1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' | 8 5' 3' | 9 5' 3' | 10 5' 3' | 11 5' 3' | 12 5' 3' | 13 5' 3' | 14 5' 3' | 15 5' 3' | 16 5' 3' | 17 5' 3' | 18 5' 3' | 19 5' 3' |
gtttgtatctcctttcataggaacgatgtggttttgttttatctcctcatttaatttcagGCTTGGGCCCGGCTATGTAAATGTTTGGGTCAAGAATTTTTACCGTATATGAATGTTGTTATGCCACCCCTTCTGCGCTCTGCGCAACTTAAACCAGACG
species | Selaginella moellendorffii |
transcript | EFJ15568 |
intron # | 6 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: AGGGTGCGCACTTGGAGGATGACGATCCAACCATTAGCTACATGTTGCAG GCTTGGGCTCGGCTATGTAAATGTTTGGGTCAAGAATTTTTACCGTATATGEST: gi|169099597|gb|FE500550.1|FE500550
genomic: AGGGTGCGCACTTGGAGGATGACGATCCAACCATTAGCTACATGCTGCAGgtttgtatct ... ttaatttcagGCTTGGGCCCGGCTATGTAAATGTTTGGGTCAAGAATTTTTACCGTATATG
EST: AGGGTGCGCACTTGGAGGATGACGATCCAACCATTAGCTACATGTTGCAG GCTTGGGCTCGGCTATGTAAATGTTTGGGTCAAGAATTTTTACCGTATATGEST: gi|169076580|gb|FE484687.1|FE484687
genomic: AGGGTGCGCACTTGGAGGATGACGATCCAACCATTAGCTACATGCTGCAGgtttgtatct ... ttaatttcagGCTTGGGCCCGGCTATGTAAATGTTTGGGTCAAGAATTTTTACCGTATATG
EST: AGGGTGCGCACTTGGAGGATGACGATCCAACCATTAGCTACATGTTGCAG GCTTGGGCTCGGCTATGTAAATGTTTGGGTCAAGAATTTTTACCGTATATGEST: gi|169048415|gb|FE456324.1|FE456324
genomic: AGGGTGCGCACTTGGAGGATGACGATCCAACCATTAGCTACATGCTGCAGgtttgtatct ... ttaatttcagGCTTGGGCCCGGCTATGTAAATGTTTGGGTCAAGAATTTTTACCGTATATG
EST: AGGGTGCGCACTTGGAGGATGACGATCCAACCATTAGCTACATGTTGCAG GCTTGGGCTCGGCTATGTAAATGTTTGGGTCAAGAATTTTTACCGTATATG
genomic: AGGGTGCGCACTTGGAGGATGACGATCCAACCATTAGCTACATGCTGCAGgtttgtatct ... ttaatttcagGCTTGGGCCCGGCTATGTAAATGTTTGGGTCAAGAATTTTTACCGTATATG
tatctcctttcataggaacgatgtggttttgttttatctcctcatttaatttcagGCTTGGGCCCGGCTATGTAAATGTTTGGGTCAAGAATTTTTACCGTATATGAATGTTGTTATGCCACCCCTTCTGCGCTCTGCGCAACTTAAACCAGACG
atttaat putative branch site (score: 3)
ttttgttttatctcct CT-rich tract
ttttgttttat TA-rich tract