttatttggttctgggtgcagACTGTTGTCCTCAAGGTTGGTATGTCATGCGAAGGCTGTGTTGGGGCCGTTAAGAGGGTTCTTGGCAAAATGGAAG
|| |||| | ||| | | || | || | || || || | |||| ||| | | | || ||| ||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||| ||| || || || |||||| | || ||||||||||
agttatgaatttcttttatatgtgggtgttgttggagttaagatgattatt-tatgcttttctctgctccttcag-tctgaattttcccatta-----tggttgcagACTGTTGTCCTCAAAGTTGGTATGTCATGTCAAGGGTGTGCTGGAGCAGTGAACAGGGTTTTGGGAAAAATGGAAG

upper sequence: Vv13s0074g00770.t01 (Vitis vinifera), 3'ss of exon 1
lower sequence: GLYMA10G14110.1 (Glycine max), 3'ss of exon 1
gatgttctgtactataccttcaattcagaaatgagtttatgatgatacagggaaatttgcttcttaaaatgttaaattt--tttatttggttctgggtgcagACTGTTGTCCTCAAGGTTGGTATGTCATGCGAAGGCTGTGTTGGGGCCGTTAAGAGGGTTCTTGGCAAAATGGAAG
|| || | | | || | | | | | ||| |||||| | || |||| |||| | | || | || ||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||| |||| ||| || || || |||||| | | ||||||||||
gaatttgtttcttttatatatgggtgatgttgggggttaagatgattatttaatgctt--ttctctgctccttaagtctgaattttcccattatggttgcagACCGTTGTCCTCAAAGTTGGTATGTCATGTCAAGGGTGTGCTGGAGCTGTAAACAGGGTTTTGGAAAAAATGGAAG

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|161710909|gb|FC058190.1|FC058190
EST:     GGTTTGGGCTTTTCTTCTGAC-AATTCATACTCATGGCTCAG                         ACTGTTGTCCTCAAGGTTGGTATGTCATGCGAAGGCTGTGTTGGGGCCGTT
genomic: GGTTTGGGCTTTTCTTCTGACTAATTCATACTCATGGCTCAGgtacaccaaa ... ctgggtgcagACTGTTGTCCTCAAGGTTGGTATGTCATGCGAAGGCTGTGTTGGGGCCGTT
EST: gi|110714933|gb|EE092406.1|EE092406
EST:     TTTCTTCCGACTAATTCATCCTCATGGCTCAG                         ACTGTTGTCCTCAAGGTTGGTATGTCATGCGAAGGCTGTGTTGGGGCCGTT
genomic: TTTCTTCTGACTAATTCATACTCATGGCTCAGgtacaccaaa ... ctgggtgcagACTGTTGTCCTCAAGGTTGGTATGTCATGCGAAGGCTGTGTTGGGGCCGTT
EST: gi|349823404|gb|FQ423215.1|FQ423215
EST:     GGTTTGGTCTTTTCTTCCGACTAATTCATCCTCATGGCTCAG                         ACTGTTGTCCTCAAGGTTGGTATGTCATGCGAAGGCTGTGTTGGGGCCGTT
genomic: GGTTTGGGCTTTTCTTCTGACTAATTCATACTCATGGCTCAGgtacaccaaa ... ctgggtgcagACTGTTGTCCTCAAGGTTGGTATGTCATGCGAAGGCTGTGTTGGGGCCGTT
EST: gi|352778025|gb|FQ467078.1|FQ467078
EST:     GGTTTGGGCTTTTCTTCTGACTAATTCATACTCATGGCTCAG                         ACTGTTGTCCTCAAGGTTGGTATGTCATGCGAAGGCTGTGTTGGGGCCGTT
genomic: GGTTTGGGCTTTTCTTCTGACTAATTCATACTCATGGCTCAGgtacaccaaa ... ctgggtgcagACTGTTGTCCTCAAGGTTGGTATGTCATGCGAAGGCTGTGTTGGGGCCGTT
EST: gi|110717068|gb|EE092611.1|EE092611
EST:     GGTTTGGGCTTTTCTTCTGACTAATTCATACTCATGGCTCAG                         ACTGTTGTCCTCAAGGTTGGTATGTCATGCGAAGGCTGTGTTGGGGCCGTT
genomic: GGTTTGGGCTTTTCTTCTGACTAATTCATACTCATGGCTCAGgtacaccaaa ... ctgggtgcagACTGTTGTCCTCAAGGTTGGTATGTCATGCGAAGGCTGTGTTGGGGCCGTT
EST: gi|110715342|gb|EE093279.1|EE093279
EST:     GGTTTGGGCTTTTCTTCTGACTAATTCATACTCATGGCTCAG                         ACTGTTGTCCTCAAGGTTGGTATGTCATGCGAAGGCTGTGTTGGGGCCGTT
genomic: GGTTTGGGCTTTTCTTCTGACTAATTCATACTCATGGCTCAGgtacaccaaa ... ctgggtgcagACTGTTGTCCTCAAGGTTGGTATGTCATGCGAAGGCTGTGTTGGGGCCGTT
EST: gi|110693686|gb|EE070133.1|EE070133
EST:     GGTTTGGGCTTTTCTTCTGACTAATTCATACTCATGGCTCAG                         ACTGTTGTCCTCAAGGTTGGTATGTCATGCGAAGGCTGTGTTGGGGCCGTT
genomic: GGTTTGGGCTTTTCTTCTGACTAATTCATACTCATGGCTCAGgtacaccaaa ... ctgggtgcagACTGTTGTCCTCAAGGTTGGTATGTCATGCGAAGGCTGTGTTGGGGCCGTT
EST: gi|110379766|gb|EC944985.1|EC944985
