1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' |
...cattgatccatcttaaagttactctcggtagctttaacattagcgagtgttacacgtgctaactagttgctatacttattttgttctgtttgttttgcagGTCCTGACAGAAGGATCTTCTTGCCTGAGGGTCTCTTGGACCGATCTGAGATCCCAGAGTACTTGACCGGAGAAGTCCCCGGAGA
species | Glycine max |
transcript | GLYMA16G33030.1 |
intron # | 1 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: NNNNGCTGCAGCTGCTGCTCCTGCCAATGATGAGCTTGCCAAGTGGTATG GTCCTGACAGAAGGATCTTCTTGCCTGAGGGTCTCTTGGACCGATCTGAGAEST: gi|23063929|gb|BU578703.1|BU578703
genomic: AAAAGCTGCAGCTGCTGCTCCTGCCAATGATGAGCTTGCCAAGTGGTATGgtaagtcccc ... tgttttgcagGTCCTGACAGAAGGATCTTCTTGCCTGAGGGTCTCTTGGACCGATCTGAGA
EST: AAAAGCTGCAGCTGCTGCTCCTGCCAATGATGAGCTTGCCAAGTGGTATG GTCCTGACAGAAGGATCTTCTTGCCTGAGGGTCTCTTGGACCGATCTGAGAEST: gi|8670480|gb|BE191587.1|BE191587
genomic: AAAAGCTGCAGCTGCTGCTCCTGCCAATGATGAGCTTGCCAAGTGGTATGgtaagtcccc ... tgttttgcagGTCCTGACAGAAGGATCTTCTTGCCTGAGGGTCTCTTGGACCGATCTGAGA
EST: NNNNGCTGCAGCTGCTGCTCCTGCCAATGATGAGCTTGCCAAGTGGTATG GTCCTGACAGAAGGATCTTCTTGCCTGAGGGTCTCTTGGACCGATCTGAGAEST: gi|209725349|gb|BW658247.1|BW658247
genomic: AAAAGCTGCAGCTGCTGCTCCTGCCAATGATGAGCTTGCCAAGTGGTATGgtaagtcccc ... tgttttgcagGTCCTGACAGAAGGATCTTCTTGCCTGAGGGTCTCTTGGACCGATCTGAGA
EST: CTGCCAATGATGAGCTTGCCAAGTGGTATG GTCCTGACAGAAGGATCTTCTTGCCTGAGGGTCTCTTGGACCGATCTGAGAEST: gi|209721017|gb|BW682496.1|BW682496
genomic: CTGCCAATGATGAGCTTGCCAAGTGGTATGgtaagtcccc ... tgttttgcagGTCCTGACAGAAGGATCTTCTTGCCTGAGGGTCTCTTGGACCGATCTGAGA
EST: NNNNGCTGCAGCTGCTGCTCCTGCCAATGATGAGCTTGCCAAGTGGTATG GTCCTGACAGAAGGATCTTCTTGCCTGAGGGTCTCTTGGACCGATCTGAGAEST: gi|15285587|gb|BI469478.1|BI469478
genomic: AAAAGCTGCAGCTGCTGCTCCTGCCAATGATGAGCTTGCCAAGTGGTATGgtaagtcccc ... tgttttgcagGTCCTGACAGAAGGATCTTCTTGCCTGAGGGTCTCTTGGACCGATCTGAGA
EST: NNNNGCTGCAGCTGCTGCTCCTGCCAATGATGAGCTTGCCAAGTGGTATG GTCCTGACAGAAGGATCTTCTTGCCTGAGGGTCTCTTGGACCGATCTGAGAEST: gi|20448919|gb|BQ253043.1|BQ253043
genomic: AAAAGCTGCAGCTGCTGCTCCTGCCAATGATGAGCTTGCCAAGTGGTATGgtaagtcccc ... tgttttgcagGTCCTGACAGAAGGATCTTCTTGCCTGAGGGTCTCTTGGACCGATCTGAGA
