1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' |
...tacattggtgagttagccagatttgaagcttagccgttttgatctcctgattccaataatgtaccactctaatgtgttctttgtattttataacatgtagTTGCGGCAAGCGAAAGTGGAGGTGATGTCAGTAACCAAGAATGCCATGCGTTTTATGTTTGGATCTGGTTCACCATCTTCAGAGTCTCCCAATAGTAATT
species | Physcomitrella patens |
transcript | PP1S411_22V6.2 |
intron # | 3 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: CAAATGCTGGTGATGCTGCAATTGAAGTTGCCGAGAAAACTATGGGAGGG TTGCGGCAAGCGAAAGTGGAGGTGATGTCAGTAACCAAGAATGCCATGCGTEST: gi|162168770|gb|FC344760.1|FC344760
genomic: CAAATGCTGGTGATGCTGCAATTGAAGTTGCCGAGAAAACTATGGAAGGGgtatgactct ... taacatgtagTTGCGGCAAGCGAAAGTGGAGGTGATGTCAGTAACCAAGAATGCCATGCGT
EST: CAAATGCTGGTGATGCTGCAATTGAAGTTGCCGAGAAAACTATGGAAGGG TTGCGGCAAGCGAAAGTGGAGGTGATGTCAGTAACCAAGAATGCCATGCGT
genomic: CAAATGCTGGTGATGCTGCAATTGAAGTTGCCGAGAAAACTATGGAAGGGgtatgactct ... taacatgtagTTGCGGCAAGCGAAAGTGGAGGTGATGTCAGTAACCAAGAATGCCATGCGT
cctgattccaataatgtaccactctaatgtgttctttgtattttataacatgtagTTGCGGCAAGCGAAAGTGGAGGTGATGTCAGTAACCAAGAATGCCATGCGTTTTATGTTTGGATCTGGTTCACCATCTTCAGAGTCTCCCAATAGTAATT
ttataac putative branch site (score: 2)
ttctttgtattttata TA-rich tract