1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' |
...tgcaatcgttaataccttttcaatgatattctttgcaaccacttcctagatgtatcactgtaaagtcactaccttactgtcaaactttttttgtccacagAGGTTGCTGGCTAAGTATGGATCTCTAATCTCAGTGATCTCCATCATGGTCCTGTTCGTATACTTGGTAGCTTCACCATCAAAATCCAGTGCAAAGGGAA
species | Glycine max |
transcript | GLYMA16G05530.2 |
intron # | 4 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: TGAGAAGAAGTTTGAATGGGCTAAG AGGTTGCTGGCTAAGTATGGATCTCTAATCTCAGTGATCTCCATCATGGTEST: gi|7286236|gb|AW598723.1|AW598723
genomic: TGAGAAGAAGTTTGAATGGG-TAT-gtttccttat ... ttgtccacagAGGTTGCTGGCTAAGTATGGATCTCTAATCTCAGTGATCTCCATCATGGT
EST: TGAGAAGAAGTTTGAATGGGCTAAG AGGTTGCTGGCTAAGTATGGATCTCTAATCTCAGTGATCTCCATCATGGTEST: gi|213617119|gb|DB963592.1|DB963592
genomic: TGAGAAGAAGTTTGAATGGG-TAT-gtttccttat ... ttgtccacagAGGTTGCTGGCTAAGTATGGATCTCTAATCTCAGTGATCTCCATCATGGT
EST: TGAGAAGAAGTTTGAATGGGCTAAG AGGTTGCTGGCTAAGTATGGATCTCTAATCTCAGTGATCTCCATCATGGTEST: gi|213617119|gb|DB963592.1|DB963592
genomic: TGAGAAGAAGTTTGAATGGG-TAT-gtttccttat ... ttgtccacagAGGTTGCTGGCTAAGTATGGATCTCTAATCTCAGTGATCTCCATCATGGT
EST: TGAGAAGAAGTTTGAATGGGCTAAG AGGTTGCTGGCTAAGTATGGATCTCTAATCTCAGTGATCTCCATCATGGTEST: gi|151410082|gb|EV279890.1|EV279890
genomic: TGAGAAGAAGTTTGAATGGG-TAT-gtttccttat ... ttgtccacagAGGTTGCTGGCTAAGTATGGATCTCTAATCTCAGTGATCTCCATCATGGT
EST: TGAGAAGAAGTTTGAATGGGCTAAG AGGTTGCTGGCTAAGTATGGATCTCTAATCTCAGTGATCTCCATCATGGTEST: gi|151410082|gb|EV279890.1|EV279890
genomic: TGAGAAGAAGTTTGAATGGG-TAT-gtttccttat ... ttgtccacagAGGTTGCTGGCTAAGTATGGATCTCTAATCTCAGTGATCTCCATCATGGT
EST: TGAGAAGAAGTTTGAATGGGCTAAG AGGTTGCTGGCTAAGTATGGATCTCTAATCTCAGTGATCTCCATCATGGTEST: gi|21994234|gb|BQ785762.1|BQ785762
genomic: TGAGAAGAAGTTTGAATGGG-TAT-gtttccttat ... ttgtccacagAGGTTGCTGGCTAAGTATGGATCTCTAATCTCAGTGATCTCCATCATGGT
EST: TGAGAAGAAGTTTGAATGGGCTAAG AGGTTGCTGGCTAAGTATGGATCTCTAATCTCAGTGATCTCCATCATGGTEST: gi|21994234|gb|BQ785762.1|BQ785762
genomic: TGAGAAGAAGTTTGAATGGG-TAT-gtttccttat ... ttgtccacagAGGTTGCTGGCTAAGTATGGATCTCTAATCTCAGTGATCTCCATCATGGT
EST: TGAGAAGAAGTTTGAATGGGCTAAG AGGTTGCTGGCTAAGTATGGATCTCTAATCTCAGTGATCTCCATCATGGTEST: gi|6069921|gb|AW099507.1|AW099507
genomic: TGAGAAGAAGTTTGAATGGG-TAT-gtttccttat ... ttgtccacagAGGTTGCTGGCTAAGTATGGATCTCTAATCTCAGTGATCTCCATCATGGT
EST: CTCCTGAGAAGAAGTTTGAATGGGCTAAG AGGTTGCTGGCTAAGTATGGATCTCTAATCTCAGTGATCTCCATCATGGTEST: gi|13791399|gb|BG653990.1|BG653990
genomic: CTCCTGAGAAGAAGTTTGAATGGG-T-ATgtttccttat ... ttgtccacagAGGTTGCTGGCTAAGTATGGATCTCTAATCTCAGTGATCTCCATCATGGT