EST: NNNNGCTGCAGCTGCTGCTCCTGCCAATGATGAGCTTGCCAAGTGGTATG GTCCTGACAGAAGGATCTTCTTGCCTGAGGGTCTCTTGGACCGATCTGAGAEST: gi|209716659|gb|BW682220.1|BW682220
genomic: AAAAGCTGCAGCTGCTGCTCCTGCCAATGATGAGCTTGCCAAGTGGTATGgtaagtcccc ... tgttttgcagGTCCTGACAGAAGGATCTTCTTGCCTGAGGGTCTCTTGGACCGATCTGAGA
EST: NNNNGCTGCAGCTGCTGCTCCTGCCAATGATGAGCTTGCCAAGTGGTATG GTCCTGACAGAAGGATCTTCTTGCCTGAGGGTCTCTTGGACCGATCTGAGAEST: gi|20448722|gb|BQ252846.1|BQ252846
genomic: AAAAGCTGCAGCTGCTGCTCCTGCCAATGATGAGCTTGCCAAGTGGTATGgtaagtcccc ... tgttttgcagGTCCTGACAGAAGGATCTTCTTGCCTGAGGGTCTCTTGGACCGATCTGAGA
EST: NNNNGCTGCAGCTGCTGCTCCTGCCAATGATGAGCTTGCCAAGTGGTATG GTCCTGACAGAAGGATCTTCTTGCCTGAGGGTCTCTTGGACCGATCTGAGAEST: gi|120530661|gb|EH258794.1|EH258794
genomic: AAAAGCTGCAGCTGCTGCTCCTGCCAATGATGAGCTTGCCAAGTGGTATGgtaagtcccc ... tgttttgcagGTCCTGACAGAAGGATCTTCTTGCCTGAGGGTCTCTTGGACCGATCTGAGA
EST: NNNNGCTGCAGCTGCTGCTCCTGCCAATGATGAGCTTGCCAAGTGGTATG GTCCTGACAGAAGGATCTTCTTGCCTGAGGGTCTCTTGGACCGATCTGAGAEST: gi|26057166|gb|CA800080.1|CA800080
genomic: AAAAGCTGCAGCTGCTGCTCCTGCCAATGATGAGCTTGCCAAGTGGTATGgtaagtcccc ... tgttttgcagGTCCTGACAGAAGGATCTTCTTGCCTGAGGGTCTCTTGGACCGATCTGAGA
EST: NNNNGCTGCAGCTGCTGCTCCTGCCAATGATGAGCTTGCCAAGTGGTATG GTCCTGACAGAAGGATCTTCTTGCCTGAGGGTCTCTTGGACCGATCTGAGAEST: gi|21676857|gb|BQ629208.1|BQ629208
genomic: AAAAGCTGCAGCTGCTGCTCCTGCCAATGATGAGCTTGCCAAGTGGTATGgtaagtcccc ... tgttttgcagGTCCTGACAGAAGGATCTTCTTGCCTGAGGGTCTCTTGGACCGATCTGAGA
EST: NNNNGCTGCAGCTGCTGCTCCTGCCAATGATGAGCTTGCCAAGTGGTATG GTCCTGACAGAAGGATCTTCTTGCCTGAGGGTCTCTTGGACCGATCTGAGAEST: gi|192309277|gb|FG999476.1|FG999476
genomic: AAAAGCTGCAGCTGCTGCTCCTGCCAATGATGAGCTTGCCAAGTGGTATGgtaagtcccc ... tgttttgcagGTCCTGACAGAAGGATCTTCTTGCCTGAGGGTCTCTTGGACCGATCTGAGA
EST: NNNNGCTGCAGCTGCTGCTCCTGCCAATGATGAGCTTGCCAAGTGGTATG GTCCTGACAGAAGGATCTTCTTGCCTGAGGGTCTCTTGGACCGATCTGAGAEST: gi|23058509|gb|BU578319.1|BU578319
genomic: AAAAGCTGCAGCTGCTGCTCCTGCCAATGATGAGCTTGCCAAGTGGTATGgtaagtcccc ... tgttttgcagGTCCTGACAGAAGGATCTTCTTGCCTGAGGGTCTCTTGGACCGATCTGAGA
