Skip to another splice site:
1  
 5'  3'   		2  
 5'  3'   		3  
 5'  3'   		4  
 5'  3'   		5  
 5'  3'   		6  
 5'  3'   		7  
 5'  3'   		8  
 5'  3'   		9  
 5'  3'   		10  
 5'  3'   		11  
 5'  3'   

Data associated with selected splice site

Sequence

 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

gtgattcttctctctgcgtgaattttctgtaattgtttttgatgccattctttttggtttttgaatagcaacgaccatcacctttgtactgtttgcgagtttttaacgtttttttttttttttttttttttttttttttggttttcttactgtgttggggagttgagaattggtgtgatttgtgcgcagGTGGATATCTATGAGTCGCGAAAGTTCATTGGTGGTAAAGTGGGGTCCTTTAAAGATAAGGATGGAAACCATATCGAGATGGGTTTACATGTCTTTTTCG

Basic information

species Physcomitrella patens
transcript PP1S277_10V6.3
intron # 2
splice site 3'
intron type U2

Mapped EST sequences

Showing partial alignments of ESTs and genomic sequences. See full alignments


 ATGC     EST sequence
 ATGC     genomic sequence (exon)
 ATGC     genomic sequence (truncated intron)


EST: gi|100389821|gb|BY971173.1|BY971173
EST:     GTCTTGCGGGCATGTCCACCGCTGTTGAGCTTCTCGAGCAAGGCCACGAG                         GTGGATATCTATGAGTCGCGAAAGTTCATTGGTGGTAAAGTGGGGTCCTTT
genomic: GTCTTGCGGGCATGTCCACCGCTGTTGAGCTTCTCGAGCAAGGCCACGAGgtgattcttc ... ttgtgcgcagGTGGATATCTATGAGTCGCGAAAGTTCATTGGTGGTAAAGTGGGGTCCTTT
EST: gi|162165520|gb|FC340631.1|FC340631
EST:     GTCTTGCGGGCATGTCCACCGCTGTCGAGCTTCTCGAGCAAGGCCACGAG                         GTGGATATCTATGAGTCGCGAAAGTTCATTGGTGGTAAAGTGGGGTCCTTT
genomic: GTCTTGCGGGCATGTCCACCGCTGTTGAGCTTCTCGAGCAAGGCCACGAGgtgattcttc ... ttgtgcgcagGTGGATATCTATGAGTCGCGAAAGTTCATTGGTGGTAAAGTGGGGTCCTTT
EST: gi|100447940|gb|CJ972239.1|CJ972239
EST:     GTCTTGCGGGCATGTCCACCGCTGTTGAGCTTCTCGAGCAAGGCCACGAG                         GTGGATATCTATGAGTCGCGAAAGTTCATTGGTGGTAAAGTGGGGTCCTTT
genomic: GTCTTGCGGGCATGTCCACCGCTGTTGAGCTTCTCGAGCAAGGCCACGAGgtgattcttc ... ttgtgcgcagGTGGATATCTATGAGTCGCGAAAGTTCATTGGTGGTAAAGTGGGGTCCTTT
EST: gi|162172589|gb|FC349362.1|FC349362
EST:     GTCTTGCGGGCATGTCCACCGCTGTCGAGCTTCTCGAGCAAGGCCACGAG                         GTGGATATCTATGAGTCGCGAAAGTTCATTGGTGGTAAAGTGGGGTCCTTT
genomic: GTCTTGCGGGCATGTCCACCGCTGTTGAGCTTCTCGAGCAAGGCCACGAGgtgattcttc ... ttgtgcgcagGTGGATATCTATGAGTCGCGAAAGTTCATTGGTGGTAAAGTGGGGTCCTTT
EST: gi|100352075|gb|BY964693.1|BY964693
EST:     GTCTTGCGGGCATGTCCACCGCTGTTGAGCTTCTCGAGCAAGGCCACGAG                         GTGGATATCTATGAGTCGCGAAAGTTCATTGGTGGTAAAGTGGGGTCCTTT
genomic: GTCTTGCGGGCATGTCCACCGCTGTTGAGCTTCTCGAGCAAGGCCACGAGgtgattcttc ... ttgtgcgcagGTGGATATCTATGAGTCGCGAAAGTTCATTGGTGGTAAAGTGGGGTCCTTT
