1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' |
...ttccaacatcaaagctgggttcttcatagcatgtctaatgccactgctgcttggttgctaataccgctgaccctattatacttgtatatgataacatcagATCTGCGCTTGATGGAGAATGTGGGTTTATCGCTGCTAATCTCTATGCCAAGAGTGTTTTTGGTGAGGATGCATTGGTGAACATCAGCGTTGAAAAGCAA
species | Oryza sativa |
transcript | LOC_Os11g07280.1 |
intron # | 3 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: TTTTTGGATCATATCATCAAATCGACAAATATGAAGTGTCTAACACCACC ATCTGCGCTTGATGGAGAATGTGGGTTTATCGCTGCTAATCTCTATGCCAAEST: gi|86520094|gb|CI160300.1|CI160300
genomic: TTTTTGGATCATATCATCAAATCGACAAATATGAAGTGTCTAACACCACCgtaagttaca ... ataacatcagATCTGCGCTTGATGGAGAATGTGGGTTTATCGCTGCTAATCTCTATGCCAA
EST: TTTTTGGATCATATCATCAAATCGACAAATATGAAGTGTCTAACACCACC ATCTGCGCTTGATGGAGAATGTGGGTTTATCGCTGCTAATCTCTATGCCAAEST: gi|88247083|gb|CI246932.1|CI246932
genomic: TTTTTGGATCATATCATCAAATCGACAAATATGAAGTGTCTAACACCACCgtaagttaca ... ataacatcagATCTGCGCTTGATGGAGAATGTGGGTTTATCGCTGCTAATCTCTATGCCAA
EST: TTTTTGGATCATATCATCAAATCGACAAATATGAAGTGTCTAACACCACC ATCTGCGCTTGATGGAGAATGTGGGTTTATCGCTGCTAATCTCTATGCCAAEST: gi|86521056|gb|CI161262.1|CI161262
genomic: TTTTTGGATCATATCATCAAATCGACAAATATGAAGTGTCTAACACCACCgtaagttaca ... ataacatcagATCTGCGCTTGATGGAGAATGTGGGTTTATCGCTGCTAATCTCTATGCCAA
EST: AAATATGAAGTGTCTAACACCACC ATCTGCGCTTGATGGAGAATGTGGGTTTATCGCTGCTAATCTCTATGCCAAEST: gi|29630805|gb|CB635814.1|CB635814
genomic: AAATATGAAGTGTCTAACACCACCgtaagttaca ... ataacatcagATCTGCGCTTGATGGAGAATGTGGGTTTATCGCTGCTAATCTCTATGCCAA
EST: TTTTTGGATCATATCATCAAATCGACAAATATGAAGTGTCTAACACCACC ATCTGCGCTTGATGGAGAATGTGGGTTTATCGCTGCTAATCTCTATGCCAAEST: gi|86521223|gb|CI161429.1|CI161429
genomic: TTTTTGGATCATATCATCAAATCGACAAATATGAAGTGTCTAACACCACCgtaagttaca ... ataacatcagATCTGCGCTTGATGGAGAATGTGGGTTTATCGCTGCTAATCTCTATGCCAA
EST: TTTTTGGATCATATCATCAAATCGACAAATATGAAGTGTCTAACACCACC ATCTGCGCTTGATGGAGAATGTGGGTTTATCGCTGCTAATCTCTATGCCAAEST: gi|86521095|gb|CI161301.1|CI161301
genomic: TTTTTGGATCATATCATCAAATCGACAAATATGAAGTGTCTAACACCACCgtaagttaca ... ataacatcagATCTGCGCTTGATGGAGAATGTGGGTTTATCGCTGCTAATCTCTATGCCAA
EST: TTTTTGGATCATATCATCAAATCGACAAATATGAAGTGTCTAACACCACC ATCTGCGCTTGATGGAGAATGTGGGTTTATCGCTGCTAATCTCTATGCCAAEST: gi|87016415|gb|CI273625.1|CI273625
genomic: TTTTTGGATCATATCATCAAATCGACAAATATGAAGTGTCTAACACCACCgtaagttaca ... ataacatcagATCTGCGCTTGATGGAGAATGTGGGTTTATCGCTGCTAATCTCTATGCCAA