EST: NNNNGCTGCAGCTGCTGCTCCTGCCAATGATGAGCTTGCCAAGTGGTATG GTCCTGACAGAAGGATCTTCTTGCCTGAGGGTCTCTTGGACCGATCTGAGAEST: gi|209710533|gb|BW662069.1|BW662069
genomic: AAAAGCTGCAGCTGCTGCTCCTGCCAATGATGAGCTTGCCAAGTGGTATGgtaagtcccc ... tgttttgcagGTCCTGACAGAAGGATCTTCTTGCCTGAGGGTCTCTTGGACCGATCTGAGA
EST: NNNNGCTGCAGCTGCTGCTCCTGCCAATGATGAGCTTGCCAAGTGGTATG GTCCTGACAGAAGGATCTTCTTGCCTGAGGGTCTCTTGGACCGATCTGAGAEST: gi|213593074|gb|DB969872.1|DB969872
genomic: AAAAGCTGCAGCTGCTGCTCCTGCCAATGATGAGCTTGCCAAGTGGTATGgtaagtcccc ... tgttttgcagGTCCTGACAGAAGGATCTTCTTGCCTGAGGGTCTCTTGGACCGATCTGAGA
EST: NNNNGCTGCAGCTGCTGCTCCTGCCAATTATGAGCTTGCCAAGTGGTATG GTCCTGACAGAAGGATCTTCTTGCCTGAGGGTCTCTTGGACCGATCTGAGAEST: gi|31561938|gb|CD487776.1|CD487776
genomic: AAAAGCTGCAGCTGCTGCTCCTGCCAATGATGAGCTTGCCAAGTGGTATGgtaagtcccc ... tgttttgcagGTCCTGACAGAAGGATCTTCTTGCCTGAGGGTCTCTTGGACCGATCTGAGA
EST: NNNNGCTGCAGCTGCTGCTCCTGCCAATGATGAGCTTGCCAAGTGGTATG GTCCTGACAGAAGGATCTTCTTGCCTGAGGGTCTCTTGGACCGATCTGAGAEST: gi|20448780|gb|BQ252904.1|BQ252904
genomic: AAAAGCTGCAGCTGCTGCTCCTGCCAATGATGAGCTTGCCAAGTGGTATGgtaagtcccc ... tgttttgcagGTCCTGACAGAAGGATCTTCTTGCCTGAGGGTCTCTTGGACCGATCTGAGA
EST: NNNNGCTGCAGCTGCTGCTCCTGCCAATGATGAGCTTGCCAAGTGGTATG GTCCTGACAGAAGGATCTTCTTGCCTGAGGGTCTCTTGGACCGATCTGAGAEST: gi|27424688|gb|CA936208.1|CA936208
genomic: AAAAGCTGCAGCTGCTGCTCCTGCCAATGATGAGCTTGCCAAGTGGTATGgtaagtcccc ... tgttttgcagGTCCTGACAGAAGGATCTTCTTGCCTGAGGGTCTCTTGGACCGATCTGAGA
EST: NNNNGCTGCAGCTGCTGCTCCTGCCAATGATGAGCTTGCCAAGTGGTATG GTCCTGACAGAAGGATCTTCTTGCCTGAGGGTCTCTTGGACCGATCTGAGAEST: gi|209706244|gb|BW680659.1|BW680659
genomic: AAAAGCTGCAGCTGCTGCTCCTGCCAATGATGAGCTTGCCAAGTGGTATGgtaagtcccc ... tgttttgcagGTCCTGACAGAAGGATCTTCTTGCCTGAGGGTCTCTTGGACCGATCTGAGA
EST: NNNNGCTGCAGCTGCTACTCCTGCCAATGATGAGCTTGCCAAGTGGTATG GTCCTGACAGAAGGATCTTCTTGCCTGAGGGTCTCTTGGACCGATCTGAGAEST: gi|209698465|gb|BW667262.1|BW667262
genomic: AAAAGCTGCAGCTGCTGCTCCTGCCAATGATGAGCTTGCCAAGTGGTATGgtaagtcccc ... tgttttgcagGTCCTGACAGAAGGATCTTCTTGCCTGAGGGTCTCTTGGACCGATCTGAGA
