1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' | 8 5' 3' | 9 5' 3' |
...cgcccataggtgactttctatgccaatgtcaataagctatattcagcttttgttgttctaattttggttctcattcatatattactttggttgtttacagAAGAGGAGTCGGGATGACCTGATTCAGCTGTTCCCGTTGTTACGGTGCTTCAAAGTACACAGCTAGTTGACCTGAATTTCTGTTAAGTTGTTTATTCTAC
species | Oryza sativa |
transcript | LOC_Os02g17990.3 |
intron # | 9 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: GCTCACGTAGTCTCACAACTCTTGATGTAAATGGCTGTATTGGTATTAAG AAGAGGAGTCGGGATGACCTGATTCAGCTGTTCCCGTTGTTACGGTGCTTCEST: gi|88238513|gb|CI238362.1|CI238362
genomic: GCTCACGTAGTCTCACAACTCTTGATGTAAATGGCTGTATTGGTATTAAGgtgaggattc ... ttgtttacagAAGAGGAGTCGGGATGACCTGATTCAGCTGTTCCCGTTGTTACGGTGCTTC
EST: GCTCACGTAGTCTCACAACTCTTGATGTAAATGGCTGTATTGGTATTAAG AAGAGGAGTCGGGATGACCTGATTCAGCTGTTCCCGTTGTTACGGTGCTTCEST: gi|29668175|gb|CB664450.1|CB664450
genomic: GCTCACGTAGTCTCACAACTCTTGATGTAAATGGCTGTATTGGTATTAAGgtgaggattc ... ttgtttacagAAGAGGAGTCGGGATGACCTGATTCAGCTGTTCCCGTTGTTACGGTGCTTC
EST: GCTCACGTAGTCTCACAACTCTTGATGTAAATGGCTGTATTGGTATTAAG AAGAGGAGTCGGGATGACCTGATTCAGCTGTTCCCGTTGTTACGGTGCTTCEST: gi|89196922|gb|CI402676.1|CI402676
genomic: GCTCACGTAGTCTCACAACTCTTGATGTAAATGGCTGTATTGGTATTAAGgtgaggattc ... ttgtttacagAAGAGGAGTCGGGATGACCTGATTCAGCTGTTCCCGTTGTTACGGTGCTTC
EST: GCTCACGTAGTCTCACAACTCTTGATGTAGATGGCTGTATTGGTATTAAG AAGAGGAGTCGGGATGACCTGATTCAGCTGTTCCCGTTGTTACGGTGCTTCEST: gi|88908325|gb|CI090918.1|CI090918
genomic: GCTCACGTAGTCTCACAACTCTTGATGTAAATGGCTGTATTGGTATTAAGgtgaggattc ... ttgtttacagAAGAGGAGTCGGGATGACCTGATTCAGCTGTTCCCGTTGTTACGGTGCTTC
EST: CTCACAACTCTTGATGTAAAGGGCTGTATTGGTATTAAG AAGAGGAGTCGGGATGACCTGATTCAGCTGTTCCCGTTGTTACGGTGCTTC
genomic: CTCACAACTCTTGATGTAAATGGCTGTATTGGTATTAAGgtgaggattc ... ttgtttacagAAGAGGAGTCGGGATGACCTGATTCAGCTGTTCCCGTTGTTACGGTGCTTC
gcttttgttgttctaattttggttctcattcatatattactttggttgtttacagAAGAGGAGTCGGGATGACCTGATTCAGCTGTTCCCGTTGTTACGGTGCTTCAAAGTACACAGCTAGTTGACCTGAATTTCTGTTAAGTTGTTTATTCTAC
ttctaat putative branch site (score: 2)
attcatatattacttt TA-rich tract