1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' |
gtaagtcttagacctctccttctcgcattttcgtgttatgttagattggtttatctggttttctacaatgttgctcttcgtctgtgtctgctaacattttattagggtgtaacagAGGTATCTCTTGGGTGACCAAGGATGGCGTGCAACACGCTAACTACTTTGGGTCTCTTACTCAAGCATCCACCTGCCGCGTGGGCGCTTTCCAGGGCGAG
species | Physcomitrella patens |
transcript | PP1S267_10V6.1 |
intron # | 2 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: GGCGGCAACAACGGATCCACTCTCACGGCTGGTATTCTTGCTAACAGAGA AGGTATCTCTTGGGTGACCAAGGATGGCGTGCAACACGCTAACTACTTTGGEST: gi|162226051|gb|FC401329.1|FC401329
genomic: GGCGGCAACAACGGATCCACTCTCACGGCTGGTATTCTTGCTAACAGAGAgtaagtctta ... ggtgtaacagAGGTATCTCTTGGGTGACCAAGGATGGCGTGCAACACGCTAACTACTTTGG
EST: GGCGGCAACAACGGATCCACTCTCACGGCTGGTATTCTTGCTAACAGAGA AGGTATCTCTTGGGTGACCAAGGATGGCGTGCAACACGCTAACTACTTTGGEST: gi|18325029|gb|BJ157025.1|BJ157025
genomic: GGCGGCAACAACGGATCCACTCTCACGGCTGGTATTCTTGCTAACAGAGAgtaagtctta ... ggtgtaacagAGGTATCTCTTGGGTGACCAAGGATGGCGTGCAACACGCTAACTACTTTGG
EST: GGCGGCAACAACGGATCCACTCTCACGGCTGGTATTCTTGCTAACAGAGA AGGTATCTCTTGGGTGACCAAGGATGGCGTGCAACACGCTAACTACTTTGGEST: gi|18327430|gb|BJ159432.1|BJ159432
genomic: GGCGGCAACAACGGATCCACTCTCACGGCTGGTATTCTTGCTAACAGAGAgtaagtctta ... ggtgtaacagAGGTATCTCTTGGGTGACCAAGGATGGCGTGCAACACGCTAACTACTTTGG
EST: GGCGGCAACAACGGATCCACTCTCACGGCTGGTATTCTTGCTAACAGAGA AGGTATCTCTTGGGTGACCAAGGATGGCGTGCAACACGCTAACTACTTTGGEST: gi|18359347|gb|BJ191408.1|BJ191408
genomic: GGCGGCAACAACGGATCCACTCTCACGGCTGGTATTCTTGCTAACAGAGAgtaagtctta ... ggtgtaacagAGGTATCTCTTGGGTGACCAAGGATGGCGTGCAACACGCTAACTACTTTGG
EST: GGCGGCAACAACGGATCCACTCTCACGGCTGGTATTCTTGCTAACAGAGA AGGTATCTCTTGGGTGACCAAGGATGGCGTGCAACACGCTAACTACTTTGGEST: gi|162165793|gb|FC340922.1|FC340922
genomic: GGCGGCAACAACGGATCCACTCTCACGGCTGGTATTCTTGCTAACAGAGAgtaagtctta ... ggtgtaacagAGGTATCTCTTGGGTGACCAAGGATGGCGTGCAACACGCTAACTACTTTGG
EST: GGCGGCAACAACGGATCCACTCTCACGGCTGGTATTCTTGCTAACAGAGA AGGTATCTCTTGGGTGACCAAGGATGGCGTGCAACACGCTAACTACTTTGGEST: gi|162150837|gb|FC327109.1|FC327109
genomic: GGCGGCAACAACGGATCCACTCTCACGGCTGGTATTCTTGCTAACAGAGAgtaagtctta ... ggtgtaacagAGGTATCTCTTGGGTGACCAAGGATGGCGTGCAACACGCTAACTACTTTGG
EST: GGCGGCAACAACGGATCCACTCTCACGGCTGGTATTCTTGCTAACAGAGA AGGTATCTCTTGGGTGACCAAGGATGGCGTGCAACACGCTAACTACTTTGGEST: gi|18363706|gb|BJ195778.1|BJ195778