EST: NNNNGCTGCAGCTGCTGCTCCTGCCAATGATGAGCTTGCCAAGTGGTATG GTCCTGACAGAAGGATCTTCTTGCCTGAGGGTCTCTTGGACCGATCTGAGAEST: gi|209720872|gb|BW662598.1|BW662598
genomic: AAAAGCTGCAGCTGCTGCTCCTGCCAATGATGAGCTTGCCAAGTGGTATGgtaagtcccc ... tgttttgcagGTCCTGACAGAAGGATCTTCTTGCCTGAGGGTCTCTTGGACCGATCTGAGA
EST: NNNNGCTGCAGCTGCTGCTCCTGCCAATGATGAGCTTGCCAAGTGGTATG GTCCTGACAGAAGGATCTTCTTGCCTGAGGGTCTCTTGGACCGATCTGAGAEST: gi|151412521|gb|EV282333.1|EV282333
genomic: AAAAGCTGCAGCTGCTGCTCCTGCCAATGATGAGCTTGCCAAGTGGTATGgtaagtcccc ... tgttttgcagGTCCTGACAGAAGGATCTTCTTGCCTGAGGGTCTCTTGGACCGATCTGAGA
EST: NNNNGCTGCAGCTGCTGCTCCTGCCAATGATGAGCTTGCCAAGTGGTATG GTCCTGACAGAAGGATCTTCTTGCCTGAGGGTCTCTTGGACCGATCTGAGAEST: gi|19936492|gb|BQ080889.1|BQ080889
genomic: AAAAGCTGCAGCTGCTGCTCCTGCCAATGATGAGCTTGCCAAGTGGTATGgtaagtcccc ... tgttttgcagGTCCTGACAGAAGGATCTTCTTGCCTGAGGGTCTCTTGGACCGATCTGAGA
EST: NNNTTCTGCAGCTGCTGCTCCTGCCAATGATGAGCTTGCCAAGTGGTATG GTCCTGACAGAAGGATCTTCTTGCCTGAGGGTCTCTTGGACCGATCTGAGAEST: gi|19453008|gb|BM954418.1|BM954418
genomic: AAAAGCTGCAGCTGCTGCTCCTGCCAATGATGAGCTTGCCAAGTGGTATGgtaagtcccc ... tgttttgcagGTCCTGACAGAAGGATCTTCTTGCCTGAGGGTCTCTTGGACCGATCTGAGA
EST: NNNNGCTGCAGCTGCTGCTCCTGCCAATGATGAGCTTGCCAAGTGGTATG GTCCTGACAGAAGGATCTTCTTGCCTGAGGGTCTCTTGGACCGATCTGAGAEST: gi|20076089|gb|BQ094872.1|BQ094872
genomic: AAAAGCTGCAGCTGCTGCTCCTGCCAATGATGAGCTTGCCAAGTGGTATGgtaagtcccc ... tgttttgcagGTCCTGACAGAAGGATCTTCTTGCCTGAGGGTCTCTTGGACCGATCTGAGA
EST: NNNNGCTGCAGCTGCTGCTCCTGCCAATGATGAGCTTGCCAAGTGGTATG GTCCTGACAGAAGGATCTTCTTGCCTGAGGGTCTCTTGGACCGATCTGAGAEST: gi|15337851|gb|BI498507.1|BI498507
genomic: AAAAGCTGCAGCTGCTGCTCCTGCCAATGATGAGCTTGCCAAGTGGTATGgtaagtcccc ... tgttttgcagGTCCTGACAGAAGGATCTTCTTGCCTGAGGGTCTCTTGGACCGATCTGAGA
EST: NNNNGCTGCAGCTGCTGCTCCTGCCAATGATGAGCTTGCCAAGTGGTATG GTCCTGACAGAAGGATCTTCTTGCCTGAGGGTCTCTTGGACCGATCTGAGAEST: gi|15200139|gb|BI424193.1|BI424193
genomic: AAAAGCTGCAGCTGCTGCTCCTGCCAATGATGAGCTTGCCAAGTGGTATGgtaagtcccc ... tgttttgcagGTCCTGACAGAAGGATCTTCTTGCCTGAGGGTCTCTTGGACCGATCTGAGA
EST: TGCCAAGTGGTATG GTCCTGACAGAAGGATCTTCTTGCCTGAGGGTCTCTTGGACCGATCTGAGAEST: gi|209718591|gb|BW662696.1|BW662696