EST: gi|18327722|gb|BJ159725.1|BJ159725
EST:     CAAGGCCACGAG                         GTGGATATCTATGAGTCGCGAAAGTTCATTGGTGGTAAAGTGGGGTCCTTT
genomic: CAAGGCCACGAGgtgattcttc ... ttgtgcgcagGTGGATATCTATGAGTCGCGAAAGTTCATTGGTGGTAAAGTGGGGTCCTTT
EST: gi|100443131|gb|BY981757.1|BY981757
EST:     GTCTTGCGGGCATGTCCACCGCTGTTGAGCTTCTCGAGCAAGGCCACGAG                         GTGGATATCTATGAGTCGCGAAAGTTCATTGGTGGTAAAGTGGGGTCCTTT
genomic: GTCTTGCGGGCATGTCCACCGCTGTTGAGCTTCTCGAGCAAGGCCACGAGgtgattcttc ... ttgtgcgcagGTGGATATCTATGAGTCGCGAAAGTTCATTGGTGGTAAAGTGGGGTCCTTT
EST: gi|100393148|gb|BY989767.1|BY989767
EST:     GGCTTGCGGGCATGTCCACCGCTGTTGAGCTTCTCGAGCAAGGCCACGAG                         GTGGATATCTATGAATCGCGAAAGTTCATTGGTGAG-AAAGGGGGGTCCCT
genomic: GTCTTGCGGGCATGTCCACCGCTGTTGAGCTTCTCGAGCAAGGCCACGAGgtgattcttc ... ttgtgcgcagGTGGATATCTATGAGTCGCGAAAGTTCATTGGTG-GTAAAGTGGGGTCC-T
EST: gi|18359480|gb|BJ191541.1|BJ191541
EST:     GTCTTGCGGGCATGTCCACCGCTGTTGAGCTTCTCGAGCAAGGCCACGAG                         GTGGGTATCTATGAGTCGCGAAAGTTCATTGGTGGTAA
genomic: GTCTTGCGGGCATGTCCACCGCTGTTGAGCTTCTCGAGCAAGGCCACGAGgtgattcttc ... ttgtgcgcagGTGGATATCTATGAGTCGCGAAAGTTCATTGGTGGTAA
EST: gi|100396902|gb|BY953885.1|BY953885
EST:     GTCTTGCGGGCATGTCCACCGCTGTTGAGCTTCTCGAGCAAGGCCACGAG                         GTGGATATCTATGAGTCGCGAAAGTTCATTGGTGGTAAAGTGGGGTCCTTT
genomic: GTCTTGCGGGCATGTCCACCGCTGTTGAGCTTCTCGAGCAAGGCCACGAGgtgattcttc ... ttgtgcgcagGTGGATATCTATGAGTCGCGAAAGTTCATTGGTGGTAAAGTGGGGTCCTTT
EST: gi|208399548|gb|DC908545.1|DC908545
EST:     GTCTTGCGGGCATGTCCACCGCTGTTGAGCTTCTCGAGCAAGGCCACGAG                         GTGGATATCTATGAGTCGCGAAAGTTCATTGGTGGTAAAGTGGGGTCCTTT
genomic: GTCTTGCGGGCATGTCCACCGCTGTTGAGCTTCTCGAGCAAGGCCACGAGgtgattcttc ... ttgtgcgcagGTGGATATCTATGAGTCGCGAAAGTTCATTGGTGGTAAAGTGGGGTCCTTT
EST: gi|100424082|gb|BY976656.1|BY976656
EST:     GTCTTGCGGGCATGTCCACCGCTGTTGAGCTTCTCGAGCAAGGCCACGAG                         GTGGATATCTATGAGTCGCGAAAGTTCATTGGTGGTAAAGTGGGGTCCTTT
genomic: GTCTTGCGGGCATGTCCACCGCTGTTGAGCTTCTCGAGCAAGGCCACGAGgtgattcttc ... ttgtgcgcagGTGGATATCTATGAGTCGCGAAAGTTCATTGGTGGTAAAGTGGGGTCCTTT
EST: gi|100423760|gb|BY976531.1|BY976531
EST:     GTCTTGCGGGCATGTCCACCGCTGTTGAGCTTCTCGAGCAAGGCCACGAG                         GTGGATATCTATGAGTCGCGAAAGTTCATTGGTGGTAAAGTGGGGTCCTTT
genomic: GTCTTGCGGGCATGTCCACCGCTGTTGAGCTTCTCGAGCAAGGCCACGAGgtgattcttc ... ttgtgcgcagGTGGATATCTATGAGTCGCGAAAGTTCATTGGTGGTAAAGTGGGGTCCTTT
EST: gi|18327350|gb|BJ159352.1|BJ159352
