1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' | 8 5' 3' | 9 5' 3' | 10 5' 3' | 11 5' 3' | 12 5' 3' |
gtattgtttgtgttagtgttgctcgtttatcttaatgggaggtttcttttggtttagatgttttaatttttttttttttgcttgtgggttggtacagGTTCATAAGGTGCCTGCAAACGACATGGAGGCCTTGAAGTCCCCACTTATGGGGCTATTTGAAAAACGCCGGGCACGCAAGTTTTTCATTTATGTGCAAA
species | Glycine max |
transcript | GLYMA05G30140.2 |
intron # | 4 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: ATCTCTATTTCAAAGCTGTGGATGGGAGCTATGTGTTTAATAAAGGAAAG GTTCATAAGGTGCCTGCAAACGACATGGAGGCCTTGAAGTCCCCACTTATGEST: gi|192313375|gb|FK005147.1|FK005147
genomic: ATCTCTATTTCAAAGCTGTGGATGGGAGCTATGTGTTTAATAAAGGAAAGgtattgtttg ... gttggtacagGTTCATAAGGTGCCTGCAAACGACATGGAGGCCTTGAAGTCCCCACTTATG
EST: ATCTCTATTTCAAAGCTGTGGATGGGAGCTATGTGTTTAATAAAGGAAAG GTTCATAAGGTGCCTGCAAACGACATGGAGGCCTTGAAGTCCCCACTTATGEST: gi|213598704|gb|DB964270.1|DB964270
genomic: ATCTCTATTTCAAAGCTGTGGATGGGAGCTATGTGTTTAATAAAGGAAAGgtattgtttg ... gttggtacagGTTCATAAGGTGCCTGCAAACGACATGGAGGCCTTGAAGTCCCCACTTATG
EST: ATCTCTATTTCAAAGCTGTGGATGGGAGCTATGTGTTTAATAAAGGAAAG GTTCATAAGGTGCCTGCAAACGACATGGAGGCCTTGAAGTCCCCACTTATGEST: gi|17021940|gb|BM092974.1|BM092974
genomic: ATCTCTATTTCAAAGCTGTGGATGGGAGCTATGTGTTTAATAAAGGAAAGgtattgtttg ... gttggtacagGTTCATAAGGTGCCTGCAAACGACATGGAGGCCTTGAAGTCCCCACTTATG
EST: ATCTCTATTTCAAAGCTGTGGATGGGAGCTATGTGTTTAATAAAGGAAAG GTTCATAAGGTGCCTGCAAACGACATGGAGGCCTTGAAGTCCCCACTTATGEST: gi|213590255|gb|DB963832.1|DB963832
genomic: ATCTCTATTTCAAAGCTGTGGATGGGAGCTATGTGTTTAATAAAGGAAAGgtattgtttg ... gttggtacagGTTCATAAGGTGCCTGCAAACGACATGGAGGCCTTGAAGTCCCCACTTATG
EST: ATCTCTATTTCAAAGCTGTGGATGGGAGCTATGTGTTTAATAAAGGAAAG GTTCATAAGGTGCCTGCAAACGACATGGAGGCCTTGAAGTCCCCACTTATGEST: gi|192313374|gb|FK005146.1|FK005146
genomic: ATCTCTATTTCAAAGCTGTGGATGGGAGCTATGTGTTTAATAAAGGAAAGgtattgtttg ... gttggtacagGTTCATAAGGTGCCTGCAAACGACATGGAGGCCTTGAAGTCCCCACTTATG
EST: ATCTCTATTTCAAAGCTGTGGATGGGAGCTATGTGTTTAATAAAGGAAAG GTTCATAAGGTGCCTGCAAACGACATGGAGGCCTTGAAGTCCCCACTTATGEST: gi|151400876|gb|EV270690.1|EV270690
genomic: ATCTCTATTTCAAAGCTGTGGATGGGAGCTATGTGTTTAATAAAGGAAAGgtattgtttg ... gttggtacagGTTCATAAGGTGCCTGCAAACGACATGGAGGCCTTGAAGTCCCCACTTATG
EST: ATCTCTATTTCAAAGCTGTGGATGGGAGCTATGTGTTTAATAAAGGAAAG GTTCATAAGGTGCCTGCAAACGACATGGAGGCCTTGAAGTCCCCACTTATGEST: gi|209722563|gb|BW682662.1|BW682662
genomic: ATCTCTATTTCAAAGCTGTGGATGGGAGCTATGTGTTTAATAAAGGAAAGgtattgtttg ... gttggtacagGTTCATAAGGTGCCTGCAAACGACATGGAGGCCTTGAAGTCCCCACTTATG