genomic: TGCCAAGTGGTATGgtaagtcccc ... tgttttgcagGTCCTGACAGAAGGATCTTCTTGCCTGAGGGTCTCTTGGACCGATCTGAGA
EST: NNNNGCTGCAGCTGCTGCTCCTGCCAATGATGAGCTTGCCAAGTGGTATG GTCCTGACAGAAGGATCTTCTTGCCTGAGGGTCTCTTGGACCGATCTGAGAEST: gi|23728211|gb|BU762151.1|BU762151
genomic: AAAAGCTGCAGCTGCTGCTCCTGCCAATGATGAGCTTGCCAAGTGGTATGgtaagtcccc ... tgttttgcagGTCCTGACAGAAGGATCTTCTTGCCTGAGGGTCTCTTGGACCGATCTGAGA
EST: TGCCAAGTGGTATG GTCCTGACAGAAGGATCTTCTTGCCTGAGGGTCTCTTGGACCGATCTGAGAEST: gi|213591516|gb|DB959946.1|DB959946
genomic: TGCCAAGTGGTATGgtaagtcccc ... tgttttgcagGTCCTGACAGAAGGATCTTCTTGCCTGAGGGTCTCTTGGACCGATCTGAGA
EST: NNNNGCTGCAGCTGCTGCTCCTGCCAATGATGAGCTTGCCAAGTGGTATG GTCCTGACAGAAGGATCTTCTTGCCTGAGGGTCTCTTGGACCGATCTGAGAEST: gi|23050476|gb|BU577005.1|BU577005
genomic: AAAAGCTGCAGCTGCTGCTCCTGCCAATGATGAGCTTGCCAAGTGGTATGgtaagtcccc ... tgttttgcagGTCCTGACAGAAGGATCTTCTTGCCTGAGGGTCTCTTGGACCGATCTGAGA
EST: NNNNGCTGCAGCTGCTGCTCCTGCCAATGATGAGCTTGCCAAGTGGTATG GTCCTGACAGAAGGATCTTCTTGCCTGAGGGTCTCTTGGACCGATCTGAGAEST: gi|213607347|gb|DB957155.1|DB957155
genomic: AAAAGCTGCAGCTGCTGCTCCTGCCAATGATGAGCTTGCCAAGTGGTATGgtaagtcccc ... tgttttgcagGTCCTGACAGAAGGATCTTCTTGCCTGAGGGTCTCTTGGACCGATCTGAGA
EST: NNNNGCTGCAGCTGCTGCTCCTGCCAATGATGAGCTTGCCAAGTGGTATG GTCCTGACAGAAGGATCTTCTTGCCTGAGGGTCTCTTGGACCGATCTGAGAEST: gi|120534112|gb|EH262245.1|EH262245
genomic: AAAAGCTGCAGCTGCTGCTCCTGCCAATGATGAGCTTGCCAAGTGGTATGgtaagtcccc ... tgttttgcagGTCCTGACAGAAGGATCTTCTTGCCTGAGGGTCTCTTGGACCGATCTGAGA
EST: NNNNGCTGCAGCTGCTGCTCCTGCCAATGATGAGCTTGCCAAGTGGTATG GTCCTGACAGAAGGATCTTCTTGCCTGAGGGTCTCTTGGTCCGATCTGAGAEST: gi|213594884|gb|DB971771.1|DB971771
genomic: AAAAGCTGCAGCTGCTGCTCCTGCCAATGATGAGCTTGCCAAGTGGTATGgtaagtcccc ... tgttttgcagGTCCTGACAGAAGGATCTTCTTGCCTGAGGGTCTCTTGGACCGATCTGAGA
EST: NNNNGCTGCAGCTGCTGCTCCTGCCAATGATGAGCTTGCCAAGTGGTATG GTCCTGACAGAAGGATCTTCTTGCCTGAGGGTCTCTTGGACCGATCTGAGAEST: gi|120531346|gb|EH259479.1|EH259479
genomic: AAAAGCTGCAGCTGCTGCTCCTGCCAATGATGAGCTTGCCAAGTGGTATGgtaagtcccc ... tgttttgcagGTCCTGACAGAAGGATCTTCTTGCCTGAGGGTCTCTTGGACCGATCTGAGA