EST:     GTCTTGCGGGCATGTCCACCGCTGTTGAGCTTCTCGAGCAAGGCCACGAG                         GTGGATATCTATGAGTCGCGAAAGTTCATTGGTGGTAAA
genomic: GTCTTGCGGGCATGTCCACCGCTGTTGAGCTTCTCGAGCAAGGCCACGAGgtgattcttc ... ttgtgcgcagGTGGATATCTATGAGTCGCGAAAGTTCATTGGTGGTAAA
EST: gi|208351706|gb|DC910066.1|DC910066
EST:     GTCTTGCGGGCATGTCCACCGCTGTTGAGCTTCTCGAGCAAGGCCACGAG                         GTGGATATCTATGAGTCGCGAAAGTTCATTGGTGGTAAAGTGGGGTCCTTT
genomic: GTCTTGCGGGCATGTCCACCGCTGTTGAGCTTCTCGAGCAAGGCCACGAGgtgattcttc ... ttgtgcgcagGTGGATATCTATGAGTCGCGAAAGTTCATTGGTGGTAAAGTGGGGTCCTTT
EST: gi|100367017|gb|BY948326.1|BY948326
EST:     GTCTTGCGGGCATGTCCACCGCTGTTGAGCTTCTCGAGCAAGGCCACGAG                         GTGGATATCTATGAGTCGCGAAAGTTCATTGGTGGTAAAGTGGGGTCCTTT
genomic: GTCTTGCGGGCATGTCCACCGCTGTTGAGCTTCTCGAGCAAGGCCACGAGgtgattcttc ... ttgtgcgcagGTGGATATCTATGAGTCGCGAAAGTTCATTGGTGGTAAAGTGGGGTCCTTT
EST: gi|100440953|gb|BY962441.1|BY962441
EST:     GTCTTGCGGGCATGTCCACCGCTGTTGAGCTTCTCGAGCAAGGCCACGAG                         GTGGATATCTATGAGTCGCGAAAGTTCATTGGTGGTAAAGTGGGGTCCTTT
genomic: GTCTTGCGGGCATGTCCACCGCTGTTGAGCTTCTCGAGCAAGGCCACGAGgtgattcttc ... ttgtgcgcagGTGGATATCTATGAGTCGCGAAAGTTCATTGGTGGTAAAGTGGGGTCCTTT
EST: gi|162167140|gb|FC343616.1|FC343616
EST:     GTCTTGCGGGCATGTCCACCGCTGTCGAGCTTCTCGAGCAAGGCCACGAG                         GTGGATATCTATGAGTCGCGAAAGTTCATTGGTGGTAAAGTGGGGTCCTTT
genomic: GTCTTGCGGGCATGTCCACCGCTGTTGAGCTTCTCGAGCAAGGCCACGAGgtgattcttc ... ttgtgcgcagGTGGATATCTATGAGTCGCGAAAGTTCATTGGTGGTAAAGTGGGGTCCTTT
EST: gi|100376253|gb|BY986096.1|BY986096
EST:     GTCTTGCGGGCATGTCCACCGCTGTTGAGCTTCTCGAGCAAGGCCACGAG                         GTGGATATCTATGAGTCGCGAAAGTTCATTGGTGGTAAAGTGGGGTCCTTT
genomic: GTCTTGCGGGCATGTCCACCGCTGTTGAGCTTCTCGAGCAAGGCCACGAGgtgattcttc ... ttgtgcgcagGTGGATATCTATGAGTCGCGAAAGTTCATTGGTGGTAAAGTGGGGTCCTTT
EST: gi|162159709|gb|FC336095.1|FC336095
EST:     GTCTTGCGGGCATGTCCACCGCTGTCGAGCTTCTCGAGCAAGGCCACGAG                         GTGGATATCTATGAGTCGCGAAAGTTCATTGGTGGTAAAGTGGGGTCCTTT
genomic: GTCTTGCGGGCATGTCCACCGCTGTTGAGCTTCTCGAGCAAGGCCACGAGgtgattcttc ... ttgtgcgcagGTGGATATCTATGAGTCGCGAAAGTTCATTGGTGGTAAAGTGGGGTCCTTT
EST: gi|162167477|gb|FC344194.1|FC344194
EST:     GTCTTGCGGGCATGTCCACCGCTGTCGAGCTTCTCGAGCAAGGCCACGAG                         GTGGATATCTATGAGTCGCGAAAGTTCATTGGTGGTAAAGTGGGGTCCTTT
genomic: GTCTTGCGGGCATGTCCACCGCTGTTGAGCTTCTCGAGCAAGGCCACGAGgtgattcttc ... ttgtgcgcagGTGGATATCTATGAGTCGCGAAAGTTCATTGGTGGTAAAGTGGGGTCCTTT
EST: gi|208349541|gb|DC905651.1|DC905651