EST:     TTTTTTGGTTTGGGCTTTTCTTCTGACTAATTCATACTCATGGCTCAG                         ACTGTTGTCCTCAAGGTTGGTATGTCATGCGAAGGCTGTGTTGGGGCCGTT
genomic: TTTTTTGGTTTGGGCTTTTCTTCTGACTAATTCATACTCATGGCTCAGgtacaccaaa ... ctgggtgcagACTGTTGTCCTCAAGGTTGGTATGTCATGCGAAGGCTGTGTTGGGGCCGTT
EST: gi|110410064|gb|EC975740.1|EC975740
EST:     GGTTTGGGCTTTTCTTCTGACTAATTCATACTCATGGCTCAG                         ACTGTTGTCCTCAAGGTTGGTATGTCATGCGAAGGCTGTGTTGGGGCCGTT
genomic: GGTTTGGGCTTTTCTTCTGACTAATTCATACTCATGGCTCAGgtacaccaaa ... ctgggtgcagACTGTTGTCCTCAAGGTTGGTATGTCATGCGAAGGCTGTGTTGGGGCCGTT
EST: gi|110731134|gb|EE109010.1|EE109010
EST:     GCTTTTCTTCTGACTAATTCATACTCATGGCTCAG                         ACTGTTGTCCTCAAGGTTGGTATGTCATGCGAAGGCTGTGTTGGGGCCGTT
genomic: GCTTTTCTTCTGACTAATTCATACTCATGGCTCAGgtacaccaaa ... ctgggtgcagACTGTTGTCCTCAAGGTTGGTATGTCATGCGAAGGCTGTGTTGGGGCCGTT
EST: gi|352777092|gb|FQ474399.1|FQ474399
EST:     GGTTTGGGCTTTTCTTCTGACTAATTCATACTCATGGCTCAG                         ACTGTTGTCCTCAAGGTTGGTATGTCATGCGAAGGCTGTGTTGGGGCCGTT
genomic: GGTTTGGGCTTTTCTTCTGACTAATTCATACTCATGGCTCAGgtacaccaaa ... ctgggtgcagACTGTTGTCCTCAAGGTTGGTATGTCATGCGAAGGCTGTGTTGGGGCCGTT
EST: gi|349830229|gb|FQ420489.1|FQ420489
EST:     C-TTTTTTGGTTTGGTCTTTTCTTCCGACTAATTCATCCTCATGGCTCAG                         ACTGTTGTCCTCAAGGTTGGTATGTCATGCGAAGGCTGTGTTGGGGCCGTT
genomic: CTTTTTTTGGTTTGGGCTTTTCTTCTGACTAATTCATACTCATGGCTCAGgtacaccaaa ... ctgggtgcagACTGTTGTCCTCAAGGTTGGTATGTCATGCGAAGGCTGTGTTGGGGCCGTT
EST: gi|351025239|gb|FQ433656.1|FQ433656
EST:     GGTTTGGTCTTTTCTTCCGACTAATTCATCCTCATGGCTCAG                         ACTGTTGTCCTCAAGGTTGGTATGTCATGCGAAGGCTGTGTTGGGGCCGTT
genomic: GGTTTGGGCTTTTCTTCTGACTAATTCATACTCATGGCTCAGgtacaccaaa ... ctgggtgcagACTGTTGTCCTCAAGGTTGGTATGTCATGCGAAGGCTGTGTTGGGGCCGTT
EST: gi|110723932|gb|EE099315.1|EE099315
EST:     CTTTTCTTCTGACTAATTCATACTCATGGCTCAG                         ACTGTTGTCCTCAAGGTTGGTATGTCATGCGAAGGCTGTGTTGGGGCCGTT
genomic: CTTTTCTTCTGACTAATTCATACTCATGGCTCAGgtacaccaaa ... ctgggtgcagACTGTTGTCCTCAAGGTTGGTATGTCATGCGAAGGCTGTGTTGGGGCCGTT
EST: gi|351014731|gb|FQ437931.1|FQ437931
EST:     GGTTTGGTCTTTTCTTCCGACTAATTCATCCTCATGGCTCAG                         ACTGTTGTCCTCAAGGTTGGTATGTCATGCGAAGGCTGTGTTGGGGCCGTT
genomic: GGTTTGGGCTTTTCTTCTGACTAATTCATACTCATGGCTCAGgtacaccaaa ... ctgggtgcagACTGTTGTCCTCAAGGTTGGTATGTCATGCGAAGGCTGTGTTGGGGCCGTT
EST: gi|351020211|gb|FQ445818.1|FQ445818
EST:     GGTTTGGTCTTTTCTTCCGACTAATTCATCCTCATGGCTCAG                         ACTGTTGTCCTCAAGGTTGGTATGTCATGCGAAGGCTGTGTTGGGGCCGTT
genomic: GGTTTGGGCTTTTCTTCTGACTAATTCATACTCATGGCTCAGgtacaccaaa ... ctgggtgcagACTGTTGTCCTCAAGGTTGGTATGTCATGCGAAGGCTGTGTTGGGGCCGTT
EST: gi|349828551|gb|FQ417293.1|FQ417293
EST:     GGTTTGGTCTTTTCTTCCGACTAATTCATCCTCATGGCTCAG                         ACTGTTGTCCTCAAGGTTGGTATGTCATGCGAAGGCTGTGTTGGGGCCGTT
genomic: GGTTTGGGCTTTTCTTCTGACTAATTCATACTCATGGCTCAGgtacaccaaa ... ctgggtgcagACTGTTGTCCTCAAGGTTGGTATGTCATGCGAAGGCTGTGTTGGGGCCGTT
EST: gi|18459502|gb|BM437780.1|BM437780
EST:     CTTTTCTTCCGACTAATTCATCCTCATGGCTCAG                         ACTGTTGTCCTCAAGGTTGGTATGTCATGCGAAGGCTGTGTTGGGGCCGTT
genomic: CTTTTCTTCTGACTAATTCATACTCATGGCTCAGgtacaccaaa ... ctgggtgcagACTGTTGTCCTCAAGGTTGGTATGTCATGCGAAGGCTGTGTTGGGGCCGTT
EST: gi|349828336|gb|FQ416289.1|FQ416289
EST:     GGTTTGGTCTTTTCTTCCGACTAATTCATCCTCATGGCTCAG                         ACTGTTGTCCTCAAGGTTGGTATGTCATGCGAAGGCTGTGTTGGGGCCGTT