EST: TTTTTGGATCATATCATCAAATCGACAAATATGAAGTGTCTAACACCACC ATCTGCGCTTGATGGAGAATGTGGGTTTATCGCTGCTAATCTCTATGCCAAEST: gi|87014805|gb|CI271404.1|CI271404
genomic: TTTTTGGATCATATCATCAAATCGACAAATATGAAGTGTCTAACACCACCgtaagttaca ... ataacatcagATCTGCGCTTGATGGAGAATGTGGGTTTATCGCTGCTAATCTCTATGCCAA
EST: TTTTTGGATCATATCATCAAATCGACAAATATGAAGTGTCTAACACCACC ATCTGCGCTTGATGGAGAATGTGGGTTTATCGCTGCTAATCTCTATGCCAAEST: gi|86858225|gb|CI271117.1|CI271117
genomic: TTTTTGGATCATATCATCAAATCGACAAATATGAAGTGTCTAACACCACCgtaagttaca ... ataacatcagATCTGCGCTTGATGGAGAATGTGGGTTTATCGCTGCTAATCTCTATGCCAA
EST: TTTTTGGATCATATCATCAAATCGACAAATATGAAGTGTCTAACACCACC ACCTGCGCTTGATGGAGAATGTGGGTTTATCGCTGCTAATCTCTATGCCAAEST: gi|88236124|gb|CI235326.1|CI235326
genomic: TTTTTGGATCATATCATCAAATCGACAAATATGAAGTGTCTAACACCACCgtaagttaca ... ataacatcagATCTGCGCTTGATGGAGAATGTGGGTTTATCGCTGCTAATCTCTATGCCAA
EST: TTTTTGGATCATATCACCAAATCGACAAATATGAAGTGTCTAACACCACC ATCTGCGCTTGATGGAGAATGTGGGTTTATCGCTGCTAATCTCTATGCCAAEST: gi|88229076|gb|CI228952.1|CI228952
genomic: TTTTTGGATCATATCATCAAATCGACAAATATGAAGTGTCTAACACCACCgtaagttaca ... ataacatcagATCTGCGCTTGATGGAGAATGTGGGTTTATCGCTGCTAATCTCTATGCCAA
EST: TTTTTGGATCATATCATCAAATCGACAAATATGAAGTGTCTAACACCACC ATCTGCGCTTGATGGAGAATGTGGGTTTGTCGCTGCTAATCTCTATGCCAAEST: gi|86477387|gb|CI120020.1|CI120020
genomic: TTTTTGGATCATATCATCAAATCGACAAATATGAAGTGTCTAACACCACCgtaagttaca ... ataacatcagATCTGCGCTTGATGGAGAATGTGGGTTTATCGCTGCTAATCTCTATGCCAA
EST: TTTTTGGATCATATCATCAAATCGACAAATATGAAGTGTCTAACACCACC ATCTGCGCTTGATGGAGAATGTGGGTTTATCGCTGCTAATCTCTATGCCAAEST: gi|33676043|gb|CF304282.1|CF304282
genomic: TTTTTGGATCATATCATCAAATCGACAAATATGAAGTGTCTAACACCACCgtaagttaca ... ataacatcagATCTGCGCTTGATGGAGAATGTGGGTTTATCGCTGCTAATCTCTATGCCAA
EST: TTTTTGGATCATATCATCAAATCGACAAATATGAAGTGTCTAACACCACC ATCTGCGCTTGATGGAGAATGTGGGTTTATCGCTGCTAATCTCTATGCCAAEST: gi|88993204|gb|CI108832.1|CI108832
genomic: TTTTTGGATCATATCATCAAATCGACAAATATGAAGTGTCTAACACCACCgtaagttaca ... ataacatcagATCTGCGCTTGATGGAGAATGTGGGTTTATCGCTGCTAATCTCTATGCCAA
EST: TTTTTGGATCGTATCATCGGATCGACAAATATGAAGTGTCTAACACCACC ATCTGCGCTTGATGGAGAATGTGGGTTTATCGCTGCTAATCTGCTATGCCAEST: gi|87040269|gb|CI194891.1|CI194891
genomic: TTTTTGGATCATATCATCAAATCGACAAATATGAAGTGTCTAACACCACCgtaagttaca ... ataacatcagATCTGCGCTTGATGGAGAATGTGGGTTTATCGCTGCTAATCT-CTATGCCA
EST: TTTTTGGATCATATCATCAAATCGACAAATATGAAGTGTCTAACACCACC ATCTGCGCTTGATGGAGAATGTGGGTTTATCGCTGCTAATCTCTATGCCAAEST: gi|86478378|gb|CI121011.1|CI121011
