1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' | 7 5' 3' |
gtatgtttcactaagatcttctttctctatatctttttatttctttctaattgtggaaatgttgattgtaaatctggacttttcagttgtccagattaaaaatgaggctccttaatgctggttgtggtctcacttctgcatggagattgtgtgattttcaaaagctgacatgagtattaccttctcatcttatgcagATCTCTATCAAAAACAATTCACTGGTCCTTTCTAATGTCTGTTTTCACG
species | Arabidopsis thaliana |
transcript | AT1G16040.1 |
intron # | 4 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: CTTATAAATGCTTTGGGAGCTGTTTCTTTGGGTGCACCTATTGGAATGCA ATCTCTATCAAAAACAATTCACTGGTCCTTTCTAATGTCTGTTTTCACGEST: gi|164140841|gb|ES121203.1|ES121203
genomic: CTTATAAATGCTTTGGGAGCTGTTTCTTTGGGTGCACCTATTGGAATGCAgtatgtttca ... tcttatgcagATCTCTATCAAAAACAATTCACTGGTCCTTTCTAATGTCTGTTTTCACG
EST: CTTATAAATGCTTTGGGAGCTGTTTCTTTGGGTGCACCTATTGGAATGCA ATCTCTATCAA
genomic: CTTATAAATGCTTTGGGAGCTGTTTCTTTGGGTGCACCTATTGGAATGCAgtatgtttca ... tcttatgcagATCTCTATCAA
gagattgtgtgattttcaaaagctgacatgagtattaccttctcatcttatgcagATCTCTATCAAAAACAATTCACTGGTCCTTTCTAATGTCTGTTTTCACG
agctgac putative branch site (score: 3)
ttaccttctcatctt putative PPT
attttcaaaa TA-rich tract