EST:     GTCTTGCGGGCATGTCCACCGCTGTTGAGCTTCTCGAGCAAGGCCACGAG                         GTGGATATCTATGAATCGCGAAAGTTCATTGGTGGTAAAGTGGGGTCCTTT
genomic: GTCTTGCGGGCATGTCCACCGCTGTTGAGCTTCTCGAGCAAGGCCACGAGgtgattcttc ... ttgtgcgcagGTGGATATCTATGAGTCGCGAAAGTTCATTGGTGGTAAAGTGGGGTCCTTT
EST: gi|100390582|gb|BY971337.1|BY971337
EST:     GTCTTGCGGGCATGTCCACCGCTGTTGAGCTTCTCGAGCAAGGCCACGAG                         GTGGATATCTATGAGTCGCGAAAGTTCATTGGTGGCAAAGTGGGGTCCTTT
genomic: GTCTTGCGGGCATGTCCACCGCTGTTGAGCTTCTCGAGCAAGGCCACGAGgtgattcttc ... ttgtgcgcagGTGGATATCTATGAGTCGCGAAAGTTCATTGGTGGTAAAGTGGGGTCCTTT
EST: gi|100387464|gb|BY988335.1|BY988335
EST:     GTCTTGCGGGCATGTCCACCGCTGTTGAGCTTCTCGAGCAAGGCCACGAG                         GTGGATATCTATGAGTCGCGAAAGTTCATTGGTGGTAAAGTGGGGTCCTTT
genomic: GTCTTGCGGGCATGTCCACCGCTGTTGAGCTTCTCGAGCAAGGCCACGAGgtgattcttc ... ttgtgcgcagGTGGATATCTATGAGTCGCGAAAGTTCATTGGTGGTAAAGTGGGGTCCTTT
EST: gi|208397089|gb|DC908103.1|DC908103
EST:     GTCTTGCGGGCATGTCCACCGCTGTTGAGCTTCTCGAGCAAGGCCACGAG                         GTGGATATCTATGAGTCGCGAAAGTTCATTGGTGGTAATGTGGGGTCCTTT
genomic: GTCTTGCGGGCATGTCCACCGCTGTTGAGCTTCTCGAGCAAGGCCACGAGgtgattcttc ... ttgtgcgcagGTGGATATCTATGAGTCGCGAAAGTTCATTGGTGGTAAAGTGGGGTCCTTT
EST: gi|162168664|gb|FC343926.1|FC343926
EST:     GTCTTGCGGGCATGTCCACCGCTGTCGAGCTTCTCGAGCAAGGCCACGAG                         GTGGATATCTATGAGTCGCGAAAGTTCATTGGTGGTAAAGTGGGGTCCTTT
genomic: GTCTTGCGGGCATGTCCACCGCTGTTGAGCTTCTCGAGCAAGGCCACGAGgtgattcttc ... ttgtgcgcagGTGGATATCTATGAGTCGCGAAAGTTCATTGGTGGTAAAGTGGGGTCCTTT
EST: gi|162170376|gb|FC346781.1|FC346781
EST:     GTCTTGCGGGCATGTCCACCGCTGTCGAGCTTCTCGAGCAAGGCCACGAG                         GTGGATATCTATGAGTCGCGAAAGTTCATTGGTGGTAAAGTGGGGTCCTTT
genomic: GTCTTGCGGGCATGTCCACCGCTGTTGAGCTTCTCGAGCAAGGCCACGAGgtgattcttc ... ttgtgcgcagGTGGATATCTATGAGTCGCGAAAGTTCATTGGTGGTAAAGTGGGGTCCTTT
EST: gi|162176795|gb|FC352809.1|FC352809
EST:     GTCTTGCGGGCATGTCCACCGCTGTCGAGCTTCTCGAGCAAGGCCACGAG                         GTGGATATCTATGAGTCGCGAAAGTTCATTGGTGGTAAAGTGGGGTCCTTT
genomic: GTCTTGCGGGCATGTCCACCGCTGTTGAGCTTCTCGAGCAAGGCCACGAGgtgattcttc ... ttgtgcgcagGTGGATATCTATGAGTCGCGAAAGTTCATTGGTGGTAAAGTGGGGTCCTTT
EST: gi|162267926|gb|FC444007.1|FC444007
EST:     GTCTTGCGGGCATGTCCACCGCTGTTGAGCTTCTCGAGCAAGGCCACGAG                         GTGGATATCTATGAGTCGCGAAAGTTCATTGGTGGTAAAGTGGGGTCCTTT
genomic: GTCTTGCGGGCATGTCCACCGCTGTTGAGCTTCTCGAGCAAGGCCACGAGgtgattcttc ... ttgtgcgcagGTGGATATCTATGAGTCGCGAAAGTTCATTGGTGGTAAAGTGGGGTCCTTT
EST: gi|18367243|gb|BJ199324.1|BJ199324