genomic: GGCGGCAACAACGGATCCACTCTCACGGCTGGTATTCTTGCTAACAGAGAgtaagtctta ... ggtgtaacagAGGTATCTCTTGGGTGACCAAGGATGGCGTGCAACACGCTAACTACTTTGG
EST: GGCGGCAACAACGGATCCACTCTCACGGCTGGTATTCTTGCTAACAGAGA AGGTATCTCTTGGGTGACCAAGGATGGCGTGCAACACGCTAACTACTTTGGEST: gi|67719437|gb|BJ969696.1|BJ969696
genomic: GGCGGCAACAACGGATCCACTCTCACGGCTGGTATTCTTGCTAACAGAGAgtaagtctta ... ggtgtaacagAGGTATCTCTTGGGTGACCAAGGATGGCGTGCAACACGCTAACTACTTTGG
EST: GGCGGCAACAACGGATCCACTCTCACGGCTGGTATTCTTGCTAACAGAGA AGGTATCTCTTGGGTGACCAAGGATGGCGTGCAACACGCTAACTACTTTGGEST: gi|100446640|gb|CJ970939.1|CJ970939
genomic: GGCGGCAACAACGGATCCACTCTCACGGCTGGTATTCTTGCTAACAGAGAgtaagtctta ... ggtgtaacagAGGTATCTCTTGGGTGACCAAGGATGGCGTGCAACACGCTAACTACTTTGG
EST: GGCGGCAACAACGGATCCACTCTCACGGCTGGTATTCTTGCTAACAGAGA AGGTATCTCTTGGGTGACCAAGGATGGCGTGCAACACGCTAACTACTTTGGEST: gi|162269000|gb|FC445492.1|FC445492
genomic: GGCGGCAACAACGGATCCACTCTCACGGCTGGTATTCTTGCTAACAGAGAgtaagtctta ... ggtgtaacagAGGTATCTCTTGGGTGACCAAGGATGGCGTGCAACACGCTAACTACTTTGG
EST: GGCGGCAACAACGGATCCACTCTCACGGCTGGTATTCTTGCTAACAGAGA AGGTATCTCTTGGGTGACCAAGGATGGCGTGCAACACGCTAACTACTTTGGEST: gi|100427579|gb|BY977568.1|BY977568
genomic: GGCGGCAACAACGGATCCACTCTCACGGCTGGTATTCTTGCTAACAGAGAgtaagtctta ... ggtgtaacagAGGTATCTCTTGGGTGACCAAGGATGGCGTGCAACACGCTAACTACTTTGG
EST: GGCGGCAACAACGGATCCACTCTCACGGCTGGTATTCTTGCTAACAGAGA AGGTATCTCTTGGGTGACCAAGGATGGCGTGCAACACGCTAACTACTTTGGEST: gi|100446102|gb|CJ970401.1|CJ970401
genomic: GGCGGCAACAACGGATCCACTCTCACGGCTGGTATTCTTGCTAACAGAGAgtaagtctta ... ggtgtaacagAGGTATCTCTTGGGTGACCAAGGATGGCGTGCAACACGCTAACTACTTTGG
EST: GGCGGCAACAACGGATCCACTCTCACGGCTGGTATTCTTGCTAACAGAGA AGGTATCTCTTGGGTGACCAAGGATGGCGTGCAACACGCTAACTACTTTGGEST: gi|100442189|gb|BY963082.1|BY963082
genomic: GGCGGCAACAACGGATCCACTCTCACGGCTGGTATTCTTGCTAACAGAGAgtaagtctta ... ggtgtaacagAGGTATCTCTTGGGTGACCAAGGATGGCGTGCAACACGCTAACTACTTTGG
EST: GGCGGCAACAACGGATCCACTCTCACGGCTGGTATTCTTGCTAACAGAGA AGGTATCTCTTGGGTGACCAAGGATGGCGTGCAACACGCTAACTACTTTGGEST: gi|100450197|gb|CJ974142.1|CJ974142
genomic: GGCGGCAACAACGGATCCACTCTCACGGCTGGTATTCTTGCTAACAGAGAgtaagtctta ... ggtgtaacagAGGTATCTCTTGGGTGACCAAGGATGGCGTGCAACACGCTAACTACTTTGG
EST: GGCGGCAACAACGGATCCACTCTCACGGCTGGTATTCTTGCTAACAGAGA AGGTATCTCTTGGGTGACCAAGGATGGCGTGCAACACGCTAACTACTTTGGEST: gi|162169895|gb|FC346251.1|FC346251
genomic: GGCGGCAACAACGGATCCACTCTCACGGCTGGTATTCTTGCTAACAGAGAgtaagtctta ... ggtgtaacagAGGTATCTCTTGGGTGACCAAGGATGGCGTGCAACACGCTAACTACTTTGG