EST: TGAGAAGAAGTTTGAATGGGCTAAG AGGTTGCTGGCTAAGTATGGATCTCTAATCTCAGTGATCTCCATCATGGTEST: gi|13791399|gb|BG653990.1|BG653990
genomic: TGAGAAGAAGTTTGAATGGG-TAT-gtttccttat ... ttgtccacagAGGTTGCTGGCTAAGTATGGATCTCTAATCTCAGTGATCTCCATCATGGT
EST: TGAGAAGAAGTTTGAATGGGCTAAG AGGTTGCTGGCTAAGTATGGATCTCTAATCTCAGTGATCTCCATCATGGTEST: gi|192309917|gb|FK001461.1|FK001461
genomic: TGAGAAGAAGTTTGAATGGG-TAT-gtttccttat ... ttgtccacagAGGTTGCTGGCTAAGTATGGATCTCTAATCTCAGTGATCTCCATCATGGT
EST: TGGACGTTCTTTCTGATAGACCTCCTGAGAAGAAGTTTGAATGGGCTAAG AGGTTGCTGGCTAAGTATGGATCTCTAATCTCAGTGATCTCCATCATGGTEST: gi|17020635|gb|BM091669.1|BM091669
genomic: TGGACGTTCTTTCTGATAGACCTCCTGAGAAGAAGTTTGAATGGG-T-ATgtttccttat ... ttgtccacagAGGTTGCTGGCTAAGTATGGATCTCTAATCTCAGTGATCTCCATCATGGT
EST: TGGACGTTCTTTCTGATAGACCTCCTGAGAAGAAGTTTGAATGGGCTAAG AGGTTGCTGGCTAAGTATGGATCTCTAATCTCAGTGATCTCCATCATGGTEST: gi|4306520|gb|AI443916.1|AI443916
genomic: TGGACGTTCTTTCTGATAGACCTCCTGAGAAGAAGTTTGAATGGG-T-ATgtttccttat ... ttgtccacagAGGTTGCTGGCTAAGTATGGATCTCTAATCTCAGTGATCTCCATCATGGT
EST: CTCCTGAGAAGAAGTTTGAATGGGCTAAG AGGTTGCTGGCTAAGTATGGATCTCTAATCTCAGTGATCTCCATCATGGTEST: gi|192328456|gb|FK020730.1|FK020730
genomic: CTCCTGAGAAGAAGTTTGAATGGG-T-ATgtttccttat ... ttgtccacagAGGTTGCTGGCTAAGTATGGATCTCTAATCTCAGTGATCTCCATCATGGT
EST: TGGACGTTCTTTCTGATAGACCTCCTGAGAAGAAGTTTGAATGGGCTAAG AGGTTGCTGGCTAAGTATGGATCTCTAATCTCAGTGATCTCCATCATGGTEST: gi|58019764|gb|CX706506.1|CX706506
genomic: TGGACGTTCTTTCTGATAGACCTCCTGAGAAGAAGTTTGAATGGG-T-ATgtttccttat ... ttgtccacagAGGTTGCTGGCTAAGTATGGATCTCTAATCTCAGTGATCTCCATCATGGT
EST: TGGACGTTCTTTCTGATAGACCTCCTGAGAAGAAGTTTGAATGGGCTAAG AGGTTGCTGGCTAAGTATGGATCTCTAATCTCAGTGATCTCCATCATGGTEST: gi|14991791|gb|BI317464.1|BI317464
genomic: TGGACGTTCTTTCTGATAGACCTCCTGAGAAGAAGTTTGAATGGG-T-ATgtttccttat ... ttgtccacagAGGTTGCTGGCTAAGTATGGATCTCTAATCTCAGTGATCTCCATCATGGT
EST: TGAGAAGAAGTTTGAATGGGCTAAG AGGTTGCTGGCTAAGTATGGATCTCTAATCTCAGTGATCTCCATCATGGTEST: gi|14991791|gb|BI317464.1|BI317464
genomic: TGAGAAGAAGTTTGAATGGG-TAT-gtttccttat ... ttgtccacagAGGTTGCTGGCTAAGTATGGATCTCTAATCTCAGTGATCTCCATCATGGT
EST: TGAGAAGAAGTTTGAATGGGCTAAG AGGTTGCTGGCTAAGTATGGATCTCTAATCTCAGTGATCTCCATCATGGTEST: gi|11688866|gb|BF596542.1|BF596542
genomic: TGAGAAGAAGTTTGAATGGG-TAT-gtttccttat ... ttgtccacagAGGTTGCTGGCTAAGTATGGATCTCTAATCTCAGTGATCTCCATCATGGT
EST: TGAGAAGAAGTTTGAATGGGCTAAG AGGTTGCTGGCTAAGTATGGATCTCTAATCTCAGTGATCTCCATCATGGTEST: gi|11688866|gb|BF596542.1|BF596542