EST:     GTCTTGCGGGCATGTCCACCGCTGTTGAGCTTCTCGAGCAAGGCCACGAG                         GTGGATATCTATGAGTCGCGAAAGTTCATTGGTGGTAAAGTGGGGTCCTTT
genomic: GTCTTGCGGGCATGTCCACCGCTGTTGAGCTTCTCGAGCAAGGCCACGAGgtgattcttc ... ttgtgcgcagGTGGATATCTATGAGTCGCGAAAGTTCATTGGTGGTAAAGTGGGGTCCTTT
EST: gi|100450706|gb|CJ974398.1|CJ974398
EST:     GTCTTGCGGGCATGTCCACCGCTGTTGAGCTTCTCGAGCAAGGCCACGAG                         GTGGATATCTATGAGTCGCGAAAGTTCATTGGTGGTAAAGTGGGGTCCTTT
genomic: GTCTTGCGGGCATGTCCACCGCTGTTGAGCTTCTCGAGCAAGGCCACGAGgtgattcttc ... ttgtgcgcagGTGGATATCTATGAGTCGCGAAAGTTCATTGGTGGTAAAGTGGGGTCCTTT
EST: gi|18374015|gb|BJ205593.1|BJ205593
EST:     GTCTTGCGGGCATGTCCACCGCTGTTGAGCTTCTCGAGCAAGGCCACGAG                         GTGGATATCTATGAGTCGCGAAAGTTCATTGGTGGTAAAGTGGGGTCCTTT
genomic: GTCTTGCGGGCATGTCCACCGCTGTTGAGCTTCTCGAGCAAGGCCACGAGgtgattcttc ... ttgtgcgcagGTGGATATCTATGAGTCGCGAAAGTTCATTGGTGGTAAAGTGGGGTCCTTT
EST: gi|100443101|gb|BY981727.1|BY981727
EST:     GTCTTGCGGGCATGTCCACCGCTGTTGAGCTTCTCGAGCAAGGCCACGAG                         GTGGATATCTATGAGTCGCGAAAGTTCATTGGTGGTAAAGTGGGGTCCTTT
genomic: GTCTTGCGGGCATGTCCACCGCTGTTGAGCTTCTCGAGCAAGGCCACGAGgtgattcttc ... ttgtgcgcagGTGGATATCTATGAGTCGCGAAAGTTCATTGGTGGTAAAGTGGGGTCCTTT
EST: gi|18325065|gb|BJ157061.1|BJ157061
EST:     GTCTTGCGGGCATGTCCACCGCTGTTGAGCTTCTCGAGCAAGGCCACGAG                         GTGGATATCTATGAGTCGCGAAAGTTCATTGGTGGTAAAGTGGGGTCCTTT
genomic: GTCTTGCGGGCATGTCCACCGCTGTTGAGCTTCTCGAGCAAGGCCACGAGgtgattcttc ... ttgtgcgcagGTGGATATCTATGAGTCGCGAAAGTTCATTGGTGGTAAAGTGGGGTCCTTT
EST: gi|18371251|gb|BJ202853.1|BJ202853
EST:     GTCTTGCGGGCATGTCCACCGCTGTTGAGCTTCTCGAGCAAGGCCACGAG                         GTGGATATCTATGAGTCGCGAAAGTTCATTGGTGGTAAAGTGGGGTCCTTT
genomic: GTCTTGCGGGCATGTCCACCGCTGTTGAGCTTCTCGAGCAAGGCCACGAGgtgattcttc ... ttgtgcgcagGTGGATATCTATGAGTCGCGAAAGTTCATTGGTGGTAAAGTGGGGTCCTTT
EST: gi|162166539|gb|FC343236.1|FC343236
EST:     GTCTTGCGGGCATGTCCACCGCTGTCGAGCTTCTCGAGCAAGGCCACGAG                         GTGGATATCTATGAGTCGCGAAAGTTCATTGGTGGTAAAGTGGGGTCCTTT
genomic: GTCTTGCGGGCATGTCCACCGCTGTTGAGCTTCTCGAGCAAGGCCACGAGgtgattcttc ... ttgtgcgcagGTGGATATCTATGAGTCGCGAAAGTTCATTGGTGGTAAAGTGGGGTCCTTT
EST: gi|100379426|gb|BY986631.1|BY986631
EST:     GTCTTGCGGGCATGTCCACCGCTGTTGAGCTTCTCGAGCAAGGCCACGAG                         GTGGATATCTATGAGTCGCGAAAGTTCATTGGTGGTAAAGTGGGGTCCTTT
genomic: GTCTTGCGGGCATGTCCACCGCTGTTGAGCTTCTCGAGCAAGGCCACGAGgtgattcttc ... ttgtgcgcagGTGGATATCTATGAGTCGCGAAAGTTCATTGGTGGTAAAGTGGGGTCCTTT