genomic: GGTTTGGGCTTTTCTTCTGACTAATTCATACTCATGGCTCAGgtacaccaaa ... ctgggtgcagACTGTTGTCCTCAAGGTTGGTATGTCATGCGAAGGCTGTGTTGGGGCCGTT
EST: gi|110393025|gb|EC957826.1|EC957826
EST:     GGTTTGGGCTTTTCTTCTGACTAATTCATACTCATGGCTCAG                         ACTGTTGTCCTCAAGGTTGGTATGTCATGCGAAGGCTGTGTTGGGGCCGTT
genomic: GGTTTGGGCTTTTCTTCTGACTAATTCATACTCATGGCTCAGgtacaccaaa ... ctgggtgcagACTGTTGTCCTCAAGGTTGGTATGTCATGCGAAGGCTGTGTTGGGGCCGTT
EST: gi|351017049|gb|FQ424476.1|FQ424476
EST:     GGTTTGGTCTTTTCTTCCGACTAATTCATCCTCATGGCTCAG                         ACTGTTGTCCTCAAGGTTGGTATGTCATGCGAAGGCTGTGTTGGGGCCGTT
genomic: GGTTTGGGCTTTTCTTCTGACTAATTCATACTCATGGCTCAGgtacaccaaa ... ctgggtgcagACTGTTGTCCTCAAGGTTGGTATGTCATGCGAAGGCTGTGTTGGGGCCGTT
EST: gi|351024788|gb|FQ430613.1|FQ430613
EST:     GGTTTGGTCTTTTCTTCCGACTAATTCATCCTCATGGCTCAG                         ACTGTTGTCCTCAAGGTTGGTATGTCATGCGAAGGCTGTGTTGGGGCCGTT
genomic: GGTTTGGGCTTTTCTTCTGACTAATTCATACTCATGGCTCAGgtacaccaaa ... ctgggtgcagACTGTTGTCCTCAAGGTTGGTATGTCATGCGAAGGCTGTGTTGGGGCCGTT
EST: gi|349829172|gb|FQ419692.1|FQ419692
EST:     GGTTTGGTCTTTTCTTCCGACTAATTCATCCTCATGGCTCAG                         ACTGTTGTCCTCAAGGTTGGTATGTCATGCGAAGGCTGTGTTGGGGCCGTT
genomic: GGTTTGGGCTTTTCTTCTGACTAATTCATACTCATGGCTCAGgtacaccaaa ... ctgggtgcagACTGTTGTCCTCAAGGTTGGTATGTCATGCGAAGGCTGTGTTGGGGCCGTT
EST: gi|110692585|gb|EE071999.1|EE071999
EST:     CTTTTCTTCTGACTAATTCATACTCATGGCTCAG                         ACTGTTGTCCTCAAGGTTGGTATGTCATGCGAAGGCTGTGTTGGGGCCGTT
genomic: CTTTTCTTCTGACTAATTCATACTCATGGCTCAGgtacaccaaa ... ctgggtgcagACTGTTGTCCTCAAGGTTGGTATGTCATGCGAAGGCTGTGTTGGGGCCGTT
EST: gi|351040574|gb|FQ438118.1|FQ438118
EST:     GGTTTGGTCTTTTCTTCCGACTAATTCATCCTCATGGCTCAG                         ACTGTTGTCCTCAAGGTTGGTATGTCATGCGAAGGCTGTGTTGGGGCCGTT
genomic: GGTTTGGGCTTTTCTTCTGACTAATTCATACTCATGGCTCAGgtacaccaaa ... ctgggtgcagACTGTTGTCCTCAAGGTTGGTATGTCATGCGAAGGCTGTGTTGGGGCCGTT
EST: gi|110691593|gb|EE069871.1|EE069871
EST:     GGTTTGGGCTTTTCTTCTGACTAATTCATACTCATGGCTCAG                         ACAGTTGTCCTCAAGGTTGGTATGTCATGCGAAGGCTGTGTTGGGGCCGTT
genomic: GGTTTGGGCTTTTCTTCTGACTAATTCATACTCATGGCTCAGgtacaccaaa ... ctgggtgcagACTGTTGTCCTCAAGGTTGGTATGTCATGCGAAGGCTGTGTTGGGGCCGTT
EST: gi|110691629|gb|EE069947.1|EE069947
EST:     GGTTTGGGCTTTTCTTCTGACTAATTCATACTCATGGCTCAG                         ACTGTTGTCCTCAAGGTTGGTATGTCATGCGAAGGCTGTGTTGGGGCCGTT
genomic: GGTTTGGGCTTTTCTTCTGACTAATTCATACTCATGGCTCAGgtacaccaaa ... ctgggtgcagACTGTTGTCCTCAAGGTTGGTATGTCATGCGAAGGCTGTGTTGGGGCCGTT
EST: gi|110401154|gb|EC967750.1|EC967750
EST:     GGTTTGGGCTTTTCTTCTGACTAATTCATACTCATGGCTCAG                         ACTGTTGTCCTCAAGGTTGGTATGTCATGCGAAGGCTGTGTTGGGGCCGTT
genomic: GGTTTGGGCTTTTCTTCTGACTAATTCATACTCATGGCTCAGgtacaccaaa ... ctgggtgcagACTGTTGTCCTCAAGGTTGGTATGTCATGCGAAGGCTGTGTTGGGGCCGTT
EST: gi|351016522|gb|FQ423949.1|FQ423949
EST:     GGTTTGGTCTTTTCTTCCGACTAATTCATCCTCATGGCTCAG                         ACTGTTGTCCTCAAGGTTGGTATGTCATGCGAAGGCTGTGTTGGGGCCGTT
genomic: GGTTTGGGCTTTTCTTCTGACTAATTCATACTCATGGCTCAGgtacaccaaa ... ctgggtgcagACTGTTGTCCTCAAGGTTGGTATGTCATGCGAAGGCTGTGTTGGGGCCGTT
EST: gi|349828899|gb|FQ419232.1|FQ419232
EST:     GGTTTGGTCTTTTCTTCCGACTAATTCATCCTCATGGCTCAG                         ACTGTTGTCCTCAAGGTTGGTATGTCATGCGAAGGCTGTGTTGGGGCCGTT