genomic: TGAGAAGAAGTTTGAATGGG-TAT-gtttccttat ... ttgtccacagAGGTTGCTGGCTAAGTATGGATCTCTAATCTCAGTGATCTCCATCATGGT
EST: TGAGAAGAAGTTTGAATGGGCTAAG AGGTTGCTGGCTAAGTATGGATCTCTAATCTCAGTGATCTCCATCATGGTEST: gi|151403836|gb|EV273646.1|EV273646
genomic: TGAGAAGAAGTTTGAATGGG-TAT-gtttccttat ... ttgtccacagAGGTTGCTGGCTAAGTATGGATCTCTAATCTCAGTGATCTCCATCATGGT
EST: TGGGAAGAAGTTTGAATGGGCTAAG AGGTTGCTGGCTAAGTATGGATCTCTAATCTCAGTGATCTCCATCATGGTEST: gi|151403836|gb|EV273646.1|EV273646
genomic: TGAGAAGAAGTTTGAATGGG-TAT-gtttccttat ... ttgtccacagAGGTTGCTGGCTAAGTATGGATCTCTAATCTCAGTGATCTCCATCATGGT
EST: TGGGAAGAAGTTTGAATGGGCTAAG AGGTTGCTGGCTAAGTATGGATCTCTAATCTCAGTGATCTCCATCATGGTEST: gi|254345416|gb|GR855859.1|GR855859
genomic: TGAGAAGAAGTTTGAATGGG-TAT-gtttccttat ... ttgtccacagAGGTTGCTGGCTAAGTATGGATCTCTAATCTCAGTGATCTCCATCATGGT
EST: TGAGAAGAAGTTTGAATGGGCTAAG AGGTTGCTGGCTAAGTATGGATCTCTAATCTCAGTGATCTCCATCATGGTEST: gi|254345416|gb|GR855859.1|GR855859
genomic: TGAGAAGAAGTTTGAATGGG-TAT-gtttccttat ... ttgtccacagAGGTTGCTGGCTAAGTATGGATCTCTAATCTCAGTGATCTCCATCATGGT
EST: TGAGAAGAAGTTTGAATGGGCTAAG AGGTTGCTGGCTAAGTATGGATCTCTAATCTCAGTGATCTCCATCATGGTEST: gi|31460384|gb|CD402352.1|CD402352
genomic: TGAGAAGAAGTTTGAATGGG-TAT-gtttccttat ... ttgtccacagAGGTTGCTGGCTAAGTATGGATCTCTAATCTCAGTGATCTCCATCATGGT
EST: TGAGAAGAAGTTTGAATGGGCTAAG AGGTTGCTGGCTAAGTATGGATCTCTAATCTCAGTGATCTCCATCATGGTEST: gi|31460384|gb|CD402352.1|CD402352
genomic: TGAGAAGAAGTTTGAATGGG-TAT-gtttccttat ... ttgtccacagAGGTTGCTGGCTAAGTATGGATCTCTAATCTCAGTGATCTCCATCATGGT
EST: TGAGAAGAAGTTTGAATGGGCTAAG AGGTTGCTGGCTAAGTATGGATCTCTAATCTCAGTGATCTCCATCATGGTEST: gi|58019284|gb|CX706026.1|CX706026
genomic: TGAGAAGAAGTTTGAATGGG-TAT-gtttccttat ... ttgtccacagAGGTTGCTGGCTAAGTATGGATCTCTAATCTCAGTGATCTCCATCATGGT
EST: TGAGAAGAAGTTTGAATGGGCTAAG AGGTTGCTGGCTAAGTATGGATCTCTAATCTCAGTGATCTCCATCATGGTEST: gi|58019284|gb|CX706026.1|CX706026
genomic: TGAGAAGAAGTTTGAATGGG-TAT-gtttccttat ... ttgtccacagAGGTTGCTGGCTAAGTATGGATCTCTAATCTCAGTGATCTCCATCATGGT
EST: TGAGAAGAAGTTTGAATGGGCTAAG AGGTTGCTGGCTAAGTATGGATCTCTAATCTCAGTGATCTCCATCATGGTEST: gi|192296517|gb|FG989838.1|FG989838
genomic: TGAGAAGAAGTTTGAATGGG-TAT-gtttccttat ... ttgtccacagAGGTTGCTGGCTAAGTATGGATCTCTAATCTCAGTGATCTCCATCATGGT
EST: TGAGAAGAAGTTTGAATGGGCTAAG AGGTTGCTGGCTAAGTATGGATCTCTAATCTCAGTGATCTCCATCATGGTEST: gi|192296517|gb|FG989838.1|FG989838
genomic: TGAGAAGAAGTTTGAATGGG-TAT-gtttccttat ... ttgtccacagAGGTTGCTGGCTAAGTATGGATCTCTAATCTCAGTGATCTCCATCATGGT