genomic: TTTTTGGATCATATCATCAAATCGACAAATATGAAGTGTCTAACACCACCgtaagttaca ... ataacatcagATCTGCGCTTGATGGAGAATGTGGGTTTATCGCTGCTAATCTCTATGCCAA
EST: TTTTTGGATCATATCATCAAATCGACAAATATGAAGTGTCTAACACCACC ATCTGCGCTTGATGGAGAATGTGGGTTTATCGCTGCTAATCTCTATGCCAAEST: gi|88233731|gb|CI233580.1|CI233580
genomic: TTTTTGGATCATATCATCAAATCGACAAATATGAAGTGTCTAACACCACCgtaagttaca ... ataacatcagATCTGCGCTTGATGGAGAATGTGGGTTTATCGCTGCTAATCTCTATGCCAA
EST: TTTTTGGATCATATCATCAAATCGACAAATATGAAGTGTCTAACACCACT ATCTGCGCTTGATGGAGAATGTGGGTTTATCGCTGCTAATCTCTATGCCAAEST: gi|87039720|gb|CI194342.1|CI194342
genomic: TTTTTGGATCATATCATCAAATCGACAAATATGAAGTGTCTAACACCACCgtaagttaca ... ataacatcagATCTGCGCTTGATGGAGAATGTGGGTTTATCGCTGCTAATCTCTATGCCAA
EST: ACAAATATGAAGTGTCTAACACCACC ATCTGCGCTTGATGGAGAATGTGGGTTTATCGCTGCTAATCTCTATGCCAAEST: gi|88989830|gb|CI018708.1|CI018708
genomic: ACAAATATGAAGTGTCTAACACCACCgtaagttaca ... ataacatcagATCTGCGCTTGATGGAGAATGTGGGTTTATCGCTGCTAATCTCTATGCCAA
EST: TTTTTGGATCATATCATCAAATCGACAAATATGAAGTGTCTAACACCACC ATCTGCGCTTGATGGAGAATGTGGGTTTATCGCTGCTAATCTCTATGCCAAEST: gi|88197668|gb|CI197518.1|CI197518
genomic: TTTTTGGATCATATCATCAAATCGACAAATATGAAGTGTCTAACACCACCgtaagttaca ... ataacatcagATCTGCGCTTGATGGAGAATGTGGGTTTATCGCTGCTAATCTCTATGCCAA
EST: TTTTTGGATCATATCATCAAATCGACAAATATGAAGTGTCTAACACCACC ATCTGCGCTTGATGGAGAATGTGGGTTTATCGCTGCTAATCTCTATGCCAAEST: gi|86478308|gb|CI120941.1|CI120941
genomic: TTTTTGGATCATATCATCAAATCGACAAATATGAAGTGTCTAACACCACCgtaagttaca ... ataacatcagATCTGCGCTTGATGGAGAATGTGGGTTTATCGCTGCTAATCTCTATGCCAA
EST: TTTTTGGATCATATCATCAAATCGACAAATATGAAGTGTCTAACACCACC ATCTGCGCTTGATGGAGAATGTGGGTTTATCGCTGCTAATCTCTATGCCAAEST: gi|87038936|gb|CI193558.1|CI193558
genomic: TTTTTGGATCATATCATCAAATCGACAAATATGAAGTGTCTAACACCACCgtaagttaca ... ataacatcagATCTGCGCTTGATGGAGAATGTGGGTTTATCGCTGCTAATCTCTATGCCAA
EST: TTTTTGGATCATATCATCAAATCGACAAATATGAAGTGTCTAACACCACC ATCTGCGCTTGATGGAGAATGTGGGTTTATCGCTGCTAATCTCTATGCCAAEST: gi|89163208|gb|CI100098.1|CI100098
genomic: TTTTTGGATCATATCATCAAATCGACAAATATGAAGTGTCTAACACCACCgtaagttaca ... ataacatcagATCTGCGCTTGATGGAGAATGTGGGTTTATCGCTGCTAATCTCTATGCCAA
EST: TTTTTGGATCATATCATCAAATCGACAAATATGAAGTGTCTAACACCACT ATCTGCGCTTGATGGAGAATGTGGGTTTATCGCTGCTAATCTCTATGCCAAEST: gi|86597005|gb|CI272600.1|CI272600
genomic: TTTTTGGATCATATCATCAAATCGACAAATATGAAGTGTCTAACACCACCgtaagttaca ... ataacatcagATCTGCGCTTGATGGAGAATGTGGGTTTATCGCTGCTAATCTCTATGCCAA
EST: TTTTTGGATCATATCATCAAATCGACAAATATGAAGTGTCTAACACCACC ATCTGCGCTTGATGGAGAATGTGGGTTTATCGCTGCTAATCTCTATGCCAAEST: gi|87035862|gb|CI190484.1|CI190484