EST: GGCGGCAACAACGGATCCACTCTCACGGCTGGTATTCTTGCTAACAGAGA AGGTATCTCTTGGGTGACCAAGGATGGCGTGCAACACGCTAACTACTTTGGEST: gi|208356703|gb|DC902535.1|DC902535
genomic: GGCGGCAACAACGGATCCACTCTCACGGCTGGTATTCTTGCTAACAGAGAgtaagtctta ... ggtgtaacagAGGTATCTCTTGGGTGACCAAGGATGGCGTGCAACACGCTAACTACTTTGG
EST: GGCGGCAACAACGGATCCACTCTCACGGCTGGTATTCTTGCTAACAGAGA AGGTATCTCTTGGGTGACCAAGGATGGCGTGCAACACGCTAACTACTTTGGEST: gi|100403191|gb|BY991080.1|BY991080
genomic: GGCGGCAACAACGGATCCACTCTCACGGCTGGTATTCTTGCTAACAGAGAgtaagtctta ... ggtgtaacagAGGTATCTCTTGGGTGACCAAGGATGGCGTGCAACACGCTAACTACTTTGG
EST: GGCGGCAATAACGGATCCACTCTCACGGCTGGTATTCTTGCTAACAGAGA AGGTATCTCTTGGGTGACCAAGGATGGCGTGCAACACGCTAACTACTTTGGEST: gi|100430782|gb|BY978394.1|BY978394
genomic: GGCGGCAACAACGGATCCACTCTCACGGCTGGTATTCTTGCTAACAGAGAgtaagtctta ... ggtgtaacagAGGTATCTCTTGGGTGACCAAGGATGGCGTGCAACACGCTAACTACTTTGG
EST: GGCGGCAACAACGGATCCACTCTCACGGCTGGTATTCTTGCTAACAGAGA AGGTATCTCTTGGGTGACCAAGGATGGCGTGCAACACGCTAACTACTTTGGEST: gi|100441349|gb|BY962638.1|BY962638
genomic: GGCGGCAACAACGGATCCACTCTCACGGCTGGTATTCTTGCTAACAGAGAgtaagtctta ... ggtgtaacagAGGTATCTCTTGGGTGACCAAGGATGGCGTGCAACACGCTAACTACTTTGG
EST: GGCGGCAACAACGGATCCACTCTCACGGCTGGTATTCTTGCTAACAGAGA AGGTATCTCTTGGGTGACCAAGGATGGCGTGCAACACGCTAACTACTTTGGEST: gi|18358390|gb|BJ190449.1|BJ190449
genomic: GGCGGCAACAACGGATCCACTCTCACGGCTGGTATTCTTGCTAACAGAGAgtaagtctta ... ggtgtaacagAGGTATCTCTTGGGTGACCAAGGATGGCGTGCAACACGCTAACTACTTTGG
EST: GGCGGCAACAACGGATCCACTCTCACGGCTGGTATTCTTGCTAACAGAGA AGGTATCTCTTGGGTGEST: gi|162166972|gb|FC343357.1|FC343357
genomic: GGCGGCAACAACGGATCCACTCTCACGGCTGGTATTCTTGCTAACAGAGAgtaagtctta ... ggtgtaacagAGGTATCTCTTGGGTG
EST: GGCGGCAACAACGGATCCACTCTCACGGCTGGTATTCTTGCTAACAGAGA AGGTATCTCTTGGGTGACCAAGGATGGCGTGCAACACGCTAACTACTTTGGEST: gi|18328239|gb|BJ160243.1|BJ160243
genomic: GGCGGCAACAACGGATCCACTCTCACGGCTGGTATTCTTGCTAACAGAGAgtaagtctta ... ggtgtaacagAGGTATCTCTTGGGTGACCAAGGATGGCGTGCAACACGCTAACTACTTTGG
EST: GGCGGCAACAACGGATCCACTCTCACGGCTGGTATTCTTGCTAACAGAGA AGGTATCTCTTGGGTGACCAAGGATGGCGTGCAACACGCTAEST: gi|100447987|gb|CJ972286.1|CJ972286
genomic: GGCGGCAACAACGGATCCACTCTCACGGCTGGTATTCTTGCTAACAGAGAgtaagtctta ... ggtgtaacagAGGTATCTCTTGGGTGACCAAGGATGGCGTGCAACACGCTA
EST: GGCGGCAACAACGGATCCACTCTCACGGCTGGTATTCTTGCTAACAGAGA ANGTATCTCTTGGGTGACCAAGGATGGCGTGCAACACGCTAACTACTTTGGEST: gi|18331887|gb|BJ163899.1|BJ163899