EST: TGAGAAGAAGTTTGAATGGGCTAAG AGGTTGCTGGCTAAGTATGGATCTCTAATCTCAGTGATCTCCATCATGGTEST: gi|21285290|gb|BQ473161.1|BQ473161
genomic: TGAGAAGAAGTTTGAATGGG-TAT-gtttccttat ... ttgtccacagAGGTTGCTGGCTAAGTATGGATCTCTAATCTCAGTGATCTCCATCATGGT
EST: TGAGAAGAAGTTTGAATGGGCTAAG AGGTTGCTGGCTAAGTATGGATCTCTAATCTCAGTGATCTCCATCATGGTEST: gi|21285290|gb|BQ473161.1|BQ473161
genomic: TGAGAAGAAGTTTGAATGGG-TAT-gtttccttat ... ttgtccacagAGGTTGCTGGCTAAGTATGGATCTCTAATCTCAGTGATCTCCATCATGGT
EST: TGAGAAGAAGTTTGAATGGGCTAAG AGGTTGCTGGCTAAGTATGGATCTCTAATCTCAGTGATCTCCATCATGGTEST: gi|26056181|gb|CA799095.1|CA799095
genomic: TGAGAAGAAGTTTGAATGGG-TAT-gtttccttat ... ttgtccacagAGGTTGCTGGCTAAGTATGGATCTCTAATCTCAGTGATCTCCATCATGGT
EST: TGAGAAGAAGTTTGAATGGGCTAAG AGGTTGCTGGCTAAGTATGGATCTCTAATCTCAGTGATCTCCATCATGGTEST: gi|26056181|gb|CA799095.1|CA799095
genomic: TGAGAAGAAGTTTGAATGGG-TAT-gtttccttat ... ttgtccacagAGGTTGCTGGCTAAGTATGGATCTCTAATCTCAGTGATCTCCATCATGGT
EST: TGAGAAGAAGTTTGAATGGGCTAAG AGGTTGCTGGCTAAGTATGGATCTCTAATCTCAGTGATCTCCATCATGGTEST: gi|7925531|gb|AW831557.1|AW831557
genomic: TGAGAAGAAGTTTGAATGGG-TAT-gtttccttat ... ttgtccacagAGGTTGCTGGCTAAGTATGGATCTCTAATCTCAGTGATCTCCATCATGGT
EST: TGAGAAGAAGTTTGAATGGGCTAAG AGGTTGCTGGCTAAGTATGGATCTCTAATCTCAGTGATCTCCATCATGGTEST: gi|7925531|gb|AW831557.1|AW831557
genomic: TGAGAAGAAGTTTGAATGGG-TAT-gtttccttat ... ttgtccacagAGGTTGCTGGCTAAGTATGGATCTCTAATCTCAGTGATCTCCATCATGGT
EST: TGAGAAGAAGTTTGAATGGGCTAAG AGGTTGCTGGCTAAGTATGGATCTCTAATCTCAGTGATCTCCATCATGGTEST: gi|31561271|gb|CD487109.1|CD487109
genomic: TGAGAAGAAGTTTGAATGGG-TAT-gtttccttat ... ttgtccacagAGGTTGCTGGCTAAGTATGGATCTCTAATCTCAGTGATCTCCATCATGGT
EST: TGAGAAGAAGTTTGAATGGGCTAAG AGGTTGCTGGCTAAGTATGGATCTCTAATCTCAGTGATCTCCATCATGGTEST: gi|31561271|gb|CD487109.1|CD487109
genomic: TGAGAAGAAGTTTGAATGGG-TAT-gtttccttat ... ttgtccacagAGGTTGCTGGCTAAGTATGGATCTCTAATCTCAGTGATCTCCATCATGGT
EST: TGAGAAGAAGTTTGAATGGGCTAAG AGGTTGCTGGCTAAGTATGGATCTCTAATCTCAGTGATCTCCATCATGGTEST: gi|19935021|gb|BQ080051.1|BQ080051
genomic: TGAGAAGAAGTTTGAATGGG-TAT-gtttccttat ... ttgtccacagAGGTTGCTGGCTAAGTATGGATCTCTAATCTCAGTGATCTCCATCATGGT
EST: AGAAGTTTGAATGGGCTAAG AGGTTGCTGGCTAAGTATGGATCTCTAATCTCAGTGATCTCCATCATGGTEST: gi|9439886|gb|BE440398.1|BE440398
genomic: AGAAGTTTGAATGGG-T-ATgtttccttat ... ttgtccacagAGGTTGCTGGCTAAGTATGGATCTCTAATCTCAGTGATCTCCATCATGGT
EST: TGAGAAGAAGTTTGAATGGGCTAAG AGGTTGCTGGCTAAGTATGGATCTCTAATCTCAGTGATCTCCATCATGGTEST: gi|9439886|gb|BE440398.1|BE440398
