1 5' 3' | 2 5' 3' | 3 5' 3' | 4 5' 3' | 5 5' 3' | 6 5' 3' |
gtagtaaaacattttcttctcttgattcttgatttcgttagacgagttagttaattttggttgtgtgttctgtttctgcagGCTGTTTATGTGCTTTTCAGGGATGATCATACCATGAAACTACCTCATTTTATAGCCATTGCTGGTTTGATTTGTGCGATTTTCGCTATTGGGATTCCTC
species | Arabidopsis thaliana |
transcript | AT2G39890.1 |
intron # | 3 |
splice site | 3' |
intron type | U2 |
EST: TTTTCATGATTAATTGTGGATTCATTATCCTAGCTGGTTCCGCCTTAAAG GCTGTTTATGTGCTTTTCAGGGATGATCATACCATGAAACTACCTCATTTTEST: gi|116479428|gb|EG522020.1|EG522020
genomic: TTTTCATGATTAATTGTGGATTCATTATCCTAGCTGGTTCCGCCTTAAAGgtagtaaaac ... gtttctgcagGCTGTTTATGTGCTTTTCAGGGATGATCATACCATGAAACTACCTCATTTT
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tcttgatttcgttagacgagttagttaattttggttgtgtgttctgtttctgcagGCTGTTTATGTGCTTTTCAGGGATGATCATACCATGAAACTACCTCATTTTATAGCCATTGCTGGTTTGATTTGTGCGATTTTCGCTATTGGGATTCCTC
agttaat putative branch site (score: 4)
ttctgtttct putative PPT
agttagttaatttt TA-rich tract