genomic: TTTTTGGATCATATCATCAAATCGACAAATATGAAGTGTCTAACACCACCgtaagttaca ... ataacatcagATCTGCGCTTGATGGAGAATGTGGGTTTATCGCTGCTAATCTCTATGCCAA
EST: TTTTTGGATCATATCATCAAATCGACAAATATGAAGTGTCTAACACCACC ATCTGCGCTTGATGGAGAATGTGGGTTTATCGCTGCTAATCTCTATGCCAAEST: gi|87014992|gb|CI271591.1|CI271591
genomic: TTTTTGGATCATATCATCAAATCGACAAATATGAAGTGTCTAACACCACCgtaagttaca ... ataacatcagATCTGCGCTTGATGGAGAATGTGGGTTTATCGCTGCTAATCTCTATGCCAA
EST: TTTTTGGATCATATCATCAAATCGACAAATATGAAGTGTCTAACACCACC ATCTGCGCTTGATGGAGAATGTGGGTTTATCGCTGCTAATCTCTATGCCAAEST: gi|88198577|gb|CI198427.1|CI198427
genomic: TTTTTGGATCATATCATCAAATCGACAAATATGAAGTGTCTAACACCACCgtaagttaca ... ataacatcagATCTGCGCTTGATGGAGAATGTGGGTTTATCGCTGCTAATCTCTATGCCAA
EST: TTTTTGGATCATATCATCAAATCGACAAATATGAAGTGTCTAACACCACC ATCTGCGCTTGATGGAGAATGTGGGTTTATCGCTGCTAATCTCTATGCCAAEST: gi|87014898|gb|CI271497.1|CI271497
genomic: TTTTTGGATCATATCATCAAATCGACAAATATGAAGTGTCTAACACCACCgtaagttaca ... ataacatcagATCTGCGCTTGATGGAGAATGTGGGTTTATCGCTGCTAATCTCTATGCCAA
EST: TTTTTGGATCATATCATCAAATCGACAAATATGAAGTGTCTAACGCCACC ATCTGCGCTTGATGGAGAATGTGGGTTTATCGCTGCTGATCTCTATGCCAAEST: gi|88198630|gb|CI198480.1|CI198480
genomic: TTTTTGGATCATATCATCAAATCGACAAATATGAAGTGTCTAACACCACCgtaagttaca ... ataacatcagATCTGCGCTTGATGGAGAATGTGGGTTTATCGCTGCTAATCTCTATGCCAA
EST: TTTTTGGATCATATCATCAAATCGACAAATATGAAGTGTCTAACACCACC ATCTGCGCTTGATGGAGAATGTGGGTTTATCGCTGCTAATCTCTATGCCAAEST: gi|86592998|gb|CI270555.1|CI270555
genomic: TTTTTGGATCATATCATCAAATCGACAAATATGAAGTGTCTAACACCACCgtaagttaca ... ataacatcagATCTGCGCTTGATGGAGAATGTGGGTTTATCGCTGCTAATCTCTATGCCAA
EST: TTTTTGGATCATATCATCAAATCGACAAATATGAAGTGTCTAACACCACC ATCTGCGCTTGATGGAGAATGTGGGTTTATCGCTGCTAATCTCTATGCCAAEST: gi|51946041|gb|CV152382.1|CV152382
genomic: TTTTTGGATCATATCATCAAATCGACAAATATGAAGTGTCTAACACCACCgtaagttaca ... ataacatcagATCTGCGCTTGATGGAGAATGTGGGTTTATCGCTGCTAATCTCTATGCCAA
EST: TTTTTGGATCATATCATCAAATCGACAAATATGAAGTGTCTAACACCACC ATCTGCGCTTGATGGAGAATGTGGGTTTATCGCTGCTAATCTCTATGCCAAEST: gi|87036189|gb|CI190811.1|CI190811
genomic: TTTTTGGATCATATCATCAAATCGACAAATATGAAGTGTCTAACACCACCgtaagttaca ... ataacatcagATCTGCGCTTGATGGAGAATGTGGGTTTATCGCTGCTAATCTCTATGCCAA
EST: TTTTTGGATCATATCATCAAATCGACAAATATGAAGTGTCTAACACCACC ATCTGCGCTTGATGGAGAATGTGGGTTTATCGCTGCTAATCTCTATGCCAAEST: gi|86597625|gb|CI274616.1|CI274616