genomic: TGAGAAGAAGTTTGAATGGG-TAT-gtttccttat ... ttgtccacagAGGTTGCTGGCTAAGTATGGATCTCTAATCTCAGTGATCTCCATCATGGT
EST: TGAGAAGAAGTTTGAATGGGCTAAG AGGTTGCTGGCTAAGTATGGATCTCTAATCTCAGTGATCTCCATCATGGTEST: gi|57574562|gb|CX547537.1|CX547537
genomic: TGAGAAGAAGTTTGAATGGG-TAT-gtttccttat ... ttgtccacagAGGTTGCTGGCTAAGTATGGATCTCTAATCTCAGTGATCTCCATCATGGT
EST: TGAGAAGAAGTTTGAATGGGCTAAG AGGTTGCTGGCTAAGTATGGATCTCTAATCTCAGTGATCTCCATCATGGTEST: gi|57574562|gb|CX547537.1|CX547537
genomic: TGAGAAGAAGTTTGAATGGG-TAT-gtttccttat ... ttgtccacagAGGTTGCTGGCTAAGTATGGATCTCTAATCTCAGTGATCTCCATCATGGT
EST: TGAGAAGAAGTTTGAATGGGCTAAG AGGTTGCTGGCTAAGTATGGATCTCTAATCTCAGTGATCTCCATCATGGTEST: gi|254347232|gb|GR853481.1|GR853481
genomic: TGAGAAGAAGTTTGAATGGG-TAT-gtttccttat ... ttgtccacagAGGTTGCTGGCTAAGTATGGATCTCTAATCTCAGTGATCTCCATCATGGT
EST: TGAGAAGAAGTTTGAATGGGCTAAG AGGTTGCTGGCTAAGTATGGATCTCTAATCTCAGTGATCTCCATCATGGTEST: gi|254347232|gb|GR853481.1|GR853481
genomic: TGAGAAGAAGTTTGAATGGG-TAT-gtttccttat ... ttgtccacagAGGTTGCTGGCTAAGTATGGATCTCTAATCTCAGTGATCTCCATCATGGT
EST: TGAGAAGAAGTTTGAATGGGCTAAG AGGTTGCTGGCTAAGTATGGATCTCTAATCTCAGTGATCTCCATCATGGTEST: gi|7589987|gb|AW705750.1|AW705750
genomic: TGAGAAGAAGTTTGAATGGG-TAT-gtttccttat ... ttgtccacagAGGTTGCTGGCTAAGTATGGATCTCTAATCTCAGTGATCTCCATCATGGT
EST: TGAGAAGAAGTTTGAATGGGCTAAG AGGTTGCTGGCTAAGTATGGATCTCTAATCTCAGTGATCTCCATCATGGTEST: gi|7589987|gb|AW705750.1|AW705750
genomic: TGAGAAGAAGTTTGAATGGG-TAT-gtttccttat ... ttgtccacagAGGTTGCTGGCTAAGTATGGATCTCTAATCTCAGTGATCTCCATCATGGT
EST: TGAGAAGAAGTTTGAATGGGCTAAG AGGTTGCTGGCTAAGTATGGATCTCTAATCTCAGTGATCTCCATCATGGTEST: gi|151408820|gb|EV278628.1|EV278628
genomic: TGAGAAGAAGTTTGAATGGG-TAT-gtttccttat ... ttgtccacagAGGTTGCTGGCTAAGTATGGATCTCTAATCTCAGTGATCTCCATCATGGT
EST: TGGACGTTCTTTCTGATAGACCTCCTGAGAAGAAGTTTGAATGGGCTAAG AGGTTGCTGGCTAAGTATGGATCTCTAATCTCAGTGATCTCCATCATGGTEST: gi|16997127|gb|BM086499.1|BM086499
genomic: TGGACGTTCTTTCTGATAGACCTCCTGAGAAGAAGTTTGAATGGG-T-ATgtttccttat ... ttgtccacagAGGTTGCTGGCTAAGTATGGATCTCTAATCTCAGTGATCTCCATCATGGT
EST: TGAGAAGAAGTTTGAATGGGCTAAG AGGTTGCTGGCTAAGTATGGATCTCTAATCTCAGTGATCTCCATCATGGTEST: gi|16997127|gb|BM086499.1|BM086499
genomic: TGAGAAGAAGTTTGAATGGG-TAT-gtttccttat ... ttgtccacagAGGTTGCTGGCTAAGTATGGATCTCTAATCTCAGTGATCTCCATCATGGT
EST: TGAGAAGAAGTTTGAATGGGCTAAG AGGTTGCTGGCTAAGTATGGATCTCTAATCTCAGTGATCTCCATCATGGTEST: gi|20814723|gb|BQ299201.1|BQ299201
