1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' | 8 5' 3' | 9 5' 3' | 10 5' 3' | 11 5' 3' | 12 5' 3' | 13 5' 3' | 14 5' 3' | 15 5' 3' | 16 5' 3' | 17 5' 3' | 18 5' 3' | 19 5' 3' | 20 5' 3' |
21 5' 3' |
gttgtgactatccctttcacctgtgatgtcaattctgcaaatgctggtttctcaaaatctgaaatgatgcttacaagatttttgatgcacagGCTATGTTTATTGATTTTGGACTGGCTAAAGAGCGCAACGGACATTGTTACCTTAG
species | Oryza sativa |
transcript | LOC_Os05g08990.1 |
intron # | 9 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: CCCGCTTTCCCCCAGAGCCTAATGGCTACCTTCATATTGGTCATGCTAAG GCTATGTTTATTGATTTTGGACTGGCTAAAGAGCGCAACGGACATTGTTACEST: gi|1631631|gb|C19360.1|C19360
genomic: CCCGCTTTCCCCCAGAGCCTAATGGCTACCTTCATATTGGTCATGCTAAGgttgtgacta ... tgatgcacagGCTATGTTTATTGATTTTGGACTGGCTAAAGAGCGCAACGGACATTGTTAC
EST: CCCGCTTTCCCCCAGAGCCTAATGGCTACCTTCATATTGGTCATGCTAAG GCTATGTTTATTGATTTTGGACTGGCTAAAGAGCGCAACGGACATTGTTACEST: gi|29674312|gb|CB670587.1|CB670587
genomic: CCCGCTTTCCCCCAGAGCCTAATGGCTACCTTCATATTGGTCATGCTAAGgttgtgacta ... tgatgcacagGCTATGTTTATTGATTTTGGACTGGCTAAAGAGCGCAACGGACATTGTTAC
EST: CCCGCTTTCCCCCAGAGCCTAATGGCTACCTTCATATTGGTCATGCTAAG GCTATGTTTATTGATTTTGGACTGGCTAAAGAGCGCAACGGACATTGTTACEST: gi|58612802|gb|CK040514.1|CK040514
genomic: CCCGCTTTCCCCCAGAGCCTAATGGCTACCTTCATATTGGTCATGCTAAGgttgtgacta ... tgatgcacagGCTATGTTTATTGATTTTGGACTGGCTAAAGAGCGCAACGGACATTGTTAC
EST: CCCGCTTTCCCCCAGAGCCTAATGGCTACCTTCATATTGGTCATGCTAAG GCTATGTTTATTGATTTTGGACTGGCTAAAGAGCGCAACGGACATTGTTAC
genomic: CCCGCTTTCCCCCAGAGCCTAATGGCTACCTTCATATTGGTCATGCTAAGgttgtgacta ... tgatgcacagGCTATGTTTATTGATTTTGGACTGGCTAAAGAGCGCAACGGACATTGTTAC
caaatgctggtttctcaaaatctgaaatgatgcttacaagatttttgatgcacagGCTATGTTTATTGATTTTGGACTGGCTAAAGAGCGCAACGGACATTGTTACCTTAG
ttttt CT-rich tract
aagattttt TA-rich tract