genomic: GGCGGCAACAACGGATCCACTCTCACGGCTGGTATTCTTGCTAACAGAGAgtaagtctta ... ggtgtaacagAGGTATCTCTTGGGTGACCAAGGATGGCGTGCAACACGCTAACTACTTTGG
EST: GGCGGCAACAACGGATCCACTCTCACGGCTGGTATTCTTGCTAACAGAGA AGGTATCTCTTGGGTGACCAAGGATGGCGTGCAACACGCTAACTACTTTGGEST: gi|67704669|gb|BJ964902.1|BJ964902
genomic: GGCGGCAACAACGGATCCACTCTCACGGCTGGTATTCTTGCTAACAGAGAgtaagtctta ... ggtgtaacagAGGTATCTCTTGGGTGACCAAGGATGGCGTGCAACACGCTAACTACTTTGG
EST: GGCGGCAACAACGGATCCACTCTCACGGCTGGTATTCTTGCTAACAGAGA AGGTATCTCTTGGGTGACCAAGGATGGCGTGCAACACGCTAACTACTTTGGEST: gi|18354151|gb|BJ186207.1|BJ186207
genomic: GGCGGCAACAACGGATCCACTCTCACGGCTGGTATTCTTGCTAACAGAGAgtaagtctta ... ggtgtaacagAGGTATCTCTTGGGTGACCAAGGATGGCGTGCAACACGCTAACTACTTTGG
EST: GGCGGCAACAACGGATCCACTCTCACGGCTGGTATTCTTGCTAACAGAGA AGGTATCTCTTGGGTGACCAAGGATGGCGTGCAACACGCTAACTACTTTGGEST: gi|162279671|gb|FC455904.1|FC455904
genomic: GGCGGCAACAACGGATCCACTCTCACGGCTGGTATTCTTGCTAACAGAGAgtaagtctta ... ggtgtaacagAGGTATCTCTTGGGTGACCAAGGATGGCGTGCAACACGCTAACTACTTTGG
EST: GGCGGCAACAACGGATCCACTCTCACGGCTGGTATTCTTGCTAACAGAGA AGGTATCTCTTGGGTGACCAAGGATGGCGTGCAACACGCTAACTACTTTGGEST: gi|67574163|gb|BJ946987.1|BJ946987
genomic: GGCGGCAACAACGGATCCACTCTCACGGCTGGTATTCTTGCTAACAGAGAgtaagtctta ... ggtgtaacagAGGTATCTCTTGGGTGACCAAGGATGGCGTGCAACACGCTAACTACTTTGG
EST: GGCGGCAACAACGGATCCACTCTCACGGCTGGTATTCTTGCTAACAGAGA AGGTATCTCTTGGGTGACCAAGGATGGCGTGCAACACGCTAACTACTTTGGEST: gi|100446153|gb|CJ970452.1|CJ970452
genomic: GGCGGCAACAACGGATCCACTCTCACGGCTGGTATTCTTGCTAACAGAGAgtaagtctta ... ggtgtaacagAGGTATCTCTTGGGTGACCAAGGATGGCGTGCAACACGCTAACTACTTTGG
EST: GGCGGCAACAACGGATCCACTCTCACGGCTGGTATTCTTGCTAACAGAGA AGGTATCTCTTGGGTGACCAAGGATGGCGTGCAACACGCTAACTACTTTGGEST: gi|18374739|gb|BJ206317.1|BJ206317
genomic: GGCGGCAACAACGGATCCACTCTCACGGCTGGTATTCTTGCTAACAGAGAgtaagtctta ... ggtgtaacagAGGTATCTCTTGGGTGACCAAGGATGGCGTGCAACACGCTAACTACTTTGG
EST: GGCGGCAACAACGGATCCACTCTCACGGCTGGTATTCTTGCTAACAGAGA AGGTATCTCTTGGGTGACCAAGGATGGCGTGCAACACGCTAACTACTTTGGEST: gi|18359531|gb|BJ191592.1|BJ191592
genomic: GGCGGCAACAACGGATCCACTCTCACGGCTGGTATTCTTGCTAACAGAGAgtaagtctta ... ggtgtaacagAGGTATCTCTTGGGTGACCAAGGATGGCGTGCAACACGCTAACTACTTTGG
EST: GGCGGCAACAACGGATCCACTCTCACGGCTGGTATTCTTGCTAACAGAGA AGGTATCTCTTGGGTGACCAAGGATGGCGTGCAACACGCTAACTACTTTGGEST: gi|162241553|gb|FC418614.1|FC418614
