1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' |
gttgaagtgtgaaaaatattacgtttaattttccttgcgcaacataagggttttacaaagcatcgactgattctgatgagagatctctttgtagGGTACATTAAACCCATATGTTGGTCAGCAATATGTTCCAATTTATGGAGTTTCATCCGCAGCAAATACTGCTAGCCAACCATTTAGCCAGTTCAGCCCGT
species | Oryza sativa |
transcript | LOC_Os02g48340.3 |
intron # | 4 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: CTACACTACATATGGGACAGAATACATCTATCCACAG GGTACATTAAACCCATACGTTGGTCAGCAATATGTTCCAATTTATGGAGTTEST: gi|29658157|gb|CB654432.1|CB654432
genomic: CTACACTACATATGGGACAGAATACATCTATCCACAGgttgaagtgt ... ctctttgtagGGTACATTAAACCCATATGTTGGTCAGCAATATGTTCCAATTTATGGAGTT
EST: CTACACTACATATGGGACAGAATACATCTATCCACAG GGTACATTAAACCCATATGTTGGTCAGCAATATGTTCCAATTTATGGAGTTEST: gi|33676574|gb|CF304813.1|CF304813
genomic: CTACACTACATATGGGACAGAATACATCTATCCACAGgttgaagtgt ... ctctttgtagGGTACATTAAACCCATATGTTGGTCAGCAATATGTTCCAATTTATGGAGTT
EST: GGGACAGAATACATCTATCCACAG GGTACATTAAACCCATATGTTGGTCAGCAATATGTTCCAATTTATGGAGTTEST: gi|33793822|gb|CF322799.1|CF322799
genomic: GGGACAGAATACATCTATCCACAGgttgaagtgt ... ctctttgtagGGTACATTAAACCCATATGTTGGTCAGCAATATGTTCCAATTTATGGAGTT
EST: CTACACTACATATGGGACAGAATACATCTATCCACAG GGTACATTAAACCCATATGTTGGTCAGCAATATGTTCCAATTTATGGAGTTEST: gi|29677295|gb|CB673570.1|CB673570
genomic: CTACACTACATATGGGACAGAATACATCTATCCACAGgttgaagtgt ... ctctttgtagGGTACATTAAACCCATATGTTGGTCAGCAATATGTTCCAATTTATGGAGTT
EST: CTACACTACACTATGGGACAGAATACATCTATCCACAG GGTACATTAAACCCATATGTTGGTCAGCAATATGTTCCAATTTATGGAGTT
genomic: CTACACTACA-TATGGGACAGAATACATCTATCCACAGgttgaagtgt ... ctctttgtagGGTACATTAAACCCATATGTTGGTCAGCAATATGTTCCAATTTATGGAGTT
caacataagggttttacaaagcatcgactgattctgatgagagatctctttgtagGGTACATTAAACCCATATGTTGGTCAGCAATATGTTCCAATTTATGGAGTTTCATCCGCAGCAAATACTGCTAGCCAACCATTTAGCCAGTTCAGCCCGT
ttctgat putative branch site (score: 9)
tctctttgt putative PPT
ttttacaaa TA-rich tract