genomic: TTTTTGGATCATATCATCAAATCGACAAATATGAAGTGTCTAACACCACCgtaagttaca ... ataacatcagATCTGCGCTTGATGGAGAATGTGGGTTTATCGCTGCTAATCTCTATGCCAA
EST: CATCAAATCGACAAATATGAAGTGTCTAACACCACC ATCTGCGCTTGATGGAGAATGTGGGTTTATCGCTGCTAATCTCTATGCCAAEST: gi|87040560|gb|CI195182.1|CI195182
genomic: CATCAAATCGACAAATATGAAGTGTCTAACACCACCgtaagttaca ... ataacatcagATCTGCGCTTGATGGAGAATGTGGGTTTATCGCTGCTAATCTCTATGCCAA
EST: TTTTTGGATCATATCATCAAATCGACAAATATGAAGTGTCTAACACCACC ATCTGCGCTTGATGGAGAATGTGGGTTTATCGCTGCTAATCTCTATGCCAAEST: gi|86597765|gb|CI274756.1|CI274756
genomic: TTTTTGGATCATATCATCAAATCGACAAATATGAAGTGTCTAACACCACCgtaagttaca ... ataacatcagATCTGCGCTTGATGGAGAATGTGGGTTTATCGCTGCTAATCTCTATGCCAA
EST: TTTTTGGATCATATCATCAAATCGACAAATATGAAGTGTCTAACACCACC ATCTGCGCTTGATGGAGAATGTGGGTTTATCGCTGCTAATCTCTATGCCAAEST: gi|86481172|gb|CI123805.1|CI123805
genomic: TTTTTGGATCATATCATCAAATCGACAAATATGAAGTGTCTAACACCACCgtaagttaca ... ataacatcagATCTGCGCTTGATGGAGAATGTGGGTTTATCGCTGCTAATCTCTATGCCAA
EST: CAAATCGACAAATATGAAGTGTCTAACACCACC ATCTGCGCTTGATGGAGAATCTGGGTTTATCGCTGCTAATCTCTATGCCAAEST: gi|88234904|gb|CI232755.1|CI232755
genomic: CAAATCGACAAATATGAAGTGTCTAACACCACCgtaagttaca ... ataacatcagATCTGCGCTTGATGGAGAATGTGGGTTTATCGCTGCTAATCTCTATGCCAA
EST: CAAATCGACAAATATGAAGTGTCTAACACCACC ATCTGCGCTTGATGGAGAATGTGGGTTTATCGCTGCTAATCTCTATGCCAAEST: gi|88197993|gb|CI197843.1|CI197843
genomic: CAAATCGACAAATATGAAGTGTCTAACACCACCgtaagttaca ... ataacatcagATCTGCGCTTGATGGAGAATGTGGGTTTATCGCTGCTAATCTCTATGCCAA
EST: TTTTTGGATCATATCATCAAATCGACAAATATGAAGTGTCTAACACCACC ATCTGCGCTTGATGGAGAATGTGGGTTTATCGCTGCTAATCTCTATGCCAAEST: gi|87039782|gb|CI194404.1|CI194404
genomic: TTTTTGGATCATATCATCAAATCGACAAATATGAAGTGTCTAACACCACCgtaagttaca ... ataacatcagATCTGCGCTTGATGGAGAATGTGGGTTTATCGCTGCTAATCTCTATGCCAA
EST: TTTTTGGATCATATCATCAAATCGACAAATATGAAGTGTCTAACACCACC ATCTGCGCTTGATGGAGAATGTGGGTTTATCGCTGCTAATCTCTATGCCAAEST: gi|88197752|gb|CI197602.1|CI197602
genomic: TTTTTGGATCATATCATCAAATCGACAAATATGAAGTGTCTAACACCACCgtaagttaca ... ataacatcagATCTGCGCTTGATGGAGAATGTGGGTTTATCGCTGCTAATCTCTATGCCAA
EST: ATATGAAGTGTCTAACACCACC ATCTGCGCTTGATGGAGAATGTGGGTTTATCGCTGCTAATCTCTATGCCAAEST: gi|86868050|gb|CI331836.1|CI331836
genomic: ATATGAAGTGTCTAACACCACCgtaagttaca ... ataacatcagATCTGCGCTTGATGGAGAATGTGGGTTTATCGCTGCTAATCTCTATGCCAA
EST: TGTCTAACACCACC ATCTGCGCTTGATGGAGAATGTGGGTTTATCCCTGCTAATCTCTATGCCAAEST: gi|86521048|gb|CI161254.1|CI161254
genomic: TGTCTAACACCACCgtaagttaca ... ataacatcagATCTGCGCTTGATGGAGAATGTGGGTTTATCGCTGCTAATCTCTATGCCAA