EST: NNNNGCTGCAGCTGCTGCTCCTGCCAATGATGAGCTTGCCAAGTGGTATG GTCCTGACAGAAGGATCTTCTTGCCTGAGGGTCTCTTGGACCGATCTGAGAEST: gi|213591356|gb|DB973817.1|DB973817
genomic: AAAAGCTGCAGCTGCTGCTCCTGCCAATGATGAGCTTGCCAAGTGGTATGgtaagtcccc ... tgttttgcagGTCCTGACAGAAGGATCTTCTTGCCTGAGGGTCTCTTGGACCGATCTGAGA
EST: NNNNGCTGCAGCTGCTGCTCCTGCCAATGATGAGCTTGCCAAGTGGTATG GTCCTGACAGAAGGATCTTCTTGCCTGAGGGTCTCTTGGACCGATCTGAGAEST: gi|209722542|gb|BW682640.1|BW682640
genomic: AAAAGCTGCAGCTGCTGCTCCTGCCAATGATGAGCTTGCCAAGTGGTATGgtaagtcccc ... tgttttgcagGTCCTGACAGAAGGATCTTCTTGCCTGAGGGTCTCTTGGACCGATCTGAGA
EST: NNNNGCTGCAGCTGCTGCTCCTGCCAATGATGAGCTTGCCAAGTGGTATG GTCCTGACAGAAGGATCTTCTTGCCTGAGGGTCTCTTGGACCGATCTGAGAEST: gi|213610458|gb|DB958777.1|DB958777
genomic: AAAAGCTGCAGCTGCTGCTCCTGCCAATGATGAGCTTGCCAAGTGGTATGgtaagtcccc ... tgttttgcagGTCCTGACAGAAGGATCTTCTTGCCTGAGGGTCTCTTGGACCGATCTGAGA
EST: NNNNGCTGCAGCTGCTGCTCCTGCCAATGATGAGCTTGCCAAGTGGTATG GTCCTGACAGAAGGATCTTCTTGCCTGAGGGTCTCTTGGACCGATCTGAGAEST: gi|209705308|gb|BW667979.1|BW667979
genomic: AAAAGCTGCAGCTGCTGCTCCTGCCAATGATGAGCTTGCCAAGTGGTATGgtaagtcccc ... tgttttgcagGTCCTGACAGAAGGATCTTCTTGCCTGAGGGTCTCTTGGACCGATCTGAGA
EST: NNNNGCTGCAGCTGCTGCTCCTGCCAATGATGAGCTTGCCAAGTGGTATG GTCCTGACAGAAGGATCTTCTTGCCTGAGGGTCTCTTGGACCGATCTGAGAEST: gi|298193915|gb|HO040563.1|HO040563
genomic: AAAAGCTGCAGCTGCTGCTCCTGCCAATGATGAGCTTGCCAAGTGGTATGgtaagtcccc ... tgttttgcagGTCCTGACAGAAGGATCTTCTTGCCTGAGGGTCTCTTGGACCGATCTGAGA
EST: NNNNGCTGCAGCTGCTGCTCCTGCCAATGATGAGCTTGCCAAGTGGTATG GTCCTGACAGAAGGATCTTCTTGCCTGAGGGTCTCTTGGACCGATCTGAGAEST: gi|120530617|gb|EH258750.1|EH258750
genomic: AAAAGCTGCAGCTGCTGCTCCTGCCAATGATGAGCTTGCCAAGTGGTATGgtaagtcccc ... tgttttgcagGTCCTGACAGAAGGATCTTCTTGCCTGAGGGTCTCTTGGACCGATCTGAGA
EST: NNNNGCTGCAGCTGCTGCTCCTGCCAATGATGAGCTTGCCAAGTGGTATG GTCCTGACAGAAGGATCTTCTTGCCTGAGGGTCTCTTGGACCGATCTGAGAEST: gi|209725348|gb|BW658246.1|BW658246
genomic: AAAAGCTGCAGCTGCTGCTCCTGCCAATGATGAGCTTGCCAAGTGGTATGgtaagtcccc ... tgttttgcagGTCCTGACAGAAGGATCTTCTTGCCTGAGGGTCTCTTGGACCGATCTGAGA