genomic: GGTTTGGGCTTTTCTTCTGACTAATTCATACTCATGGCTCAGgtacaccaaa ... ctgggtgcagACTGTTGTCCTCAAGGTTGGTATGTCATGCGAAGGCTGTGTTGGGGCCGTT
EST: gi|110733051|gb|EE108872.1|EE108872
EST:     CTTTTCTTCTGACTAATTCATACTCATGGCTCAG                         ACTGTTGTCCTCAAGGTTGGTATGTCATGCGAAGGCTGTGTTGGGGCCGTT
genomic: CTTTTCTTCTGACTAATTCATACTCATGGCTCAGgtacaccaaa ... ctgggtgcagACTGTTGTCCTCAAGGTTGGTATGTCATGCGAAGGCTGTGTTGGGGCCGTT
EST: gi|351040245|gb|FQ425331.1|FQ425331
EST:     GGTTTGGTCTTTTCTTCCGACTAATTCATCCTCATGGCTCAG                         ACTGTTGTCCTCAAGGTTGGTATGTCATGCGAAGGCTGTGTTGGGGCCGTT
genomic: GGTTTGGGCTTTTCTTCTGACTAATTCATACTCATGGCTCAGgtacaccaaa ... ctgggtgcagACTGTTGTCCTCAAGGTTGGTATGTCATGCGAAGGCTGTGTTGGGGCCGTT
EST: gi|110714050|gb|EE090529.1|EE090529
EST:     GGTTTGGTCTTTTCTTCCGACTAATTCATCCTCATGGCTCAG                         ACTGTTGTCCTCAAGGTTGGTATGTCATGCGAAGGCTGTGTTGGGGCCGTT
genomic: GGTTTGGGCTTTTCTTCTGACTAATTCATACTCATGGCTCAGgtacaccaaa ... ctgggtgcagACTGTTGTCCTCAAGGTTGGTATGTCATGCGAAGGCTGTGTTGGGGCCGTT
EST: gi|110407111|gb|EC972706.1|EC972706
EST:     TTTTCTTCTGACTAATTCATACTCATGGCTCAG                         ACTGTTGTCCTCAAGGTTGGTATGTCATGCGAAGGCTGTGTTGGGGCCGTT
genomic: TTTTCTTCTGACTAATTCATACTCATGGCTCAGgtacaccaaa ... ctgggtgcagACTGTTGTCCTCAAGGTTGGTATGTCATGCGAAGGCTGTGTTGGGGCCGTT
EST: gi|110373555|gb|EC937801.1|EC937801
EST:     TTGGTTTGGGCTTTTCTTCTGACTAATTCATACTCATGGCTCAG                         ACTGTTGTCCTCAAGGTTGGTATGTCATGCGAAGGCTGTGTTGGGGCCGTT
genomic: TTGGTTTGGGCTTTTCTTCTGACTAATTCATACTCATGGCTCAGgtacaccaaa ... ctgggtgcagACTGTTGTCCTCAAGGTTGGTATGTCATGCGAAGGCTGTGTTGGGGCCGTT
EST: gi|77577974|gb|DV217750.1|DV217750
EST:     GCTTTTCTTCTGACTAATTCATACTCATGGCTCAG                         ACTGTTGTCCTCAAGGTTGGTATGTCATGCGAAGGCTGTGTTGGGGCCGTT
genomic: GCTTTTCTTCTGACTAATTCATACTCATGGCTCAGgtacaccaaa ... ctgggtgcagACTGTTGTCCTCAAGGTTGGTATGTCATGCGAAGGCTGTGTTGGGGCCGTT
EST: gi|110372201|gb|EC936352.1|EC936352
EST:     TTTGGTTTGGGCTTTTCTTCTGACTAATTCATACTCATGGCTCAG                         ACTGTTGTCCTCAAGGTTGGTATGTCATGCGAAGGCTGTGTTGGGGCCGTT
genomic: TTTGGTTTGGGCTTTTCTTCTGACTAATTCATACTCATGGCTCAGgtacaccaaa ... ctgggtgcagACTGTTGTCCTCAAGGTTGGTATGTCATGCGAAGGCTGTGTTGGGGCCGTT
EST: gi|110722137|gb|EE098102.1|EE098102
EST:     GTTTGGTCTTTTCTTCCGACTAATTCATCCTCATGGCTCAG                         ACTGTTGTCCTCAAGGTTGGTATGTCATGCGAAGGCTGTGTTGGGGCCGTT
genomic: GTTTGGGCTTTTCTTCTGACTAATTCATACTCATGGCTCAGgtacaccaaa ... ctgggtgcagACTGTTGTCCTCAAGGTTGGTATGTCATGCGAAGGCTGTGTTGGGGCCGTT
EST: gi|351016334|gb|FQ446194.1|FQ446194
EST:     GGTTTGGTCTTTTCTTCCGACTAATTCATCCTCATGGCTCAG                         ACTGTTGTCCTCAAGGTTGGTATGTCATGCGAAGGCTGTGTTGGGGCCGTT
genomic: GGTTTGGGCTTTTCTTCTGACTAATTCATACTCATGGCTCAGgtacaccaaa ... ctgggtgcagACTGTTGTCCTCAAGGTTGGTATGTCATGCGAAGGCTGTGTTGGGGCCGTT
EST: gi|110367543|gb|EC931480.1|EC931480
EST:     GGTTTGGGCTTTTCTTCTGACTAATTCATACTCATGGCTCAG                         ACTGTTGTCCTCAAGGTTGGTATGTCATGCGAAGGCTGTGTTGGGGCCGTT
genomic: GGTTTGGGCTTTTCTTCTGACTAATTCATACTCATGGCTCAGgtacaccaaa ... ctgggtgcagACTGTTGTCCTCAAGGTTGGTATGTCATGCGAAGGCTGTGTTGGGGCCGTT
EST: gi|110376725|gb|EC941797.1|EC941797
EST:     TTTTTTGGTTTGGGCTTTTCTTCTGACTAATTCATACTCATGGCTCAG                         ACTGTTGTCCTCAAGGTTGGTATGTCATGCGAAGGCTGTGTTGGGGCCGTT