genomic: TGAGAAGAAGTTTGAATGGG-TAT-gtttccttat ... ttgtccacagAGGTTGCTGGCTAAGTATGGATCTCTAATCTCAGTGATCTCCATCATGGT
EST: TGAGAAGAAGTTTGAATGGGCTAAG AGGTTGCTGGCTAAGTATGGATCTCTAATCTCAGTGATCTCCATCATGGTEST: gi|20814723|gb|BQ299201.1|BQ299201
genomic: TGAGAAGAAGTTTGAATGGG-TAT-gtttccttat ... ttgtccacagAGGTTGCTGGCTAAGTATGGATCTCTAATCTCAGTGATCTCCATCATGGT
EST: TGAGAAGAAGTTTGAATGGGCTAAG AGGTTGCTGGCTAAGTATGGATCTCTAATCTCAGTGATCTCCATCATGGTEST: gi|192294092|gb|FG986181.1|FG986181
genomic: TGAGAAGAAGTTTGAATGGG-TAT-gtttccttat ... ttgtccacagAGGTTGCTGGCTAAGTATGGATCTCTAATCTCAGTGATCTCCATCATGGT
EST: TGAGAAGAAGTTTGAATGGGCTAAG AGGTTGCTGGCTAAGTATGGATCTCTAATCTCAGTGATCTCCATCATGGTEST: gi|192294092|gb|FG986181.1|FG986181
genomic: TGAGAAGAAGTTTGAATGGG-TAT-gtttccttat ... ttgtccacagAGGTTGCTGGCTAAGTATGGATCTCTAATCTCAGTGATCTCCATCATGGT
EST: TGAGAAGAAGTTTGAATGGGCTAAG AGGTTGCTGGCTAAGTATGGATCTCTAATCTCAGTGATCTCCATCATGGTEST: gi|213589498|gb|DB981232.1|DB981232
genomic: TGAGAAGAAGTTTGAATGGG-TAT-gtttccttat ... ttgtccacagAGGTTGCTGGCTAAGTATGGATCTCTAATCTCAGTGATCTCCATCATGGT
EST: GGACGTTCATTT-AGATAGACCTCCTGAGAAGAAGTTTGAATGGGCTAAG AGGTTGCTGGCTAAGTATGGATCTCTAATCTCAGTGATCTCCATCATGGTEST: gi|6914631|gb|AW396153.1|AW396153
genomic: GGACGTTC-TTTCTGATAGACCTCCTGAGAAGAAGTTTGAATGGG-T-ATgtttccttat ... ttgtccacagAGGTTGCTGGCTAAGTATGGATCTCTAATCTCAGTGATCTCCATCATGGT
EST: TGAGAAGAAGTTTGAATGGGCTAAG AGGTTGCTGGCTAAGTATGGATCTCTAATCTCAGTGATCTCCATCATGGTEST: gi|6914631|gb|AW396153.1|AW396153
genomic: TGAGAAGAAGTTTGAATGGG-TAT-gtttccttat ... ttgtccacagAGGTTGCTGGCTAAGTATGGATCTCTAATCTCAGTGATCTCCATCATGGT
EST: TGAGAAGAAGTTTGAATGGGCTAAG AGGTTGCTGGCTAAGTATGGATCTCTAATCTCAGTGATCTCCATCATGGTEST: gi|17401673|gb|BM178455.1|BM178455
genomic: TGAGAAGAAGTTTGAATGGG-TAT-gtttccttat ... ttgtccacagAGGTTGCTGGCTAAGTATGGATCTCTAATCTCAGTGATCTCCATCATGGT
EST: TGAGAAGAAGTTTGAATGGGCTAAG AGGTTGCTGGCTAAGTATGGATCTCTAATCTCAGTGATCTCCATCATGGTEST: gi|17401673|gb|BM178455.1|BM178455
genomic: TGAGAAGAAGTTTGAATGGG-TAT-gtttccttat ... ttgtccacagAGGTTGCTGGCTAAGTATGGATCTCTAATCTCAGTGATCTCCATCATGGT
EST: TGAGAAGAAGTTTGAATGGGCTAAG AGGTTGCTGGCTAAGTATGGATCTCTAATCTCAGTGATCTCCATCATGGTEST: gi|37995718|gb|CF807307.1|CF807307
genomic: TGAGAAGAAGTTTGAATGGG-TAT-gtttccttat ... ttgtccacagAGGTTGCTGGCTAAGTATGGATCTCTAATCTCAGTGATCTCCATCATGGT
EST: TGAGAAGAAGTTTGAATGGGCTAAG AGGTTGCTGGCTAAGTATGGATCTCTAATCTCAGTGATCTCCATCATGGTEST: gi|37995718|gb|CF807307.1|CF807307
genomic: TGAGAAGAAGTTTGAATGGG-TAT-gtttccttat ... ttgtccacagAGGTTGCTGGCTAAGTATGGATCTCTAATCTCAGTGATCTCCATCATGGT