RNA-Seq data


 ATGC   Supported by RNA-Seq exonic block that spans over the splice site

 atgs   Truncated intron sequence

Each block is as long as the maximal overhang of any read spanning the junction.
The score is the number of alignments spanning the junction.


Found data for 1 RNA-Seqlibrary.


Block sizes: 31 (upstream exon), 35 (downstream exon)
Score: 41

GCCCGAGGCTTACAAGGGGCCCAAGCTCAAGGTCGCCATTATTGGCGCTGGTCTTGCGGGCATGTCCACCGCTGTTGAGCTTCTCGAGCAAGGCCACGAGgtgattcttc ... ttgtgcgcagGTGGATATCTATGAGTCGCGAAAGTTCATTGGTGGTAAAGTGGGGTCCTTTAAAGATAAGGATGGAAACCATATCGAGATGGGTTTACATGTCTTTTTCG




<











<


<











 atgc   intronic sequence     ATGC   exonic sequence

Intronic sequence truncated to 55 bases.

tttttggttttcttactgtgttggggagttgagaattggtgtgatttgtgcgcagGTGGATATCTATGAGTCGCGAAAGTTCATTGGTGGTAAAGTGGGGTCCTTTAAAGATAAGGATGGAAACCATATCGAGATGGGTTTACATGTCTTTTTCG
         ttcttac  putative branch site (score: 41)
       ttttctta  TA-rich tract
















Putative cis-regulatory sequences

 atgc intron ATGC exonic elements by Pertea et al.
 ATGC exon atgc putative intronic elements
 ATGC putative exonic elements identified for retained introns
        10        20        30        40        50        60        70        80        90        100       110       120       130       140       150       160       170       180       190       200       210       220 
---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| 
gtgattcttctctctgcgtgaattttctgtaattgtttttgatgccattctttttggtttttgaatagcaacgaccatcacctttgtactgtttgcgagtttttaacgtttttttttttttttttttttttttttttttggttttcttactgtgttggggagttgagaattggtgtgatttgtgcgcagGTGGATATCTATGAGTCGCGAAAGTTCATTGGTGGTAAAGTGGGGTCCTTTAAAGATAAGGATGGAAACCATATCGAGATGGGTTTACATGTCTTTTTCG

- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -  AGGATG
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -  GATGGA
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - GAGATG