genomic: TTTTTTGGTTTGGGCTTTTCTTCTGACTAATTCATACTCATGGCTCAGgtacaccaaa ... ctgggtgcagACTGTTGTCCTCAAGGTTGGTATGTCATGCGAAGGCTGTGTTGGGGCCGTT
EST: gi|110374994|gb|EC939944.1|EC939944
EST:     TTTTTGGTTTGGGCTTTTCTTCTGACTAATTCATACTCATGGCTCAG                         ACTGTTGTCCTCAAGGTTGGTATGTCATGCGAAGGCTGTGTTGGGGCCGTT
genomic: TTTTTGGTTTGGGCTTTTCTTCTGACTAATTCATACTCATGGCTCAGgtacaccaaa ... ctgggtgcagACTGTTGTCCTCAAGGTTGGTATGTCATGCGAAGGCTGTGTTGGGGCCGTT
EST: gi|351041257|gb|FQ447384.1|FQ447384
EST:     GGTTTGGTCTTTTCTTCCGACTAATTCATCCTCATGGCTCAG                         ACTGTTGTCCTCAAGGTTGGTATGTCATGCGAAGGCTGTGTTGGGGCCGTT
genomic: GGTTTGGGCTTTTCTTCTGACTAATTCATACTCATGGCTCAGgtacaccaaa ... ctgggtgcagACTGTTGTCCTCAAGGTTGGTATGTCATGCGAAGGCTGTGTTGGGGCCGTT
EST: gi|110405021|gb|EC970550.1|EC970550
EST:     TTTTTTGGTTTGGTCTTTTCTTCCGACTAATTCATCCTCATGGCTCAG                         ACTGTTGTCCTCAAGGTTGGTATGTCATGCGAAGGCTGTGTTGGGGCCGTT
genomic: TTTTTTGGTTTGGGCTTTTCTTCTGACTAATTCATACTCATGGCTCAGgtacaccaaa ... ctgggtgcagACTGTTGTCCTCAAGGTTGGTATGTCATGCGAAGGCTGTGTTGGGGCCGTT
EST: gi|352776620|gb|FQ474922.1|FQ474922
EST:     GGTTTGGGCTTTTCTTCTGACTAATTCATACTCATGGCTCAG                         ACTGTTGTCCTCAAGGTTGGTATGTCATGCGAAGGCTGTGTTGGGGCCGTT
genomic: GGTTTGGGCTTTTCTTCTGACTAATTCATACTCATGGCTCAGgtacaccaaa ... ctgggtgcagACTGTTGTCCTCAAGGTTGGTATGTCATGCGAAGGCTGTGTTGGGGCCGTT
EST: gi|352774063|gb|FQ474586.1|FQ474586
EST:     GGTTTGGGCTTTTCTTCTGACTAATTCATACTCATGGCTCAG                         ACTGTTGTCCTCAAGGTTGGTATGTCATGCGAAGGCTGTGTTGGGGCCGTT
genomic: GGTTTGGGCTTTTCTTCTGACTAATTCATACTCATGGCTCAGgtacaccaaa ... ctgggtgcagACTGTTGTCCTCAAGGTTGGTATGTCATGCGAAGGCTGTGTTGGGGCCGTT
EST: gi|71857018|gb|DT006073.1|DT006073
EST:     CTTTTTTCGGTTTGGGCTTTTCTTCTGACTAATTCATACTCATGGCTCAG                         ACTGTTGTCCTCAAGGTTGGTATGTCATGCGAAGGCTGTGTTGGGGCCGTT
genomic: CTTTTTTTGGTTTGGGCTTTTCTTCTGACTAATTCATACTCATGGCTCAGgtacaccaaa ... ctgggtgcagACTGTTGTCCTCAAGGTTGGTATGTCATGCGAAGGCTGTGTTGGGGCCGTT
EST: gi|110397940|gb|EC963947.1|EC963947
EST:     TTTTGGTTTGGGCTTTTCTTCTGACTAATTCATACTCATGGCTCAG                         ACTGTTGTCCTCAAGGTTGGTATGTCATGCGAAGGCTGTGTTGGGGCCGTT
genomic: TTTTGGTTTGGGCTTTTCTTCTGACTAATTCATACTCATGGCTCAGgtacaccaaa ... ctgggtgcagACTGTTGTCCTCAAGGTTGGTATGTCATGCGAAGGCTGTGTTGGGGCCGTT
EST: gi|110379414|gb|EC944607.1|EC944607
EST:     TTTTGGTTTGGGCTTTTCTTCTGACTAATTTATACTCATGGCTCAG                         ACTGTTGTCCTCAAGGTTGGTATGTCATGCGAAGGCTGTGTTGGGGCCGTT
genomic: TTTTGGTTTGGGCTTTTCTTCTGACTAATTCATACTCATGGCTCAGgtacaccaaa ... ctgggtgcagACTGTTGTCCTCAAGGTTGGTATGTCATGCGAAGGCTGTGTTGGGGCCGTT
EST: gi|349829740|gb|FQ421258.1|FQ421258
EST:     GGTTTGGTCTTTTCTTCCGACTAATTCATCCTCATGGCTCAG                         ACTGTTGTCCTCAAGGTTGGCATGTCATGCGAAGGCTGTGTTGGGGCCGTT
genomic: GGTTTGGGCTTTTCTTCTGACTAATTCATACTCATGGCTCAGgtacaccaaa ... ctgggtgcagACTGTTGTCCTCAAGGTTGGTATGTCATGCGAAGGCTGTGTTGGGGCCGTT
EST: gi|110422501|gb|EC988826.1|EC988826
EST:     CTAATTCATACTCATGGCTCAG                         ACTGTTGTCCTCAAGGTTGGTATGTCATGCGAAGGCTGTGTTGGGGCCGTT
genomic: CTAATTCATACTCATGGCTCAGgtacaccaaa ... ctgggtgcagACTGTTGTCCTCAAGGTTGGTATGTCATGCGAAGGCTGTGTTGGGGCCGTT
EST: gi|110385916|gb|EC950476.1|EC950476
EST:     TTTTTTGGTTTGGGCTTTTCTTCTGACTAATTCATACTCATGGCTCAG                         ACTGTTGTCCTCAAGGTTGGTATGTCATGCGAAGGCTGTGTTGGGGCCGTT