EST: TTTTTGGATCATATCATCAAATCGACAAATATGAAGTGTCTAACACCACC ATCTGCGCTTGATGGAGAATGTGGGTTTATCGCTGCTAATCTCTATGCCAAEST: gi|88251531|gb|CI349959.1|CI349959
genomic: TTTTTGGATCATATCATCAAATCGACAAATATGAAGTGTCTAACACCACCgtaagttaca ... ataacatcagATCTGCGCTTGATGGAGAATGTGGGTTTATCGCTGCTAATCTCTATGCCAA
EST: TATGAAGTGTCTAACACCACC ATCTGCGCTTGATGGAGAATGTGGGTTTATCCCTGCTAATCTCTATGCCAAEST: gi|87040139|gb|CI193348.1|CI193348
genomic: TATGAAGTGTCTAACACCACCgtaagttaca ... ataacatcagATCTGCGCTTGATGGAGAATGTGGGTTTATCGCTGCTAATCTCTATGCCAA
EST: TTTTTGGATCATATCATCAAATCGACAAATATGAAGTGTCTAACACCACC ATCTGTGCTTGATGGAGAATGTGGGTTTATCGCTGCTAATCTCTATGCCAAEST: gi|87036024|gb|CI189471.1|CI189471
genomic: TTTTTGGATCATATCATCAAATCGACAAATATGAAGTGTCTAACACCACCgtaagttaca ... ataacatcagATCTGCGCTTGATGGAGAATGTGGGTTTATCGCTGCTAATCTCTATGCCAA
EST: TTTTTGGATCATATCATCAAATCGACAAATATGAAGTGTCTAACACCACC ATCTGCGCTTGATGGAGAATGTGGGTTTATCGCTGCTAATCTCTATGCCCAEST: gi|86521002|gb|CI161208.1|CI161208
genomic: TTTTTGGATCATATCATCAAATCGACAAATATGAAGTGTCTAACACCACCgtaagttaca ... ataacatcagATCTGCGCTTGATGGAGAATGTGGGTTTATCGCTGCTAATCTCTATG-CCA
EST: TTTTTGGATCATATCATCAAATCGACAAATATGAAGTGTCTAACACCACC ATCTGCGCTTGATGGAGAATGTGGGTTTATCGCTGCTAATCTCTATGCCAAEST: gi|86481313|gb|CI123946.1|CI123946
genomic: TTTTTGGATCATATCATCAAATCGACAAATATGAAGTGTCTAACACCACCgtaagttaca ... ataacatcagATCTGCGCTTGATGGAGAATGTGGGTTTATCGCTGCTAATCTCTATGCCAA
EST: TTTTTGGATCATATCATCAAATCGACAAATATGAGGTGTCTAACACCACC ATCTGCGCTTGATGGAGAATGTGGGTTTATCGCTGCTAATCTCTATGCCAAEST: gi|87041838|gb|CI196460.1|CI196460
genomic: TTTTTGGATCATATCATCAAATCGACAAATATGAAGTGTCTAACACCACCgtaagttaca ... ataacatcagATCTGCGCTTGATGGAGAATGTGGGTTTATCGCTGCTAATCTCTATGCCAA
EST: TTTTTGGATCATATCATCAAATCGACAAATATGAAGTGTCTAACACCACC ATCTGCGCTTGATGGAGAATGTGGGTTTATCGCTGCTAATCTCTATGCCAAEST: gi|87038971|gb|CI193593.1|CI193593
genomic: TTTTTGGATCATATCATCAAATCGACAAATATGAAGTGTCTAACACCACCgtaagttaca ... ataacatcagATCTGCGCTTGATGGAGAATGTGGGTTTATCGCTGCTAATCTCTATGCCAA
EST: TTTTTGGATCATATCATCAAATCGACAAATATGAAGTGTCTAACACCACC ATCTGCGCTTGATGGAGAATGTGGGTTTATCGCTGCTAATCTCTATGCCAAEST: gi|58677417|gb|CK066104.1|CK066104
genomic: TTTTTGGATCATATCATCAAATCGACAAATATGAAGTGTCTAACACCACCgtaagttaca ... ataacatcagATCTGCGCTTGATGGAGAATGTGGGTTTATCGCTGCTAATCTCTATGCCAA
EST: TTTTTGGATCATATCATCAAATCGACAAATATGAAGTGTCTAACACCACC ATCTGCGCTTGATGGAGAATGTGGGTTTATCGCTGCTAATCTCTATGCCAAEST: gi|88198201|gb|CI198051.1|CI198051
