1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' |
gtgggttcatcacagttttgattcatagagtcataagaaaagattcttctaagcttttctgatctaatcattctggaatttaacctttgggtctttatttttctaatcttatatatagGTTATCGGTTACCATTCCTTCTGTCAGCACAAATGCCCTTGGCTATGGAGCCTTCCTAGGACTATATGCAAACTTGCGGTATCAACTATTGTGTGGACTG
species | Oryza sativa |
transcript | LOC_Os12g18630.1 |
intron # | 6 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: TCTATTCAAGGTGGTCTCTCAAAAGCCTTGTCTGCAAGAAAGGAAAGGAG GTTATCGGTTACCATTCCTTCTGTCAGCACAAATGCCCTTGGCTATGGAGCEST: gi|112785335|gb|EE590485.1|EE590485
genomic: TCTATTCAAGGTGGTCTCTCAAAAGCCTTGTCTGCAAGAAAGGAAAGGAGgtgggttcat ... ttatatatagGTTATCGGTTACCATTCCTTCTGTCAGCACAAATGCCCTTGGCTATGGAGC
EST: TCTATTCAAGGTGGTCTCTCAAAAGCCTTGTCTGCTAGAAAAGAAAGGAG GTTATCGGTTACCATTCCTTCTGTCAGCACAAATGCCCTTGGCTATGGAGCEST: gi|29660233|gb|CB656508.1|CB656508
genomic: TCTATTCAAGGTGGTCTCTCAAAAGCCTTGTCTGCAAGAAAGGAAAGGAGgtgggttcat ... ttatatatagGTTATCGGTTACCATTCCTTCTGTCAGCACAAATGCCCTTGGCTATGGAGC
EST: GCAAGAAAGGAAAGGAG GTTATCGGTTACCATTCCTTCTGTCAGCACAAATGCCCTTGGCTATGGAGCEST: gi|25797251|gb|CA753212.1|CA753212
genomic: GCAAGAAAGGAAAGGAGgtgggttcat ... ttatatatagGTTATCGGTTACCATTCCTTCTGTCAGCACAAATGCCCTTGGCTATGGAGC
EST: TCTATTCAAGGTGGTCTCTCAAAAGCCTTGTCTGCTAGAAAAGAAAGGAG GTTATCGGTTACCATTCCTTCTGTCAGCACAAATGCCCTTGGCTATGGAGCEST: gi|87017626|gb|CI289759.1|CI289759
genomic: TCTATTCAAGGTGGTCTCTCAAAAGCCTTGTCTGCAAGAAAGGAAAGGAGgtgggttcat ... ttatatatagGTTATCGGTTACCATTCCTTCTGTCAGCACAAATGCCCTTGGCTATGGAGC
EST: TCTATTCAAGGTGGTCTCTCAAAAGCCTTGTCTGCAAGAAAGGAAAGGAG GTTATCGGTTACCATTCCTTCTGTCAGCACAAATGCCCTTGGCTATGGAGCEST: gi|29618852|gb|CB623864.1|CB623864
genomic: TCTATTCAAGGTGGTCTCTCAAAAGCCTTGTCTGCAAGAAAGGAAAGGAGgtgggttcat ... ttatatatagGTTATCGGTTACCATTCCTTCTGTCAGCACAAATGCCCTTGGCTATGGAGC
EST: TCTATTCAAGGTGGTCTCTCAAAAGCCTTGTCTGCTAGAAAAGAAAGGAG GTTATCGGTTACCATTCCTTCTGTCAGCACAAATGCCCTTGGCTATGGAGC
genomic: TCTATTCAAGGTGGTCTCTCAAAAGCCTTGTCTGCAAGAAAGGAAAGGAGgtgggttcat ... ttatatatagGTTATCGGTTACCATTCCTTCTGTCAGCACAAATGCCCTTGGCTATGGAGC
ctaatcattctggaatttaacctttgggtctttatttttctaatcttatatatagGTTATCGGTTACCATTCCTTCTGTCAGCACAAATGCCCTTGGCTATGGAGCCTTCCTAGGACTATATGCAAACTTGCGGTATCAACTATTGTGTGGACTG
ttctaat putative branch site (score: 47)
tctttatttttctaat TA-rich tract