genomic: TTTTTTGGTTTGGGCTTTTCTTCTGACTAATTCATACTCATGGCTCAGgtacaccaaa ... ctgggtgcagACTGTTGTCCTCAAGGTTGGTATGTCATGCGAAGGCTGTGTTGGGGCCGTT
EST: gi|351030077|gb|FQ430819.1|FQ430819
EST:     GGTTTGGTCTTTTCTTCCGACTAATTCATCCTCATGGCTCAG                         ACTGTTGTCCTCAAGGTTGGTATGTCATGCGAAGGCTGTGTTGGGGCCGTT
genomic: GGTTTGGGCTTTTCTTCTGACTAATTCATACTCATGGCTCAGgtacaccaaa ... ctgggtgcagACTGTTGTCCTCAAGGTTGGTATGTCATGCGAAGGCTGTGTTGGGGCCGTT
EST: gi|110691295|gb|EE069237.1|EE069237
EST:     GGTTTGGGCTTTTCTTCTGACTAATTCATACTCATGGCTCAG                         ACTGTTGTCCTCAAGGTTGGTATGTCATGCGAAGGCTGTGTTGGGGCCGTT
genomic: GGTTTGGGCTTTTCTTCTGACTAATTCATACTCATGGCTCAGgtacaccaaa ... ctgggtgcagACTGTTGTCCTCAAGGTTGGTATGTCATGCGAAGGCTGTGTTGGGGCCGTT
EST: gi|351029141|gb|FQ435341.1|FQ435341
EST:     GGTTTGGTCTTTTCTTCCGACTAATTCATCCTCATGGCTCAG                         ACTGTTGTCCTCAAGGTTGGTATGTCATGCGAAGGCTGTGTTGGGGCCGTT
genomic: GGTTTGGGCTTTTCTTCTGACTAATTCATACTCATGGCTCAGgtacaccaaa ... ctgggtgcagACTGTTGTCCTCAAGGTTGGTATGTCATGCGAAGGCTGTGTTGGGGCCGTT
EST: gi|18459067|gb|BM437345.1|BM437345
EST:     TTTTCTTCCGACTAATTCATCCTCATGGCTCAG                         ACTGTTGTCCTCAAGGTTGGTATGTCATGCGAAGGCTGTGTTGGGGCCGTT
genomic: TTTTCTTCTGACTAATTCATACTCATGGCTCAGgtacaccaaa ... ctgggtgcagACTGTTGTCCTCAAGGTTGGTATGTCATGCGAAGGCTGTGTTGGGGCCGTT
EST: gi|110697330|gb|EE074225.1|EE074225
EST:     GGTTTGGGCTTTTCTTCTGACTAATTCATACTCATGGCTCAA                         ACTGTTGTCCTCAAGGTTGGTATGTCATGCGAAGGCTGTGTTGGGGCCGTT
genomic: GGTTTGGGCTTTTCTTCTGACTAATTCATACTCATGGCTCAGgtacaccaaa ... ctgggtgcagACTGTTGTCCTCAAGGTTGGTATGTCATGCGAAGGCTGTGTTGGGGCCGTT
EST: gi|351040317|gb|FQ425403.1|FQ425403
EST:     GGTTTGGTCTTTTCTTCCGACTAATTCATCCTCATGGCTCAG                         ACTGTTGTCCTCAAGGTTGGTATGTCATGCGAAGGCTGTGTTGGGGCCGTT
genomic: GGTTTGGGCTTTTCTTCTGACTAATTCATACTCATGGCTCAGgtacaccaaa ... ctgggtgcagACTGTTGTCCTCAAGGTTGGTATGTCATGCGAAGGCTGTGTTGGGGCCGTT
EST: gi|349826492|gb|FQ418583.1|FQ418583
EST:     GGTTTGGTCTTTTCTTCCGACTAATTCATCCTCATGGCTCAG                         ACTGTTGTCCTCAAGGTTGGTATGTCATGCGAAGGCTGTGTTGGGGCCGTT
genomic: GGTTTGGGCTTTTCTTCTGACTAATTCATACTCATGGCTCAGgtacaccaaa ... ctgggtgcagACTGTTGTCCTCAAGGTTGGTATGTCATGCGAAGGCTGTGTTGGGGCCGTT
EST: gi|351014611|gb|FQ437613.1|FQ437613
EST:     GGTTTGGTCTTTTCTTCCGACTAATTCATCCTCATGGCTCAG                         ACTGTTGTCCTCAAGGTTGGTATGTCATGCGAAGGCCGTGTTGGGGCCGTT
genomic: GGTTTGGGCTTTTCTTCTGACTAATTCATACTCATGGCTCAGgtacaccaaa ... ctgggtgcagACTGTTGTCCTCAAGGTTGGTATGTCATGCGAAGGCTGTGTTGGGGCCGTT
EST: gi|110384486|gb|EC948926.1|EC948926
EST:     TTTTGGTTTGGGCTTTTCTTCTGACTAATTCATACTCATGGCTCAG                         ACTGTTGTCCTCAAGGTTGGTATGTCATGCGAAGGCTGTGTTGGGGCCGTT
genomic: TTTTGGTTTGGGCTTTTCTTCTGACTAATTCATACTCATGGCTCAGgtacaccaaa ... ctgggtgcagACTGTTGTCCTCAAGGTTGGTATGTCATGCGAAGGCTGTGTTGGGGCCGTT
EST: gi|349828486|gb|FQ417228.1|FQ417228
EST:     GGTTTGGTCTTTTCTTCCGACTAATTCATCCTCATGGCTCAG                         ACTGTTGTCCTCAAGGTTGGTATGTCATGCGAAGGCTGTGTTGGGGCCGTT
genomic: GGTTTGGGCTTTTCTTCTGACTAATTCATACTCATGGCTCAGgtacaccaaa ... ctgggtgcagACTGTTGTCCTCAAGGTTGGTATGTCATGCGAAGGCTGTGTTGGGGCCGTT
EST: gi|110694988|gb|EE072493.1|EE072493
EST:     GGTTTGGGCTTTTCTTCTGACTAATTCATACTCATGGCTCAG                         ACTGTTGTCCTCAAGGTTGGTATGTCATGCGAAGGCTGTGTTGGGGCCGTT