genomic: TTTTTGGATCATATCATCAAATCGACAAATATGAAGTGTCTAACACCACCgtaagttaca ... ataacatcagATCTGCGCTTGATGGAGAATGTGGGTTTATCGCTGCTAATCTCTATGCCAA
EST: TTTTTGGATCATATCATCAAATCGACAAATATGAAGTGTCTAACACCACC ATCTGCGCTTGATGGAGAATGTGGGTTTATCGCTGCTAATCTCTATGCCAAEST: gi|88197782|gb|CI197632.1|CI197632
genomic: TTTTTGGATCATATCATCAAATCGACAAATATGAAGTGTCTAACACCACCgtaagttaca ... ataacatcagATCTGCGCTTGATGGAGAATGTGGGTTTATCGCTGCTAATCTCTATGCCAA
EST: TTTTTGGATCATATCATCAAATCGACAAATATGAAGTGTCTAACACCACC ATCTGCGCTTGATGGAGAATGTGGGTTTATCGCTGCTAATCTCTATGCCAAEST: gi|86513836|gb|CI156469.1|CI156469
genomic: TTTTTGGATCATATCATCAAATCGACAAATATGAAGTGTCTAACACCACCgtaagttaca ... ataacatcagATCTGCGCTTGATGGAGAATGTGGGTTTATCGCTGCTAATCTCTATGCCAA
EST: TTTTTGGATCATATCATCAAATCGACAAATATGAAGTGTCTAACACCACC ATCTGCGCTTGATGGAGAATGTGGGTTTATCGCTGCTAATCTCTATGCCAAEST: gi|87030272|gb|CI270282.1|CI270282
genomic: TTTTTGGATCATATCATCAAATCGACAAATATGAAGTGTCTAACACCACCgtaagttaca ... ataacatcagATCTGCGCTTGATGGAGAATGTGGGTTTATCGCTGCTAATCTCTATGCCAA
EST: TTTTTGGATCATATCATCAAATCGACAAATATGAAGTGTCTAACACCACC ATCTGCGCTTGATGGAGAATGTGGGTTTATCGCTGCTAATCTCTATGCCAAEST: gi|87031727|gb|CI272428.1|CI272428
genomic: TTTTTGGATCATATCATCAAATCGACAAATATGAAGTGTCTAACACCACCgtaagttaca ... ataacatcagATCTGCGCTTGATGGAGAATGTGGGTTTATCGCTGCTAATCTCTATGCCAA
EST: TCATCAAATCGACAAATATGAAGTGTCTAACACCACC ATCTGCGCTTGATGGAGAATGTGGGTTTATCGCTGCTAATCTCTATGCCAAEST: gi|88234858|gb|CI232709.1|CI232709
genomic: TCATCAAATCGACAAATATGAAGTGTCTAACACCACCgtaagttaca ... ataacatcagATCTGCGCTTGATGGAGAATGTGGGTTTATCGCTGCTAATCTCTATGCCAA
EST: TTTTTGGATCATATCATCAAATCGACAAATATGAAGTGTCTAACACCACC ATCTGCGCTTGATGGAGAATGTGGGTTTATCGCTGCTAATCTCTATGCCAAEST: gi|86859014|gb|CI276961.1|CI276961
genomic: TTTTTGGATCATATCATCAAATCGACAAATATGAAGTGTCTAACACCACCgtaagttaca ... ataacatcagATCTGCGCTTGATGGAGAATGTGGGTTTATCGCTGCTAATCTCTATGCCAA
EST: TTTTTGGATCATATCATCAAATCGACAAATATGAAGTGTCTAACACCACC ATCTGCGCTTGATGGAGAATGTGGGTTTATCGCTGCTAATCTCTATGCCAAEST: gi|86477487|gb|CI120120.1|CI120120
genomic: TTTTTGGATCATATCATCAAATCGACAAATATGAAGTGTCTAACACCACCgtaagttaca ... ataacatcagATCTGCGCTTGATGGAGAATGTGGGTTTATCGCTGCTAATCTCTATGCCAA
EST: TTTTTGGATCATATCATCAAATCGACAAATATGAAGTGTCTAACACCACC ATCTGCGCTTGATGGAGAATGTGGGTTTATCGCTGCTAATCTCTATGCCAAEST: gi|86436845|gb|CI118567.1|CI118567
genomic: TTTTTGGATCATATCATCAAATCGACAAATATGAAGTGTCTAACACCACCgtaagttaca ... ataacatcagATCTGCGCTTGATGGAGAATGTGGGTTTATCGCTGCTAATCTCTATGCCAA