EST: ATCTCTATTTCAAAGCTGTGGATGGGAGCTATGTGTTTAATAAAGGAAAG GTTCATAAGGTGCCTGCAAACGACATGGAGGCCTTGAAGTCCCCACTTATGEST: gi|19347279|gb|BM892159.1|BM892159
genomic: ATCTCTATTTCAAAGCTGTGGATGGGAGCTATGTGTTTAATAAAGGAAAGgtattgtttg ... gttggtacagGTTCATAAGGTGCCTGCAAACGACATGGAGGCCTTGAAGTCCCCACTTATG
EST: ATCTCTATTTCAAAGCTGTGGATGGGAGCTATGTGTTTAATAAAGGAAAG GTTCATAAGGTGCCTGCAAACGACATGGAGGCCTTGAAGTCCCCACTTATGEST: gi|7924853|gb|AW830879.1|AW830879
genomic: ATCTCTATTTCAAAGCTGTGGATGGGAGCTATGTGTTTAATAAAGGAAAGgtattgtttg ... gttggtacagGTTCATAAGGTGCCTGCAAACGACATGGAGGCCTTGAAGTCCCCACTTATG
EST: ATCTCTATTTCAAAGCTGTGGATGGGAGCTATGTGTTTAATAAAGGAAAG GTTCATAAGGTGCCTGCAAACGACATGGAGGCCTTGAAGTCCCCACTTATGEST: gi|213603679|gb|DB966807.1|DB966807
genomic: ATCTCTATTTCAAAGCTGTGGATGGGAGCTATGTGTTTAATAAAGGAAAGgtattgtttg ... gttggtacagGTTCATAAGGTGCCTGCAAACGACATGGAGGCCTTGAAGTCCCCACTTATG
EST: ATCTCTATTTCAAAGCTGTGGATGGGAGCTATGTGTTTAATAAAGGAAAG GTTCATAAGGTGCCTGCAAACGACATGGAGGCCTTGAAGTCCCCACTTATGEST: gi|207770456|gb|GD744170.1|GD744170
genomic: ATCTCTATTTCAAAGCTGTGGATGGGAGCTATGTGTTTAATAAAGGAAAGgtattgtttg ... gttggtacagGTTCATAAGGTGCCTGCAAACGACATGGAGGCCTTGAAGTCCCCACTTATG
EST: ATCTCTATTTCAAAGCTGTGGATGGGAGCTATGTGTTTAATAAAGGAAAG GTTCATAAGGTGCCTGCAAACGACATGGAGGCCTTGAAGTCCCCACTTATGEST: gi|254342789|gb|GR858951.1|GR858951
genomic: ATCTCTATTTCAAAGCTGTGGATGGGAGCTATGTGTTTAATAAAGGAAAGgtattgtttg ... gttggtacagGTTCATAAGGTGCCTGCAAACGACATGGAGGCCTTGAAGTCCCCACTTATG
EST: ATCTCTATTTCAAAGCTGTGGATGGGAGCTATGTGTTTAATAAAGGAAAG GTTCATAAGGTGCCTGCAAACGACATGGAGGCCTTGAAGTCCCCACTTATGEST: gi|151400851|gb|EV270665.1|EV270665
genomic: ATCTCTATTTCAAAGCTGTGGATGGGAGCTATGTGTTTAATAAAGGAAAGgtattgtttg ... gttggtacagGTTCATAAGGTGCCTGCAAACGACATGGAGGCCTTGAAGTCCCCACTTATG
EST: ATCTCTATTTCAAAGCTGTGGATGGGAGCTATGTGTTTAATAAAGGAAAG ATTCATAAAGTGCCTGCAAACGACATGGAGGCCTTGAAGTCCCCACTTATGEST: gi|213595671|gb|DB972141.1|DB972141
genomic: ATCTCTATTTCAAAGCTGTGGATGGGAGCTATGTGTTTAATAAAGGAAAGgtattgtttg ... gttggtacagGTTCATAAGGTGCCTGCAAACGACATGGAGGCCTTGAAGTCCCCACTTATG
EST: ATCTCTATTTCAAAGCTGTGGATGGGAGCTATGTGTTTAATAAAGGAAAG GTTCATAAGGTGCCTGCAAACGACATGGAGGCCTTGAAGTCCCCACTTATG
genomic: ATCTCTATTTCAAAGCTGTGGATGGGAGCTATGTGTTTAATAAAGGAAAGgtattgtttg ... gttggtacagGTTCATAAGGTGCCTGCAAACGACATGGAGGCCTTGAAGTCCCCACTTATG
tttcttttggtttagatgttttaatttttttttttttgcttgtgggttggtacagGTTCATAAGGTGCCTGCAAACGACATGGAGGCCTTGAAGTCCCCACTTATGGGGCTATTTGAAAAACGCCGGGCACGCAAGTTTTTCATTTATGTGCAAA
ttttaat putative branch site (score: 3)
tttggtttagatgttt TA-rich tract