genomic: GGTTTGGGCTTTTCTTCTGACTAATTCATACTCATGGCTCAGgtacaccaaa ... ctgggtgcagACTGTTGTCCTCAAGGTTGGTATGTCATGCGAAGGCTGTGTTGGGGCCGTT
EST: gi|110691415|gb|EE069493.1|EE069493
EST:     GGTTTGGGCCTCTTCTTCTGACTAATTCATACTCATGGCTCAG                         ACTGTTGTCCTCAAGGTTGGTATGTCATGCGAAGGCTGTGTTGGGGCCGTT
genomic: GGTTTGGG-CTTTTCTTCTGACTAATTCATACTCATGGCTCAGgtacaccaaa ... ctgggtgcagACTGTTGTCCTCAAGGTTGGTATGTCATGCGAAGGCTGTGTTGGGGCCGTT
EST: gi|26258842|gb|CA809905.1|CA809905
EST:     GGTTTGGGCTTTTCTTCTGACTAATTCATACTCATGGCTCAG                         ACTGTTGTCCTCAAGGTTGGTATGTCATGCGAAGGCTGTGTTGGGGCCGTT
genomic: GGTTTGGGCTTTTCTTCTGACTAATTCATACTCATGGCTCAGgtacaccaaa ... ctgggtgcagACTGTTGTCCTCAAGGTTGGTATGTCATGCGAAGGCTGTGTTGGGGCCGTT
EST: gi|22014796|gb|BQ799830.1|BQ799830
EST:     TTTGGTTTGGGCTTTTCTTCTGACTAATTCATACTCATGGCTCAG                         ACTGTTGTCCTCAAGGTTGGTATGTCATGCGAAGGCTGTGTTGGGGCCGTT
genomic: TTTGGTTTGGGCTTTTCTTCTGACTAATTCATACTCATGGCTCAGgtacaccaaa ... ctgggtgcagACTGTTGTCCTCAAGGTTGGTATGTCATGCGAAGGCTGTGTTGGGGCCGTT
EST: gi|110413642|gb|EC979439.1|EC979439
EST:     TTTGGTTTGGTCTTTTCTTCCGACTAATTCATCCTCATGGCTCAG                         ACTGTTGTCCTCAAGGTTGGTATGTCATGCGAAGGCTGTGTTGGGGCCGTT
genomic: TTTGGTTTGGGCTTTTCTTCTGACTAATTCATACTCATGGCTCAGgtacaccaaa ... ctgggtgcagACTGTTGTCCTCAAGGTTGGTATGTCATGCGAAGGCTGTGTTGGGGCCGTT
EST: gi|110423473|gb|EC989819.1|EC989819
EST:     TTTTTGGTTTGGTCTTTTCTTCCGACTAATTCATCCTCATGGCTCAG                         ACTGTTGTCCTCAAGGTTGGTATGTCATGCGAAGGCTGTGTTGGGGCCGTT
genomic: TTTTTGGTTTGGGCTTTTCTTCTGACTAATTCATACTCATGGCTCAGgtacaccaaa ... ctgggtgcagACTGTTGTCCTCAAGGTTGGTATGTCATGCGAAGGCTGTGTTGGGGCCGTT
EST: gi|110367831|gb|EC931784.1|EC931784
EST:     TTTTTTGGTTTGGGCTTTTCTTCTGACTAATTCATACTCATGGCTCAG                         ACTGTTGTCCTCAAGGTTGGTATGTCATGCGAAGGCTGTGTTGGGGCCGTT
genomic: TTTTTTGGTTTGGGCTTTTCTTCTGACTAATTCATACTCATGGCTCAGgtacaccaaa ... ctgggtgcagACTGTTGTCCTCAAGGTTGGTATGTCATGCGAAGGCTGTGTTGGGGCCGTT
EST: gi|351031239|gb|FQ445264.1|FQ445264
EST:     GGTTTGGTCTTTTCTTCCGACTAATTCATCCTCATGGCTCAG                         ACTGTTGTCCTCAAGGTTGGTATGTCATGCGAAGGCTGTGTTGGGGCCGTT
genomic: GGTTTGGGCTTTTCTTCTGACTAATTCATACTCATGGCTCAGgtacaccaaa ... ctgggtgcagACTGTTGTCCTCAAGGTTGGTATGTCATGCGAAGGCTGTGTTGGGGCCGTT
EST: gi|18459209|gb|BM437487.1|BM437487
EST:     TTGGTTTGGTCTTTTCTTCCGACTAATTCATCCTCATGGCTCAG                         ACTGTTGTCCTCAAGGTTGGTATGTCATGCGAAGGCTGTGTTGGGGCCGTT
genomic: TTGGTTTGGGCTTTTCTTCTGACTAATTCATACTCATGGCTCAGgtacaccaaa ... ctgggtgcagACTGTTGTCCTCAAGGTTGGTATGTCATGCGAAGGCTGTGTTGGGGCCGTT
EST: gi|351012759|gb|FQ430322.1|FQ430322
EST:     GGTTTGGTCTTTTCTTCCGACTAATTCATCCTCATGGCTCAG                         ACTGTTGTCCTCAAGGTTGGTATGTCATGCGAAGGCTGTGTTGGGGCCGTT
genomic: GGTTTGGGCTTTTCTTCTGACTAATTCATACTCATGGCTCAGgtacaccaaa ... ctgggtgcagACTGTTGTCCTCAAGGTTGGTATGTCATGCGAAGGCTGTGTTGGGGCCGTT
EST: gi|110430296|gb|EC996845.1|EC996845
EST:     CTCATGGCTCAG                         ACTGTTGTCCTCAAGGTTGGTATGTCATGCGAAGGCTGTGTTGGGGCCGTT
genomic: CTCATGGCTCAGgtacaccaaa ... ctgggtgcagACTGTTGTCCTCAAGGTTGGTATGTCATGCGAAGGCTGTGTTGGGGCCGTT
EST: gi|110362868|gb|EC926426.1|EC926426
EST:     GTTTGGGCTTTTCTTCTGACTAATTCATACTCATGGCTCAG                         ACTGTTGTCCTCAAGGTTGGTATGTCATGCGAAGGCTGTGTTGGGGCCGTT
genomic: GTTTGGGCTTTTCTTCTGACTAATTCATACTCATGGCTCAGgtacaccaaa ... ctgggtgcagACTGTTGTCCTCAAGGTTGGTATGTCATGCGAAGGCTGTGTTGGGGCCGTT