EST: TTTTTGGATCATATCATCAAATCGACAAATATGAAGTGTCTAACACCACC ATCTGCGCTTGATGGAGAATGTGGGTTTATCGCTGCTAATCTCTATGCCAAEST: gi|87036841|gb|CI191463.1|CI191463
genomic: TTTTTGGATCATATCATCAAATCGACAAATATGAAGTGTCTAACACCACCgtaagttaca ... ataacatcagATCTGCGCTTGATGGAGAATGTGGGTTTATCGCTGCTAATCTCTATGCCAA
EST: TTTTTGGATCATATCATCAAATCGACAAATATGAAGTGTCTAACACCACC ATCTGCGCTTGATGGAGAATGTGGGTTTATCGCTGCTAATCTCTATGCCAAEST: gi|87039000|gb|CI193622.1|CI193622
genomic: TTTTTGGATCATATCATCAAATCGACAAATATGAAGTGTCTAACACCACCgtaagttaca ... ataacatcagATCTGCGCTTGATGGAGAATGTGGGTTTATCGCTGCTAATCTCTATGCCAA
EST: TTTTTGGATCATATCATCAAATCGACAAATATGAAGTGTCTAACACCACC ATCTGCGCTTGATGGAGAATGTGGGTTTATCGCTGCTAATCTCTATGCCAAEST: gi|87036825|gb|CI191447.1|CI191447
genomic: TTTTTGGATCATATCATCAAATCGACAAATATGAAGTGTCTAACACCACCgtaagttaca ... ataacatcagATCTGCGCTTGATGGAGAATGTGGGTTTATCGCTGCTAATCTCTATGCCAA
EST: TTTTTGGATCATATCATCAAATCGACAAATATGAAGTGTCTAACACCACC ATCTGCGCTTGATGGAGAATGTGGGTTTATCGCTGCTAATCTCTATGCCAAEST: gi|87035268|gb|CI189890.1|CI189890
genomic: TTTTTGGATCATATCATCAAATCGACAAATATGAAGTGTCTAACACCACCgtaagttaca ... ataacatcagATCTGCGCTTGATGGAGAATGTGGGTTTATCGCTGCTAATCTCTATGCCAA
EST: TTTTTGGATCATATCATCAAATCGACAAATATGAAGTGTCTAACACCACC ATCTGCGCTTGATGGAGAATGTGGGTTTATCGCTGCTAATCTCTATGCCAA
genomic: TTTTTGGATCATATCATCAAATCGACAAATATGAAGTGTCTAACACCACCgtaagttaca ... ataacatcagATCTGCGCTTGATGGAGAATGTGGGTTTATCGCTGCTAATCTCTATGCCAA
gctgcttggttgctaataccgctgaccctattatacttgtatatgataacatcagATCTGCGCTTGATGGAGAATGTGGGTTTATCGCTGCTAATCTCTATGCCAAGAGTGTTTTTGGTGAGGATGCATTGGTGAACATCAGCGTTGAAAAGCAA
tgataac putative branch site (score: 2)
tattatacttgtatat TA-rich tract
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| ttccaacatcaaagctgggttcttcatagcatgtctaatgccactgctgcttggttgctaataccgctgaccctattatacttgtatatgataacatcagATCTGCGCTTGATGGAGAATGTGGGTTTATCGCTGCTAATCTCTATGCCAAGAGTGTTTTTGGTGAGGATGCATTGGTGAACATCAGCGTTGAAAAGCAA
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - GAGGAT
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - AGGATG
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - AAGCAA
- - - catcaaa
- - - - - - - - - - - - - - gcatgtc
- - - - - - - - - - - - - - - - - - -atgccac
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - tgctgct
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -tggttgc
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - accgctg
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - cttgtat