EST: TGAGAAGAAGTTTGAATGGGCTAAG AGGTTGCTGGCTAAGTATGGATCTCTAATCTCAGTGATCTCCATCATGGTEST: gi|12772421|gb|BG237348.1|BG237348
genomic: TGAGAAGAAGTTTGAATGGG-TAT-gtttccttat ... ttgtccacagAGGTTGCTGGCTAAGTATGGATCTCTAATCTCAGTGATCTCCATCATGGT
EST: TGAGAAGAAGTTTGAATGGGCTAAG AGGTTGCTGGCTAAGTATGGATCTCTAATCTCAGTGATCTCCATCATGGTEST: gi|12772421|gb|BG237348.1|BG237348
genomic: TGAGAAGAAGTTTGAATGGG-TAT-gtttccttat ... ttgtccacagAGGTTGCTGGCTAAGTATGGATCTCTAATCTCAGTGATCTCCATCATGGT
EST: TGAGAAGAAGTTTGAATGGGCTAAG AGGTTGCTGGCTAAGTATGGATCTCTAATCTCAGTGATCTCCATCATGGTEST: gi|19268686|gb|BM884942.1|BM884942
genomic: TGAGAAGAAGTTTGAATGGG-TAT-gtttccttat ... ttgtccacagAGGTTGCTGGCTAAGTATGGATCTCTAATCTCAGTGATCTCCATCATGGT
EST: TGAGAAGAAGTTTGAATGGGCTAAG AGGTTGCTGGCTAAGTATGGATCTCTAATCTCAGTGATCTCCATCATGGTEST: gi|19268686|gb|BM884942.1|BM884942
genomic: TGAGAAGAAGTTTGAATGGG-TAT-gtttccttat ... ttgtccacagAGGTTGCTGGCTAAGTATGGATCTCTAATCTCAGTGATCTCCATCATGGT
EST: TGAGAAGAAGTTTGAATGGGCTAAG AGGTTGCTGGCTAAGTATGGATCTCTAATCTCAGTGATCTCCATCATGGTEST: gi|31456205|gb|CD398233.1|CD398233
genomic: TGAGAAGAAGTTTGAATGGG-TAT-gtttccttat ... ttgtccacagAGGTTGCTGGCTAAGTATGGATCTCTAATCTCAGTGATCTCCATCATGGT
EST: TGGACGTTCTTTCTGATAGACCTCCTGAGAAGAAGTTTGAATGGGCTAAG AGGTTGCTGGCTAAGTATGGATCTCTAATCTCAGTGATCTCCATCATGGTEST: gi|254347231|gb|GR853480.1|GR853480
genomic: TGGACGTTCTTTCTGATAGACCTCCTGAGAAGAAGTTTGAATGGG-T-ATgtttccttat ... ttgtccacagAGGTTGCTGGCTAAGTATGGATCTCTAATCTCAGTGATCTCCATCATGGT
EST: TGAGAAGAAGTTTGAATGGGCTAAG AGGTTGCTGGCTAAGTATGGATCTCTAATCTCAGTGATCTCCATCATGGTEST: gi|254347231|gb|GR853480.1|GR853480
genomic: TGAGAAGAAGTTTGAATGGG-TAT-gtttccttat ... ttgtccacagAGGTTGCTGGCTAAGTATGGATCTCTAATCTCAGTGATCTCCATCATGGT
EST: TGAGAAGAAGTTTGAATGGGCTAAG AGGTTGCTGGCTAAGTATGGATCTCTAATCTCAGTGATCTCCATCATGGTEST: gi|23064011|gb|BU578784.1|BU578784
genomic: TGAGAAGAAGTTTGAATGGG-TAT-gtttccttat ... ttgtccacagAGGTTGCTGGCTAAGTATGGATCTCTAATCTCAGTGATCTCCATCATGGT
EST: TGAGAAGAAGTTTGAATGGGCTAAG AGGTTGCTGGCTAAGTATGGATCTCTAATCTCAGTGATCTCCATCATGGTEST: gi|23064011|gb|BU578784.1|BU578784
genomic: TGAGAAGAAGTTTGAATGGG-TAT-gtttccttat ... ttgtccacagAGGTTGCTGGCTAAGTATGGATCTCTAATCTCAGTGATCTCCATCATGGT
EST: TGAGAAGAAGTTTGAATGGGCTAAG AGGTTGCTGGCTAAGTATGGATCTCTAATCTCAGTGATCTCCATCATGGTEST: gi|31462452|gb|CD404480.1|CD404480
genomic: TGAGAAGAAGTTTGAATGGG-TAT-gtttccttat ... ttgtccacagAGGTTGCTGGCTAAGTATGGATCTCTAATCTCAGTGATCTCCATCATGGT