EST: gi|28968047|gb|CB347080.1|CB347080
EST:     ACTCATGGCTCAG                         ACTGTTGTCCTCAAGGTTGGTATGTCATGCGAAGGCTGTGTTGGGGCCGTT
genomic: ACTCATGGCTCAGgtacaccaaa ... ctgggtgcagACTGTTGTCCTCAAGGTTGGTATGTCATGCGAAGGCTGTGTTGGGGCCGTT
EST: gi|110385655|gb|EC950200.1|EC950200
EST:     GGTTTGGGCTTTTCTTCTGACTAATTCATACTCATGGCTCAG                         ACTGTTGTCCTCAAGGTTGGTATGTCATGCGAAGGCTGTGTTGGGGCCGTT
genomic: GGTTTGGGCTTTTCTTCTGACTAATTCATACTCATGGCTCAGgtacaccaaa ... ctgggtgcagACTGTTGTCCTCAAGGTTGGTATGTCATGCGAAGGCTGTGTTGGGGCCGTT
EST: gi|351031134|gb|FQ444961.1|FQ444961
EST:     GGTTTGGTCTTTTCTTCCGACTAATTCATCCTCATGGCTCAG                         ACTGTTGTCCTCAAGGTTGGTATGTCATGCGAAGGCTGTGTTGGGGCCGTT
genomic: GGTTTGGGCTTTTCTTCTGACTAATTCATACTCATGGCTCAGgtacaccaaa ... ctgggtgcagACTGTTGTCCTCAAGGTTGGTATGTCATGCGAAGGCTGTGTTGGGGCCGTT
EST: gi|349827996|gb|FQ422864.1|FQ422864
EST:     GGTTTGGTCTTTTCTTCCGACTAATTCATCCTCATGGCTCAG                         ACTGTTGTCCTCAAGGTTGGTATGTCATGCGAAGGCTGTGTTGGGGCCGTT
genomic: GGTTTGGGCTTTTCTTCTGACTAATTCATACTCATGGCTCAGgtacaccaaa ... ctgggtgcagACTGTTGTCCTCAAGGTTGGTATGTCATGCGAAGGCTGTGTTGGGGCCGTT
EST: gi|110705707|gb|EE082865.1|EE082865
EST:     CTTTTCTTCCGACTAATTCATCCTCATGGCTCAG                         ACTGTTGTCCTCAAGGTTGGTATGTCATGCGAAGGCTGTGTTGGGGCCGTT
genomic: CTTTTCTTCTGACTAATTCATACTCATGGCTCAGgtacaccaaa ... ctgggtgcagACTGTTGTCCTCAAGGTTGGTATGTCATGCGAAGGCTGTGTTGGGGCCGTT
EST: gi|110693728|gb|EE070211.1|EE070211
EST:     GGTTTGGGCTTTTCTTCTGACTAATTCATACTCATGGCTCAG                         ACTGTTGTCCTCAAGGTTGGTATGTCATGCGAAGGCTGTGTTGGGGCCGTT
genomic: GGTTTGGGCTTTTCTTCTGACTAATTCATACTCATGGCTCAGgtacaccaaa ... ctgggtgcagACTGTTGTCCTCAAGGTTGGTATGTCATGCGAAGGCTGTGTTGGGGCCGTT
EST: gi|351033136|gb|FQ446489.1|FQ446489
EST:     GGTTTGGTCTTTTCTTCCGACTAATTCATCCTCATGGCTCAG                         ACTGTTGTCCTCAAGGTTGGTATGTCATGCGAAGGCTGTGTTGGGGCCGTT
genomic: GGTTTGGGCTTTTCTTCTGACTAATTCATACTCATGGCTCAGgtacaccaaa ... ctgggtgcagACTGTTGTCCTCAAGGTTGGTATGTCATGCGAAGGCTGTGTTGGGGCCGTT


 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

Intronic sequence truncated to 55 bases.

tacagggaaatttgcttcttaaaatgttaaattttttatttggttctgggtgcagACTGTTGTCCTCAAGGTTGGTATGTCATGCGAAGGCTGTGTTGGGGCCGTTAAGAGGGTTCTTGGCAAAATGGAAG
       aaatttgcttcttaaa  TA-rich tract
















Putative cis-regulatory sequences

 atgc intron ATGC exonic elements by Pertea et al.
 ATGC exon atgc putative intronic elements
 ATGC putative exonic elements identified for retained introns
        10        20        30        40        50        60        70        80        90        100       110       120       130       140       150       160       170       180       190       200       210       220 
---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| 
gatgttctgtactataccttcaattcagaaatgagtttatgatgatacagggaaatttgcttcttaaaatgttaaattttttatttggttctgggtgcagACTGTTGTCCTCAAGGTTGGTATGTCATGCGAAGGCTGTGTTGGGGCCGTTAAGAGGGTTCTTGGCAAAATGGAAG

- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - AAGAGG
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - TGGAAG
- - - - - - - - ccttcaa
- - - - - - - - - - - - - -gaaatga
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - agggaaa
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -aaaatgt