EST: NNNNGCTGCAGCTGCTGCTCCTGCCAATGATGAGCTTGCCAAGTGGTATG GTCCTGACAGAAGGATCTTCTTGCCTGAGGGTCTCTTGGACCGATCTGAGAEST: gi|213596464|gb|DB960281.1|DB960281
genomic: AAAAGCTGCAGCTGCTGCTCCTGCCAATGATGAGCTTGCCAAGTGGTATGgtaagtcccc ... tgttttgcagGTCCTGACAGAAGGATCTTCTTGCCTGAGGGTCTCTTGGACCGATCTGAGA
EST: NNNNGCTGCAGCTGCTGCTCCTGCCAATGATGAGCTTGCCAAGTGGTATG GTCCTGACAGAAGGATCTTCTTGCCTGAGGGTCTCTTGGACCGATCTGAGAEST: gi|15204669|gb|BI427437.1|BI427437
genomic: AAAAGCTGCAGCTGCTGCTCCTGCCAATGATGAGCTTGCCAAGTGGTATGgtaagtcccc ... tgttttgcagGTCCTGACAGAAGGATCTTCTTGCCTGAGGGTCTCTTGGACCGATCTGAGA
EST: NNNNGCTGCAGCTGCTGCTCCTGCCAATGATGAGCTTGCCAAGTGGTATG GTCCTGACAGAAGGATCTTCTTGCCTGAGGGTCTCTTGGACCGATCTGAGA
genomic: AAAAGCTGCAGCTGCTGCTCCTGCCAATGATGAGCTTGCCAAGTGGTATGgtaagtcccc ... tgttttgcagGTCCTGACAGAAGGATCTTCTTGCCTGAGGGTCTCTTGGACCGATCTGAGA
agtgttacacgtgctaactagttgctatacttattttgttctgtttgttttgcagGTCCTGACAGAAGGATCTTCTTGCCTGAGGGTCTCTTGGACCGATCTGAGATCCCAGAGTACTTGACCGGAGAAGTCCCCGGAGA
tgctaac putative branch site (score: 1)
ttctgttt putative PPT
tatacttattttgtt TA-rich tract
atgc | intron | ATGC | exonic elements by Pertea et al. |
ATGC | exon | atgc | putative intronic elements |
ATGC | putative exonic elements identified for retained introns |
10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 ---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------|---------| cattgatccatcttaaagttactctcggtagctttaacattagcgagtgttacacgtgctaactagttgctatacttattttgttctgtttgttttgcagGTCCTGACAGAAGGATCTTCTTGCCTGAGGGTCTCTTGGACCGATCTGAGATCCCAGAGTACTTGACCGGAGAAGTCCCCGGAGA
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - GAGATC
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - GGAGAA
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - AGAAGT
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - gcgagtg
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -ttacacg
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - tgctaac
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -gttgcta