EST: TGGACGTTCTTTCTGATAGACCTCCTGAGAAGAAGTTTGAATGGGCTAAG AGGTTGCTGGCTAAGTATGGATCTCTAATCTCAGTGATCTCCATCATGGTEST: gi|19269510|gb|BM885766.1|BM885766
genomic: TGGACGTTCTTTCTGATAGACCTCCTGAGAAGAAGTTTGAATGGG-T-ATgtttccttat ... ttgtccacagAGGTTGCTGGCTAAGTATGGATCTCTAATCTCAGTGATCTCCATCATGGT
EST: TGAGAAGAAGTTTGAATGGGCTAAG AGGTTGCTGGCTAAGTATGGATCTCTAATCTCAGTGATCTCCATCATGGTEST: gi|19269510|gb|BM885766.1|BM885766
genomic: TGAGAAGAAGTTTGAATGGG-TAT-gtttccttat ... ttgtccacagAGGTTGCTGGCTAAGTATGGATCTCTAATCTCAGTGATCTCCATCATGGT
EST: TGAGAAGAAGTTTGAATGGGCTAAG AGGTTGCTGGCTAAGTATGGATCTCTAATCTCAGTGATCTCCATCATGGTEST: gi|254344547|gb|GR855418.1|GR855418
genomic: TGAGAAGAAGTTTGAATGGG-TAT-gtttccttat ... ttgtccacagAGGTTGCTGGCTAAGTATGGATCTCTAATCTCAGTGATCTCCATCATGGT
EST: TGGACGTTCTTTCTGATAGACCTCCTGAGAAGAAGTTTGAATGGGCTAAG AGGTTGCTGGCTAAGTATGGATCTCTAATCTCAGTGATCTCCATCATGGTEST: gi|192310732|gb|FK001156.1|FK001156
genomic: TGGACGTTCTTTCTGATAGACCTCCTGAGAAGAAGTTTGAATGGG-T-ATgtttccttat ... ttgtccacagAGGTTGCTGGCTAAGTATGGATCTCTAATCTCAGTGATCTCCATCATGGT
EST: TGAGAAGAAGTTTGAATGGGCTAAG AGGTTGCTGGCTAAGTATGGATCTCTAATCTCAGTGATCTCCATCATGGTEST: gi|192310732|gb|FK001156.1|FK001156
genomic: TGAGAAGAAGTTTGAATGGG-TAT-gtttccttat ... ttgtccacagAGGTTGCTGGCTAAGTATGGATCTCTAATCTCAGTGATCTCCATCATGGT
EST: TGAGAAGAAGTTTGAATGGGCTAAG AGGTTGCTGGCTAAGTATGGATCTCTAATCTCAGTGATCTCCATCATGGTEST: gi|192326907|gb|FK019199.1|FK019199
genomic: TGAGAAGAAGTTTGAATGGG-TAT-gtttccttat ... ttgtccacagAGGTTGCTGGCTAAGTATGGATCTCTAATCTCAGTGATCTCCATCATGGT
EST: TGAGAAGAAGTTTGAATGGGCTAAG AGGCTGCTGGCTAAGTATGGATCTCTAATCTCAGTGATCTCCATCATGGTEST: gi|192326907|gb|FK019199.1|FK019199
genomic: TGAGAAGAAGTTTGAATGGG-TAT-gtttccttat ... ttgtccacagAGGTTGCTGGCTAAGTATGGATCTCTAATCTCAGTGATCTCCATCATGGT
EST: TGAGAAGAAGTTTGAATGGGCTAAG AGGCTGCTGGCTAAGTATGGATCTCTAATCTCAGTGATCTCCATCATGGT
genomic: TGAGAAGAAGTTTGAATGGG-TAT-gtttccttat ... ttgtccacagAGGTTGCTGGCTAAGTATGGATCTCTAATCTCAGTGATCTCCATCATGGT
ctagatgtatcactgtaaagtcactaccttactgtcaaactttttttgtccacagAGGTTGCTGGCTAAGTATGGATCTCTAATCTCAGTGATCTCCATCATGGTCCTGTTCGTATACTTGGTAGCTTCACCATCAAAATCCAGTGCAAAGGGAA
accttac putative branch site (score: 3)
ctttttttgtccac putative PPT
aaacttttttt TA-rich tract
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| tgcaatcgttaataccttttcaatgatattctttgcaaccacttcctagatgtatcactgtaaagtcactaccttactgtcaaactttttttgtccacagAGGTTGCTGGCTAAGTATGGATCTCTAATCTCAGTGATCTCCATCATGGTCCTGTTCGTATACTTGGTAGCTTCACCATCAAAATCCAGTGCAAAGGGAA
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - GCAAAG