genomic: GGCGGCAACAACGGATCCACTCTCACGGCTGGTATTCTTGCTAACAGAGAgtaagtctta ... ggtgtaacagAGGTATCTCTTGGGTGACCAAGGATGGCGTGCAACACGCTAACTACTTTGG
EST: GCGGCAACAACGGATCCACTCTCACGGCTGGTATTCTTGCTAACAGAGA AGGTATCTCTTGGGTGACCAAGGATGGCGTGCAACACGCTAACTACTTTGGEST: gi|162153386|gb|FC329896.1|FC329896
genomic: GCGGCAACAACGGATCCACTCTCACGGCTGGTATTCTTGCTAACAGAGAgtaagtctta ... ggtgtaacagAGGTATCTCTTGGGTGACCAAGGATGGCGTGCAACACGCTAACTACTTTGG
EST: GGCGGCAACAACGGATCCACTCTCACGGCTGGTATTCTTGCTAACAGAGA AGGTATCTCTTGGGTGACCAAGGATGGCGTGCAACACGCTAACTACTTTGGEST: gi|162180539|gb|FC356181.1|FC356181
genomic: GGCGGCAACAACGGATCCACTCTCACGGCTGGTATTCTTGCTAACAGAGAgtaagtctta ... ggtgtaacagAGGTATCTCTTGGGTGACCAAGGATGGCGTGCAACACGCTAACTACTTTGG
EST: GGCGGCAACAACGGATCCACTCTCACGGCTGGTATTCTTGCTAACAGAGA AGGTATCTCTTGGGTGACCAAGGATGGCGTGCAACACGCTAACTACTTTGGEST: gi|18325715|gb|BJ157712.1|BJ157712
genomic: GGCGGCAACAACGGATCCACTCTCACGGCTGGTATTCTTGCTAACAGAGAgtaagtctta ... ggtgtaacagAGGTATCTCTTGGGTGACCAAGGATGGCGTGCAACACGCTAACTACTTTGG
EST: GGCGGCAACAACGGATCCACTCTCACGGCTGGTATTCTTGCTAACAGAGA AGGTATCTCTTGGGTGACCAAGGATGGCGTGCAACACGCTAACTACTTTGGEST: gi|7207697|gb|AW561694.1|AW561694
genomic: GGCGGCAACAACGGATCCACTCTCACGGCTGGTATTCTTGCTAACAGAGAgtaagtctta ... ggtgtaacagAGGTATCTCTTGGGTGACCAAGGATGGCGTGCAACACGCTAACTACTTTGG
EST: CGGCACCAGCGGATCCACTCTCACGGCTGGTATTCTTGCTAACAGAGA AGGTATCTCTTGGGTGACCAAGGATGGCGTGCAACACGCTAACTACTTTGGEST: gi|18327112|gb|BJ159113.1|BJ159113
genomic: CGGCAACAACGGATCCACTCTCACGGCTGGTATTCTTGCTAACAGAGAgtaagtctta ... ggtgtaacagAGGTATCTCTTGGGTGACCAAGGATGGCGTGCAACACGCTAACTACTTTGG
EST: GGCGGCAACAACGGATCCACTCTCACGGCTGGTATTCTTGCTAACAGAGA AGGTATCTCTTGGGTGACCAAGGATGGCGTGCAACACGCTAACTACTTTGGEST: gi|18371837|gb|BJ203439.1|BJ203439
genomic: GGCGGCAACAACGGATCCACTCTCACGGCTGGTATTCTTGCTAACAGAGAgtaagtctta ... ggtgtaacagAGGTATCTCTTGGGTGACCAAGGATGGCGTGCAACACGCTAACTACTTTGG
EST: GGCGGCAACAACGGATCCACTCTCACGGCTGGTATTCTTGCTAACAGAGA AGGTATCTCTTGGGTGACCAAGGATGGCGTGCAACACGCTAACTACTTTGG
genomic: GGCGGCAACAACGGATCCACTCTCACGGCTGGTATTCTTGCTAACAGAGAgtaagtctta ... ggtgtaacagAGGTATCTCTTGGGTGACCAAGGATGGCGTGCAACACGCTAACTACTTTGG
ttctacaatgttgctcttcgtctgtgtctgctaacattttattagggtgtaacagAGGTATCTCTTGGGTGACCAAGGATGGCGTGCAACACGCTAACTACTTTGGGTCTCTTACTCAAGCATCCACCTGCCGCGTGGGCGCTTTCCAGGGCGAG
tgctaac putative branch site (score: 8)
taacattttatta TA-rich tract